Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 YHC3YJL059W 1227 nt7.46□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 YOR012WYOR012W 414 nt7.46□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 KIN1YDR122W 3195 nt7.46□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 TPI1YDR050C 747 nt7.45□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 BIM1YER016W 1035 nt7.45□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 YPT31YER031C 672 nt7.45□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 PUP3YER094C 618 nt7.45□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 PAC10YGR078C 600 nt7.45□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 LOT6YLR011W 576 nt7.45□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 YMR166CYMR166C 1107 nt7.45□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 YEN1YER041W 2280 nt7.45□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 MSS51YLR203C 1311 nt7.45□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 DAL7YIR031C 1665 nt7.44□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 YGR210CYGR210C 1236 nt7.44□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 SWM1YDR260C 513 nt7.43□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 RMA1YKL132C 1293 nt7.43□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 LSP1YPL004C 1026 nt7.43□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 AGP2YBR132C 1791 nt7.43□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 CIR2YOR356W 1896 nt7.43□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 HEL1YKR017C 1656 nt7.42□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 HXT8YJL214W 1710 nt7.42□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 YCP4YCR004C 744 nt7.42□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 SHC1YER096W 1539 nt7.42□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 NUP84YDL116W 2181 nt7.42□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.41□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.41□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.41□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.41□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.41□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 SNF4YGL115W 969 nt7.41□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 SLG1YOR008C 1137 nt7.41□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 CMK2YOL016C 1344 nt7.41□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 VTS1YOR359W 1572 nt7.41□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 SNF7YLR025W 723 nt7.4□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 YPL108WYPL108W 507 nt7.4□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 FCY2YER056C 1602 nt7.4□□□□□ -1.22
YKU80Q04437 CKI1YLR133W 1749 nt7.4□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 RRT14YIL127C 621 nt7.39□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 CIT3YPR001W 1461 nt7.38□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 MNN9YPL050C 1188 nt7.38□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 FCY1YPR062W 477 nt7.38□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 AOS1YPR180W 1044 nt7.38□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 RSP5YER125W 2430 nt7.37□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 HAM1YJR069C 594 nt7.37□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 PRE10YOR362C 867 nt7.37□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 YTH1YPR107C 627 nt7.37□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 SKY1YMR216C 2229 nt7.37□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 YCR041WYCR041W 333 nt7.36□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 AIM2YAL049C 741 nt7.36□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 RBS1YDL189W 1374 nt7.35□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 GFA1YKL104C 2154 nt7.35□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 MAK32YCR019W 1092 nt7.35□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 ECM30YLR436C 3825 nt7.34□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 ERG12YMR208W 1332 nt7.34□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 EHD3YDR036C 1503 nt7.34□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 YGL260WYGL260W 231 nt7.34□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 YLR112WYLR112W 420 nt7.34□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 RRN10YBL025W 438 nt7.34□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 RTC2YBR147W 891 nt7.34□□□□□ -1.23
YKU80Q04437 YCR061WYCR061W 1896 nt7.33□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 PET10YKR046C 852 nt7.33□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 YMR007WYMR007W 381 nt7.33□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 SMK1YPR054W 1167 nt7.33□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 NUP57YGR119C 1626 nt7.33□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 YPL277CYPL277C 1464 nt7.32□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 SHO1YER118C 1104 nt7.32□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 YMR206WYMR206W 942 nt7.32□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 TIM50YPL063W 1431 nt7.32□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 SNU71YGR013W 1863 nt7.32□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 DST1YGL043W 930 nt7.31□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 PRY2YKR013W 990 nt7.31□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 ERV25YML012W 636 nt7.31□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 ARG7YMR062C 1326 nt7.3□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 YKL147CYKL147C 618 nt7.3□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 AFG3YER017C 2286 nt7.3□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 CDC16YKL022C 2523 nt7.3□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 EXG2YDR261C 1689 nt7.29□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 EMP65YER140W 1671 nt7.29□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 YJL160CYJL160C 864 nt7.29□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 PMU1YKL128C 888 nt7.29□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 RCR1YBR005W 642 nt7.29□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 YBR226CYBR226C 411 nt7.29□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 YPR084WYPR084W 1371 nt7.29□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 ASN2YGR124W 1719 nt7.29□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 JHD1YER051W 1479 nt7.29□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 NMD5YJR132W 3147 nt7.28□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 CAR2YLR438W 1275 nt7.28□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 BXI1YNL305C 894 nt7.28□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 LIP5YOR196C 1245 nt7.28□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 RPS6AYPL090C 711 nt7.28□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 RPS6BYBR181C 711 nt7.28□□□□□ -1.24
YKU80Q04437 CLN1YMR199W 1641 nt7.27□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 YDR215CYDR215C 414 nt7.27□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 YER156CYER156C 1017 nt7.27□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 PUS5YLR165C 765 nt7.27□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 KDX1YKL161C 1302 nt7.27□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 YHR033WYHR033W 1272 nt7.26□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 NTG1YAL015C 1200 nt7.26□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 YOS9YDR057W 1629 nt7.26□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 GPH1YPR160W 2709 nt7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.6 ms