Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAPBPO15533 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAPBPO15533 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms