Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC51.82■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC51.82■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC51.81■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.8■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC51.8■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.77■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC51.77■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC51.76■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC51.76■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.76■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC51.75■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC51.75■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.73■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC51.73■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC51.72■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC51.72■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC51.71■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC51.69■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC51.69■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC51.68■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC51.68■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.67■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC51.61■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.59■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC51.58■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC51.56■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.55■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.54■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.52■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC51.52■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC51.49■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC51.48■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.48■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.47■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.46■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.46■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC51.43■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC51.42■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC51.42■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC51.42■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC51.4■■■■■ 5.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms