Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAG1P54619 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKAG1P54619 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAG1P54619 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1519.9 ms