Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD164Q04900 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD164Q04900 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CD164Q04900 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD164Q04900 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD164Q04900 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD164Q04900 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD164Q04900 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD164Q04900 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD164Q04900 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD164Q04900 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD164Q04900 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD164Q04900 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD164Q04900 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD164Q04900 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD164Q04900 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD164Q04900 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD164Q04900 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD164Q04900 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD164Q04900 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD164Q04900 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD164Q04900 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD164Q04900 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD164Q04900 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD164Q04900 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD164Q04900 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD164Q04900 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD164Q04900 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD164Q04900 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD164Q04900 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD164Q04900 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD164Q04900 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD164Q04900 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD164Q04900 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD164Q04900 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD164Q04900 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD164Q04900 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD164Q04900 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD164Q04900 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD164Q04900 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD164Q04900 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD164Q04900 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD164Q04900 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD164Q04900 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD164Q04900 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD164Q04900 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD164Q04900 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD164Q04900 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD164Q04900 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD164Q04900 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD164Q04900 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD164Q04900 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD164Q04900 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD164Q04900 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD164Q04900 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD164Q04900 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD164Q04900 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD164Q04900 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD164Q04900 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CD164Q04900 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD164Q04900 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD164Q04900 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD164Q04900 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD164Q04900 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD164Q04900 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD164Q04900 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD164Q04900 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD164Q04900 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD164Q04900 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD164Q04900 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD164Q04900 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD164Q04900 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD164Q04900 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD164Q04900 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD164Q04900 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD164Q04900 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD164Q04900 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD164Q04900 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD164Q04900 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CD164Q04900 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD164Q04900 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD164Q04900 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD164Q04900 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD164Q04900 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD164Q04900 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD164Q04900 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD164Q04900 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD164Q04900 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms