Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 VPS65YLR322W 315 nt7.15□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 PDC5YLR134W 1692 nt7.15□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 BEM1YBR200W 1656 nt7.15□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 SGF73YGL066W 1974 nt7.15□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 AFG2YLR397C 2343 nt7.15□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 GGC1YDL198C 903 nt7.14□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 OPI1YHL020C 1215 nt7.14□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 SNF7YLR025W 723 nt7.14□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 YOR268CYOR268C 399 nt7.14□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 MSI1YBR195C 1269 nt7.14□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 CTF3YLR381W 2202 nt7.13□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 MAS2YHR024C 1449 nt7.12□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 RUP1YOR138C 2016 nt7.12□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 NMA2YGR010W 1188 nt7.12□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 YAH1YPL252C 519 nt7.12□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 RTC2YBR147W 891 nt7.12□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 HRB1YNL004W 1365 nt7.11□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 SKP1YDR328C 585 nt7.1□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 PRY2YKR013W 990 nt7.1□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 CDC3YLR314C 1563 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 DOC1YGL240W 753 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 SNA3YJL151C 402 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 YPL264CYPL264C 1062 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 TOP3YLR234W 1971 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 BDS1YOL164W 1941 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP42Q12277 YEL023CYEL023C 2049 nt7.08□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 TPI1YDR050C 747 nt7.08□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 PIL1YGR086C 1020 nt7.08□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 AIM34YMR003W 597 nt7.08□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 BAP3YDR046C 1815 nt7.08□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 ERG24YNL280C 1317 nt7.07□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 PRE5YMR314W 705 nt7.07□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 YIL108WYIL108W 2091 nt7.07□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 YDR327WYDR327W 327 nt7.06□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 ATP23YNR020C 813 nt7.06□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 DCR2YLR361C 1737 nt7.04□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 HNM1YGL077C 1692 nt7.04□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 PIH1YHR034C 1035 nt7.04□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 YML079WYML079W 606 nt7.04□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 YBL113CYBL113C 2379 nt7.04□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 ITR1YDR497C 1755 nt7.03□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 GNA1YFL017C 480 nt7.03□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 YJL213WYJL213W 996 nt7.03□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 CKI1YLR133W 1749 nt7.03□□□□□ -1.28
RRP42Q12277 HXT9YJL219W 1704 nt7.02□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 STF1YDL130W-A 261 nt7.02□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 PAM17YKR065C 594 nt7.02□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 YLR030WYLR030W 792 nt7.02□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 CCW12YLR110C 402 nt7.02□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 YML122CYML122C 381 nt7.02□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 YBL111CYBL111C 2004 nt7.01□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 TCB1YOR086C 3561 nt7□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 ADH6YMR318C 1083 nt7□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 Q0010Q0010 387 nt7□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 SDH8YBR269C 417 nt7□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 YER152CYER152C 1332 nt7□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 PUS7YOR243C 2031 nt7□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 MFG1YDL233W 1377 nt6.99□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 YOR041CYOR041C 432 nt6.99□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 AFG3YER017C 2286 nt6.99□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 MAL31YBR298C 1845 nt6.99□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 YJL045WYJL045W 1905 nt6.98□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 GTS1YGL181W 1191 nt6.98□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 PUP2YGR253C 783 nt6.97□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 PTH2YBL057C 627 nt6.97□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 MSS51YLR203C 1311 nt6.97□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 CIT2YCR005C 1383 nt6.96□□□□□ -1.29
RRP42Q12277 MSB3YNL293W 1902 nt6.96□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 GUT1YHL032C 2130 nt6.96□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 TRR2YHR106W 1029 nt6.96□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.96□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 HXT13YEL069C 1695 nt6.96□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 PET117YER058W 324 nt6.95□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 YPL067CYPL067C 597 nt6.95□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 UME1YPL139C 1383 nt6.95□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 DML1YMR211W 1428 nt6.94□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 CHA1YCL064C 1083 nt6.94□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 YPQ2YDR352W 954 nt6.94□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.94□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 YGL260WYGL260W 231 nt6.94□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 YKL147CYKL147C 618 nt6.94□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 SPE4YLR146C 903 nt6.94□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 RPR1RPR1 369 nt6.94□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 PRS4YBL068W 981 nt6.94□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 LIP5YOR196C 1245 nt6.94□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 CDC23YHR166C 1881 nt6.94□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 ATP10YLR393W 840 nt6.93□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 PRC1YMR297W 1599 nt6.93□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 TUB1YML085C 1344 nt6.93□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 ATO2YNR002C 849 nt6.92□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 YPQ1YOL092W 927 nt6.92□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 CST26YBR042C 1194 nt6.92□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 CDC13YDL220C 2775 nt6.91□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 YJR154WYJR154W 1041 nt6.91□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 YNL040WYNL040W 1371 nt6.91□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 LAT1YNL071W 1449 nt6.91□□□□□ -1.3
RRP42Q12277 NFS1YCL017C 1494 nt6.9□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 RDR1YOR380W 1641 nt6.9□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 CYS3YAL012W 1185 nt6.89□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 YMR074CYMR074C 438 nt6.89□□□□□ -1.31
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