Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
SHROOM2Q13796 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SHROOM2Q13796 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SHROOM2Q13796 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SHROOM2Q13796 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
SHROOM2Q13796 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
SHROOM2Q13796 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SHROOM2Q13796 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SHROOM2Q13796 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SHROOM2Q13796 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SHROOM2Q13796 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SHROOM2Q13796 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SHROOM2Q13796 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
SHROOM2Q13796 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SHROOM2Q13796 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
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