Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD1P29536 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMOD1P29536 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LMOD1P29536 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMOD1P29536 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms