RNA: ENST00000629374.2

PCBP1-AS1-344, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 676 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.44■■□□□ 1.18
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.69■□□□□ 0.58
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.62■□□□□ 0.57
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 FOXD1Q16676 465 aa17.33■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 ADRA2BP18089 450 aa17.24■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.16■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 KCNA4P22459 653 aa16.78■□□□□ 0.28
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.64■□□□□ 0.25
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.49■□□□□ 0.23
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.44■□□□□ 0.22
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 ABCC9O60706 1549 aa16.31■□□□□ 0.2
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.92■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.87■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 MSH5O43196 834 aa15.86■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa15.7■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 NACADO15069 1562 aa15.68■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.63■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.59■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.49■□□□□ 0.07
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.4■□□□□ 0.06
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 ZBTB22O15209 634 aa15.36■□□□□ 0.05
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.33■□□□□ 0.04
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.29■□□□□ 0.04
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.21■□□□□ 0.03
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SCRIBQ14160 1630 aa15.14■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.13■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.1■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SLC4A2P04920 1241 aa14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.79□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.77□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.69□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.53□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SMARCA4P51532 1647 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.093e-8■■□□□ 13.5
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 NCAPD3P42695 1498 aa14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SMARCA2P51531 1590 aa14.44□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 FKBP8Q14318 412 aa14.42□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.39□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.39□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 HMGXB3Q12766 1538 aa14.38□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 WIZO95785 1651 aa14.21□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 APLP2Q06481 763 aa14.2□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SLC24A1O60721 1099 aa14.13□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 NESP48681 1621 aa14.1□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.09□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 ERCC6Q03468 1493 aa14.08□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.05□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.02□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CUX2O14529 1486 aa13.99□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CFTRP13569 1480 aa13.94□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.93□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.91□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.87□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 FBXO3Q9UK99 471 aa13.86□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.86□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.85□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 WDR62O43379 1518 aa13.81□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 PRDM2Q13029 1718 aa13.79□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 FBLN2P98095 1184 aa13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 ABCC8Q09428 1581 aa13.67□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.64□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 TOPBP1Q92547 1522 aa13.64□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 POLA2Q14181 598 aa13.62□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 CAPN15O75808 1086 aa13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-344ENST00000629374 IFT140Q96RY7 1462 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms