Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSHL1Q14406 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSHL1Q14406 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSHL1Q14406 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms