Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC78A2IDD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC78A2IDD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC78A2IDD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.4 ms