RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602726.1

PPFIA3-208, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene PPFIA3, Length 805 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3-208ENST00000602726 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.5■■■■■ 6.15
PPFIA3-208ENST00000602726 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.66■■■■■ 5.22
PPFIA3-208ENST00000602726 ABCC9O60706 1549 aa46.99■■■■■ 5.11
PPFIA3-208ENST00000602726 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.04■■■■■ 4.8
PPFIA3-208ENST00000602726 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.95■■■■■ 4.79
PPFIA3-208ENST00000602726 NACADO15069 1562 aa44.91■■■■■ 4.78
PPFIA3-208ENST00000602726 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.52■■■■■ 4.72
PPFIA3-208ENST00000602726 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
PPFIA3-208ENST00000602726 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.23■■■■■ 4.67
PPFIA3-208ENST00000602726 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.96■■■■■ 4.63
PPFIA3-208ENST00000602726 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.9■■■■■ 4.62
PPFIA3-208ENST00000602726 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.65■■■■■ 4.58
PPFIA3-208ENST00000602726 SCRIBQ14160 1630 aa43.51■■■■■ 4.56
PPFIA3-208ENST00000602726 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.39■■■■■ 4.54
PPFIA3-208ENST00000602726 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.18■■■■■ 4.5
PPFIA3-208ENST00000602726 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
PPFIA3-208ENST00000602726 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.46■■■■■ 4.39
PPFIA3-208ENST00000602726 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.25■■■■■ 4.35
PPFIA3-208ENST00000602726 SMARCA4P51532 1647 aa41.56■■■■■ 4.24
PPFIA3-208ENST00000602726 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
PPFIA3-208ENST00000602726 NCAPD3P42695 1498 aa41.45■■■■■ 4.23
PPFIA3-208ENST00000602726 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.43■■■■■ 4.22
PPFIA3-208ENST00000602726 SMARCA2P51531 1590 aa41.37■■■■■ 4.21
PPFIA3-208ENST00000602726 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.23■■■■■ 4.19
PPFIA3-208ENST00000602726 HMGXB3Q12766 1538 aa41.19■■■■■ 4.18
PPFIA3-208ENST00000602726 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.14■■■■■ 4.18
PPFIA3-208ENST00000602726 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
PPFIA3-208ENST00000602726 WIZO95785 1651 aa40.76■■■■■ 4.12
PPFIA3-208ENST00000602726 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
PPFIA3-208ENST00000602726 NESP48681 1621 aa40.56■■■■■ 4.08
PPFIA3-208ENST00000602726 ERCC6Q03468 1493 aa40.55■■■■■ 4.08
PPFIA3-208ENST00000602726 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.4■■■■■ 4.06
PPFIA3-208ENST00000602726 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
PPFIA3-208ENST00000602726 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.25■■■■■ 4.03
PPFIA3-208ENST00000602726 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.18■■■■■ 4.02
PPFIA3-208ENST00000602726 CUX2O14529 1486 aa40.18■■■■■ 4.02
PPFIA3-208ENST00000602726 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.03■■■■■ 4
PPFIA3-208ENST00000602726 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
PPFIA3-208ENST00000602726 CFTRP13569 1480 aa39.93■■■■□ 3.98
PPFIA3-208ENST00000602726 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.87■■■■□ 3.97
PPFIA3-208ENST00000602726 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.79■■■■□ 3.96
PPFIA3-208ENST00000602726 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.76■■■■□ 3.96
PPFIA3-208ENST00000602726 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.75■■■■□ 3.95
PPFIA3-208ENST00000602726 WDR62O43379 1518 aa39.6■■■■□ 3.93
PPFIA3-208ENST00000602726 PRDM2Q13029 1718 aa39.55■■■■□ 3.92
PPFIA3-208ENST00000602726 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
PPFIA3-208ENST00000602726 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
PPFIA3-208ENST00000602726 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.34■■■■□ 3.89
PPFIA3-208ENST00000602726 TOPBP1Q92547 1522 aa39.1■■■■□ 3.85
PPFIA3-208ENST00000602726 ABCC8Q09428 1581 aa39.1■■■■□ 3.85
PPFIA3-208ENST00000602726 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.02■■■■□ 3.84
PPFIA3-208ENST00000602726 IFT140Q96RY7 1462 aa38.94■■■■□ 3.82
PPFIA3-208ENST00000602726 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
PPFIA3-208ENST00000602726 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
PPFIA3-208ENST00000602726 CUX1P39880 1505 aa38.69■■■■□ 3.78
PPFIA3-208ENST00000602726 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
PPFIA3-208ENST00000602726 SOGA1O94964 1423 aa38.63■■■■□ 3.77
PPFIA3-208ENST00000602726 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.62■■■■□ 3.77
PPFIA3-208ENST00000602726 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.6■■■■□ 3.77
PPFIA3-208ENST00000602726 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
PPFIA3-208ENST00000602726 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.55■■■■□ 3.764e-7■■□□□ 12.7
PPFIA3-208ENST00000602726 OSCARQ8IYS5 282 aa38.53■■■■□ 3.76
PPFIA3-208ENST00000602726 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
PPFIA3-208ENST00000602726 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.37■■■■□ 3.73
PPFIA3-208ENST00000602726 WDR97A6NE52 1622 aa38.35■■■■□ 3.73
PPFIA3-208ENST00000602726 TOP2BQ02880 1626 aa38.27■■■■□ 3.72
PPFIA3-208ENST00000602726 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.26■■■■□ 3.71
PPFIA3-208ENST00000602726 SYNJ1O43426 1573 aa38.25■■■■□ 3.71
PPFIA3-208ENST00000602726 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.22■■■■□ 3.71
PPFIA3-208ENST00000602726 FBLN2P98095 1184 aa38.22■■■■□ 3.71
PPFIA3-208ENST00000602726 GRIN2BQ13224 1484 aa38.19■■■■□ 3.7
PPFIA3-208ENST00000602726 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.17■■■■□ 3.7
PPFIA3-208ENST00000602726 CHD1O14646 1710 aa38.16■■■■□ 3.7
PPFIA3-208ENST00000602726 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.15■■■■□ 3.7
PPFIA3-208ENST00000602726 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
PPFIA3-208ENST00000602726 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.07■■■■□ 3.68
PPFIA3-208ENST00000602726 PBRM1Q86U86 1689 aa38.05■■■■□ 3.68
PPFIA3-208ENST00000602726 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
PPFIA3-208ENST00000602726 SYNJ2O15056 1496 aa37.97■■■■□ 3.67
PPFIA3-208ENST00000602726 TRIM41Q8WV44 630 aa37.96■■■■□ 3.67
PPFIA3-208ENST00000602726 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
PPFIA3-208ENST00000602726 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
PPFIA3-208ENST00000602726 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
PPFIA3-208ENST00000602726 ARHGEF11O15085 1522 aa37.84■■■■□ 3.65
PPFIA3-208ENST00000602726 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.76■■■■□ 3.63
PPFIA3-208ENST00000602726 ADAMTS12P58397 1594 aa37.74■■■■□ 3.63
PPFIA3-208ENST00000602726 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.74■■■■□ 3.63
PPFIA3-208ENST00000602726 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.71■■■■□ 3.63
PPFIA3-208ENST00000602726 GRIN2AQ12879 1464 aa37.69■■■■□ 3.62
PPFIA3-208ENST00000602726 KIF27Q86VH2 1401 aa37.61■■■■□ 3.61
PPFIA3-208ENST00000602726 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.58■■■■□ 3.61
PPFIA3-208ENST00000602726 NUP160Q12769 1436 aa37.52■■■■□ 3.6
PPFIA3-208ENST00000602726 ARAP1Q96P48 1450 aa37.52■■■■□ 3.6
PPFIA3-208ENST00000602726 CEP170Q5SW79 1584 aa37.49■■■■□ 3.59
PPFIA3-208ENST00000602726 IGF1RP08069 1367 aa37.48■■■■□ 3.59
PPFIA3-208ENST00000602726 CUL7Q14999 1698 aa37.35■■■■□ 3.57
PPFIA3-208ENST00000602726 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.26■■■■□ 3.55
PPFIA3-208ENST00000602726 SHROOM2Q13796 1616 aa37.24■■■■□ 3.55
PPFIA3-208ENST00000602726 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.21■■■■□ 3.55
PPFIA3-208ENST00000602726 JPH4Q96JJ6 628 aa37.2■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.6 ms