Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPINO95295 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPINO95295 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms