Protein–RNA interactions for Protein: A1L4Q6

Putative uncharacterized protein FLJ41423, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1L4Q6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1L4Q6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1L4Q6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A1L4Q6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A1L4Q6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1L4Q6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1L4Q6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1L4Q6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1L4Q6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A1L4Q6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A1L4Q6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A1L4Q6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A1L4Q6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A1L4Q6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A1L4Q6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A1L4Q6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A1L4Q6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A1L4Q6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A1L4Q6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A1L4Q6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A1L4Q6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A1L4Q6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A1L4Q6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A1L4Q6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A1L4Q6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A1L4Q6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A1L4Q6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A1L4Q6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A1L4Q6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A1L4Q6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A1L4Q6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A1L4Q6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A1L4Q6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A1L4Q6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A1L4Q6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A1L4Q6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A1L4Q6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A1L4Q6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A1L4Q6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A1L4Q6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A1L4Q6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A1L4Q6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A1L4Q6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A1L4Q6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A1L4Q6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A1L4Q6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A1L4Q6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A1L4Q6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A1L4Q6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A1L4Q6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A1L4Q6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A1L4Q6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A1L4Q6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A1L4Q6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A1L4Q6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A1L4Q6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A1L4Q6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A1L4Q6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A1L4Q6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A1L4Q6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A1L4Q6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A1L4Q6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A1L4Q6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A1L4Q6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A1L4Q6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A1L4Q6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A1L4Q6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A1L4Q6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A1L4Q6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A1L4Q6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
A1L4Q6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1L4Q6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1L4Q6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1L4Q6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1L4Q6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1L4Q6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1L4Q6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1L4Q6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1L4Q6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1L4Q6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1L4Q6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1L4Q6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A1L4Q6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A1L4Q6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A1L4Q6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1L4Q6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A1L4Q6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1L4Q6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1L4Q6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1L4Q6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1L4Q6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1L4Q6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1L4Q6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1L4Q6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1L4Q6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1L4Q6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1L4Q6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1L4Q6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1L4Q6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A1L4Q6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms