Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 THI73YLR004C 1572 nt7.29□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 RGT2YDL138W 2292 nt7.28□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 PUP3YER094C 618 nt7.28□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 CAK1YFL029C 1107 nt7.28□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 YGR137WYGR137W 375 nt7.28□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 GPA1YHR005C 1419 nt7.27□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 SER2YGR208W 930 nt7.27□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 YMR166CYMR166C 1107 nt7.27□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 PMT1YDL095W 2454 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 BRN1YBL097W 2265 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 FPR2YDR519W 408 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 YHC3YJL059W 1227 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 ELP6YMR312W 822 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 SMK1YPR054W 1167 nt7.26□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 MTC6YHR151C 1581 nt7.25□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 CYC8YBR112C 2901 nt7.25□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 YGR210CYGR210C 1236 nt7.25□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 YPL041CYPL041C 624 nt7.25□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 SLX5YDL013W 1860 nt7.25□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 HHY1YEL059W 309 nt7.24□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 SNP1YIL061C 903 nt7.24□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 LSP1YPL004C 1026 nt7.24□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 HXK2YGL253W 1461 nt7.24□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 GLN3YER040W 2193 nt7.23□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 POP1YNL221C 2628 nt7.23□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 GTT3YEL017W 1014 nt7.23□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 HTS1YPR033C 1641 nt7.23□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 YJL064WYJL064W 396 nt7.22□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 AVL9YLR114C 2295 nt7.22□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 AVT4YNL101W 2142 nt7.22□□□□□ -1.25
NFI1Q12216 YOR041CYOR041C 432 nt7.21□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 YPL108WYPL108W 507 nt7.21□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 YPT31YER031C 672 nt7.2□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 SEN2YLR105C 1134 nt7.2□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 RBS1YDL189W 1374 nt7.2□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 NMT1YLR195C 1368 nt7.2□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 EFT2YDR385W 2529 nt7.19□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 EFT1YOR133W 2529 nt7.19□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 GNA1YFL017C 480 nt7.19□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 CKB1YGL019W 837 nt7.19□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 RRT14YIL127C 621 nt7.19□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 FCY1YPR062W 477 nt7.19□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 CDA1YLR307W 906 nt7.18□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 LAG2YOL025W 1983 nt7.17□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 PDC5YLR134W 1692 nt7.17□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 YGR127WYGR127W 939 nt7.17□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 TES1YJR019C 1050 nt7.17□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 PAU19YMR325W 375 nt7.17□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 YNL200CYNL200C 741 nt7.17□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 PEX28YHR150W 1740 nt7.16□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.16□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 PRE10YOR362C 867 nt7.16□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 TIM50YPL063W 1431 nt7.16□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 FCY22YER060W-A 1593 nt7.16□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 GFA1YKL104C 2154 nt7.15□□□□□ -1.26
NFI1Q12216 EHD3YDR036C 1503 nt7.15□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 PET18YCR020C 648 nt7.14□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 JHD1YER051W 1479 nt7.14□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 PAC10YGR078C 600 nt7.14□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 BXI1YNL305C 894 nt7.14□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 GYP8YFL027C 1494 nt7.13□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 PET494YNR045W 1470 nt7.13□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 THI4YGR144W 981 nt7.13□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 HRA1HRA1 564 nt7.13□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 HAM1YJR069C 594 nt7.13□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 RPS6AYPL090C 711 nt7.13□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 AOS1YPR180W 1044 nt7.13□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 RPS6BYBR181C 711 nt7.13□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 RUP1YOR138C 2016 nt7.13□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 CDC23YHR166C 1881 nt7.13□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 ENB1YOL158C 1821 nt7.13□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 snR82snR82 268 nt7.12□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 DST1YGL043W 930 nt7.12□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 SNA3YJL151C 402 nt7.12□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 YOR012WYOR012W 414 nt7.12□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 MNN9YPL050C 1188 nt7.12□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 ATG22YCL038C 1587 nt7.11□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 ACS1YAL054C 2142 nt7.1□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 ARG7YMR062C 1326 nt7.1□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 CEF1YMR213W 1773 nt7.1□□□□□ -1.27
NFI1Q12216 PXL1YKR090W 2121 nt7.09□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 LEO1YOR123C 1395 nt7.08□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 FLC2YAL053W 2352 nt7.08□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 CIT3YPR001W 1461 nt7.08□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 YBL113CYBL113C 2379 nt7.07□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 SWM1YDR260C 513 nt7.07□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 YJL160CYJL160C 864 nt7.07□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 PMU1YKL128C 888 nt7.07□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 YMR206WYMR206W 942 nt7.07□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 IDP3YNL009W 1263 nt7.07□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 ALT2YDR111C 1524 nt7.06□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 FET4YMR319C 1659 nt7.06□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 AFG3YER017C 2286 nt7.06□□□□□ -1.28
NFI1Q12216 CAN1YEL063C 1773 nt7.06□□□□□ -1.28
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