Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP1P28562 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP1P28562 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP1P28562 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP1P28562 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP1P28562 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP1P28562 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP1P28562 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP1P28562 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP1P28562 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP1P28562 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP1P28562 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP1P28562 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP1P28562 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP1P28562 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP1P28562 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP1P28562 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP1P28562 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP1P28562 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP1P28562 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP1P28562 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP1P28562 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP1P28562 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP1P28562 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP1P28562 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP1P28562 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP1P28562 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP1P28562 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP1P28562 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP1P28562 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP1P28562 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP1P28562 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP1P28562 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP1P28562 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP1P28562 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms