Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP6V1C1P21283 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1C1P21283 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms