Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMQ13315 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMQ13315 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMQ13315 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMQ13315 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMQ13315 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMQ13315 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMQ13315 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMQ13315 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMQ13315 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMQ13315 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMQ13315 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMQ13315 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATMQ13315 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATMQ13315 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATMQ13315 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMQ13315 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMQ13315 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMQ13315 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMQ13315 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMQ13315 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMQ13315 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMQ13315 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMQ13315 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMQ13315 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMQ13315 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMQ13315 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMQ13315 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMQ13315 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMQ13315 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMQ13315 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMQ13315 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMQ13315 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMQ13315 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMQ13315 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMQ13315 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMQ13315 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATMQ13315 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMQ13315 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMQ13315 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMQ13315 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMQ13315 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMQ13315 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMQ13315 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMQ13315 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMQ13315 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMQ13315 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMQ13315 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATMQ13315 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATMQ13315 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMQ13315 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMQ13315 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMQ13315 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMQ13315 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMQ13315 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMQ13315 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMQ13315 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMQ13315 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMQ13315 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMQ13315 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMQ13315 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMQ13315 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMQ13315 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMQ13315 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMQ13315 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMQ13315 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMQ13315 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMQ13315 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMQ13315 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMQ13315 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMQ13315 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMQ13315 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMQ13315 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMQ13315 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMQ13315 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMQ13315 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMQ13315 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMQ13315 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMQ13315 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATMQ13315 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATMQ13315 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATMQ13315 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATMQ13315 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATMQ13315 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATMQ13315 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMQ13315 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMQ13315 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMQ13315 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMQ13315 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMQ13315 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMQ13315 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMQ13315 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMQ13315 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMQ13315 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMQ13315 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMQ13315 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMQ13315 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMQ13315 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMQ13315 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMQ13315 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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