Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN25C9JDP6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144 ms