RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588413.5

TMUB2-210, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene TMUB2, Length 747 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-210ENST00000588413 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.24■■■□□ 2.75
TMUB2-210ENST00000588413 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.5■■■□□ 2.15
TMUB2-210ENST00000588413 ABCC9O60706 1549 aa27.82■■■□□ 2.04
TMUB2-210ENST00000588413 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.05■■□□□ 1.92
TMUB2-210ENST00000588413 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
TMUB2-210ENST00000588413 NACADO15069 1562 aa26.83■■□□□ 1.89
TMUB2-210ENST00000588413 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.8■■□□□ 1.88
TMUB2-210ENST00000588413 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.72■■□□□ 1.87
TMUB2-210ENST00000588413 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.66■■□□□ 1.86
TMUB2-210ENST00000588413 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
TMUB2-210ENST00000588413 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.11■■□□□ 1.77
TMUB2-210ENST00000588413 SCRIBQ14160 1630 aa26.03■■□□□ 1.76
TMUB2-210ENST00000588413 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.96■■□□□ 1.75
TMUB2-210ENST00000588413 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.7■■□□□ 1.7
TMUB2-210ENST00000588413 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.48■■□□□ 1.67
TMUB2-210ENST00000588413 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TMUB2-210ENST00000588413 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.13■■□□□ 1.61
TMUB2-210ENST00000588413 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.11■■□□□ 1.61
TMUB2-210ENST00000588413 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TMUB2-210ENST00000588413 SMARCA4P51532 1647 aa24.92■■□□□ 1.58
TMUB2-210ENST00000588413 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.84■■□□□ 1.57
TMUB2-210ENST00000588413 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.81■■□□□ 1.56
TMUB2-210ENST00000588413 NCAPD3P42695 1498 aa24.8■■□□□ 1.56
TMUB2-210ENST00000588413 SMARCA2P51531 1590 aa24.76■■□□□ 1.55
TMUB2-210ENST00000588413 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.68■■□□□ 1.54
TMUB2-210ENST00000588413 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
TMUB2-210ENST00000588413 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TMUB2-210ENST00000588413 HMGXB3Q12766 1538 aa24.6■■□□□ 1.53
TMUB2-210ENST00000588413 WIZO95785 1651 aa24.55■■□□□ 1.52
TMUB2-210ENST00000588413 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TMUB2-210ENST00000588413 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TMUB2-210ENST00000588413 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.11■■□□□ 1.45
TMUB2-210ENST00000588413 NESP48681 1621 aa24.1■■□□□ 1.45
TMUB2-210ENST00000588413 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.09■■□□□ 1.45
TMUB2-210ENST00000588413 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.05■■□□□ 1.44
TMUB2-210ENST00000588413 ERCC6Q03468 1493 aa23.97■■□□□ 1.43
TMUB2-210ENST00000588413 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.96■■□□□ 1.43
TMUB2-210ENST00000588413 CFTRP13569 1480 aa23.95■■□□□ 1.42
TMUB2-210ENST00000588413 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.77■■□□□ 1.4
TMUB2-210ENST00000588413 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.76■■□□□ 1.39
TMUB2-210ENST00000588413 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.71■■□□□ 1.39
TMUB2-210ENST00000588413 PRDM2Q13029 1718 aa23.64■■□□□ 1.38
TMUB2-210ENST00000588413 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.64■■□□□ 1.38
TMUB2-210ENST00000588413 CUX2O14529 1486 aa23.63■■□□□ 1.37
TMUB2-210ENST00000588413 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TMUB2-210ENST00000588413 WDR62O43379 1518 aa23.53■■□□□ 1.36
TMUB2-210ENST00000588413 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TMUB2-210ENST00000588413 ABCC8Q09428 1581 aa23.47■■□□□ 1.35
TMUB2-210ENST00000588413 TOPBP1Q92547 1522 aa23.4■■□□□ 1.34
TMUB2-210ENST00000588413 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.36■■□□□ 1.33
TMUB2-210ENST00000588413 CUX1P39880 1505 aa23.27■■□□□ 1.32
TMUB2-210ENST00000588413 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
TMUB2-210ENST00000588413 IFT140Q96RY7 1462 aa23.24■■□□□ 1.31
TMUB2-210ENST00000588413 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TMUB2-210ENST00000588413 SOGA1O94964 1423 aa23.2■■□□□ 1.3
TMUB2-210ENST00000588413 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.18■■□□□ 1.3
TMUB2-210ENST00000588413 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.14■■□□□ 1.29
TMUB2-210ENST00000588413 TOP2BQ02880 1626 aa23.11■■□□□ 1.29
TMUB2-210ENST00000588413 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TMUB2-210ENST00000588413 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
TMUB2-210ENST00000588413 SYNJ1O43426 1573 aa23.1■■□□□ 1.29
TMUB2-210ENST00000588413 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.08■■□□□ 1.28
TMUB2-210ENST00000588413 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TMUB2-210ENST00000588413 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.283e-6■■■□□ 18.3
TMUB2-210ENST00000588413 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.98■■□□□ 1.27
TMUB2-210ENST00000588413 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TMUB2-210ENST00000588413 TRIM41Q8WV44 630 aa22.93■■□□□ 1.26
TMUB2-210ENST00000588413 WDR97A6NE52 1622 aa22.92■■□□□ 1.26
TMUB2-210ENST00000588413 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.89■■□□□ 1.25
TMUB2-210ENST00000588413 GRIN2BQ13224 1484 aa22.85■■□□□ 1.25
TMUB2-210ENST00000588413 OSCARQ8IYS5 282 aa22.84■■□□□ 1.25
TMUB2-210ENST00000588413 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.84■■□□□ 1.25
TMUB2-210ENST00000588413 FBLN2P98095 1184 aa22.81■■□□□ 1.24
TMUB2-210ENST00000588413 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.8■■□□□ 1.24
TMUB2-210ENST00000588413 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TMUB2-210ENST00000588413 KIF27Q86VH2 1401 aa22.76■■□□□ 1.23
TMUB2-210ENST00000588413 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.76■■□□□ 1.23
TMUB2-210ENST00000588413 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TMUB2-210ENST00000588413 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.74■■□□□ 1.23
TMUB2-210ENST00000588413 PBRM1Q86U86 1689 aa22.71■■□□□ 1.23
TMUB2-210ENST00000588413 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.69■■□□□ 1.22
TMUB2-210ENST00000588413 IGF1RP08069 1367 aa22.69■■□□□ 1.22
TMUB2-210ENST00000588413 SYNJ2O15056 1496 aa22.68■■□□□ 1.22
TMUB2-210ENST00000588413 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.64■■□□□ 1.21
TMUB2-210ENST00000588413 CHD1O14646 1710 aa22.62■■□□□ 1.21
TMUB2-210ENST00000588413 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.59■■□□□ 1.21
TMUB2-210ENST00000588413 ADAMTS12P58397 1594 aa22.55■■□□□ 1.2
TMUB2-210ENST00000588413 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.54■■□□□ 1.2
TMUB2-210ENST00000588413 GRIN2AQ12879 1464 aa22.54■■□□□ 1.2
TMUB2-210ENST00000588413 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.48■■□□□ 1.19
TMUB2-210ENST00000588413 CUL7Q14999 1698 aa22.48■■□□□ 1.19
TMUB2-210ENST00000588413 NUP160Q12769 1436 aa22.43■■□□□ 1.18
TMUB2-210ENST00000588413 EEA1Q15075 1411 aa22.42■■□□□ 1.18
TMUB2-210ENST00000588413 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TMUB2-210ENST00000588413 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.41■■□□□ 1.18
TMUB2-210ENST00000588413 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.39■■□□□ 1.17
TMUB2-210ENST00000588413 CEP170Q5SW79 1584 aa22.38■■□□□ 1.17
TMUB2-210ENST00000588413 JPH4Q96JJ6 628 aa22.35■■□□□ 1.17
TMUB2-210ENST00000588413 PRXQ9BXM0 1461 aa22.34■■□□□ 1.17
TMUB2-210ENST00000588413 ARHGEF11O15085 1522 aa22.3■■□□□ 1.16
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