Protein–RNA interactions for Protein: O43837

IDH3B, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3BO43837 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3BO43837 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3BO43837 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IDH3BO43837 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms