Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNBP48739 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITPNBP48739 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms