Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE1CQ14123 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDE1CQ14123 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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