Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 CKI1YLR133W 1749 nt8.05□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 ALR1YOL130W 2580 nt8.05□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 ERR3YMR323W 1314 nt8.04□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 ERR1YOR393W 1314 nt8.04□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 ERR2YPL281C 1314 nt8.04□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 SNF7YLR025W 723 nt8.04□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 SDH8YBR269C 417 nt8.04□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 CPT1YNL130C 1182 nt8.03□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 CDC23YHR166C 1881 nt8.02□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 RRP43YCR035C 1185 nt8.02□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 INP54YOL065C 1155 nt8.02□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 RTG2YGL252C 1767 nt8.02□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 SPR1YOR190W 1338 nt8.01□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 RMD8YFR048W 1989 nt8.01□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 YAH1YPL252C 519 nt8□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 HAC1YFL031W 717 nt7.99□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 GTS1YGL181W 1191 nt7.99□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 RTC2YBR147W 891 nt7.99□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 PNS1YOR161C 1620 nt7.99□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 SPS1YDR523C 1473 nt7.99□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 PRB1YEL060C 1908 nt7.98□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 SEC24YIL109C 2781 nt7.98□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 OPI1YHL020C 1215 nt7.98□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 BDS1YOL164W 1941 nt7.97□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 YER137CYER137C 447 nt7.97□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 PPZ2YDR436W 2133 nt7.97□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 MSS51YLR203C 1311 nt7.97□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 FLC2YAL053W 2352 nt7.96□□□□□ -1.13
SHQ1P40486 GET2YER083C 858 nt7.96□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 YGL260WYGL260W 231 nt7.96□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 YLR358CYLR358C 564 nt7.96□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 PSA1YDL055C 1086 nt7.95□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 PRY2YKR013W 990 nt7.95□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 POB3YML069W 1659 nt7.94□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 AFG3YER017C 2286 nt7.94□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 YKL147CYKL147C 618 nt7.93□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 TOD6YBL054W 1578 nt7.93□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 AQR1YNL065W 1761 nt7.92□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 YDR327WYDR327W 327 nt7.92□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 LIP5YOR196C 1245 nt7.92□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 ERV2YPR037C 591 nt7.92□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 GCD11YER025W 1584 nt7.92□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 NCA3YJL116C 1014 nt7.91□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 YPT10YBR264C 600 nt7.91□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 CAN1YEL063C 1773 nt7.91□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 YPL247CYPL247C 1572 nt7.9□□□□□ -1.14
SHQ1P40486 RPR1RPR1 369 nt7.89□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 ENB1YOL158C 1821 nt7.89□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 PUS7YOR243C 2031 nt7.88□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 BNA3YJL060W 1335 nt7.88□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 ERG24YNL280C 1317 nt7.88□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 DSC3YOR223W 879 nt7.88□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 YML079WYML079W 606 nt7.87□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 FCY2YER056C 1602 nt7.87□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 EXG2YDR261C 1689 nt7.86□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 SKP1YDR328C 585 nt7.86□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 NUP57YGR119C 1626 nt7.85□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 OSM1YJR051W 1506 nt7.85□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 GGC1YDL198C 903 nt7.85□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 STS1YIR011C 960 nt7.85□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 PUP2YGR253C 783 nt7.84□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 YJR142WYJR142W 1029 nt7.84□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 RDR1YOR380W 1641 nt7.84□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 CRN1YLR429W 1956 nt7.84□□□□□ -1.15
SHQ1P40486 ADE2YOR128C 1716 nt7.83□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 SNU66YOR308C 1764 nt7.82□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 MAS2YHR024C 1449 nt7.82□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 PIH1YHR034C 1035 nt7.82□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 LOT6YLR011W 576 nt7.82□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 FRT1YOR324C 1809 nt7.81□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.81□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 PMA2YPL036W 2844 nt7.8□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 ECM10YEL030W 1935 nt7.8□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 CDC7YDL017W 1524 nt7.8□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 ATO2YNR002C 849 nt7.8□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 COS10YNR075W 1125 nt7.8□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 MSI1YBR195C 1269 nt7.8□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 HRB1YNL004W 1365 nt7.8□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 LAT1YNL071W 1449 nt7.79□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 NMA2YGR010W 1188 nt7.79□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 CCW12YLR110C 402 nt7.78□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 ATP23YNR020C 813 nt7.78□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 RFS1YBR052C 633 nt7.78□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 YBL111CYBL111C 2004 nt7.78□□□□□ -1.16
SHQ1P40486 PGI1YBR196C 1665 nt7.77□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 SNF4YGL115W 969 nt7.77□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.77□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 MAM3YOL060C 2121 nt7.77□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.77□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 YMR074CYMR074C 438 nt7.76□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 YGL081WYGL081W 963 nt7.75□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 DOC1YGL240W 753 nt7.75□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 YOR012WYOR012W 414 nt7.75□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 NUP84YDL116W 2181 nt7.74□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 CTF3YLR381W 2202 nt7.74□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 CDC3YLR314C 1563 nt7.73□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 YCR041WYCR041W 333 nt7.73□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.73□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 PIL1YGR086C 1020 nt7.73□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 URA1YKL216W 945 nt7.73□□□□□ -1.17
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