Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf98E9PRG8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C11orf98E9PRG8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf98E9PRG8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms