RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586548.5

CIRBP-208, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-208ENST00000586548 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.78■■■■■ 5.56
CIRBP-208ENST00000586548 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.3■■■■■ 4.52
CIRBP-208ENST00000586548 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
CIRBP-208ENST00000586548 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.2■■■■■ 4.19
CIRBP-208ENST00000586548 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.9■■■■■ 4.14
CIRBP-208ENST00000586548 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.79■■■■■ 4.12
CIRBP-208ENST00000586548 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.58■■■■■ 4.09
CIRBP-208ENST00000586548 ABCC9O60706 1549 aa40.56■■■■■ 4.08
CIRBP-208ENST00000586548 NACADO15069 1562 aa40.22■■■■■ 4.03
CIRBP-208ENST00000586548 SCRIBQ14160 1630 aa39.82■■■■□ 3.97
CIRBP-208ENST00000586548 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.79■■■■□ 3.96
CIRBP-208ENST00000586548 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
CIRBP-208ENST00000586548 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.03■■■■□ 3.84
CIRBP-208ENST00000586548 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
CIRBP-208ENST00000586548 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.63■■■■□ 3.77
CIRBP-208ENST00000586548 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.59■■■■□ 3.77
CIRBP-208ENST00000586548 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.47■■■■□ 3.75
CIRBP-208ENST00000586548 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
CIRBP-208ENST00000586548 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.28■■■■□ 3.72
CIRBP-208ENST00000586548 SMARCA4P51532 1647 aa38.22■■■■□ 3.71
CIRBP-208ENST00000586548 WIZO95785 1651 aa38.19■■■■□ 3.7
CIRBP-208ENST00000586548 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.93■■■■□ 3.66
CIRBP-208ENST00000586548 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
CIRBP-208ENST00000586548 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.75■■■■□ 3.63
CIRBP-208ENST00000586548 SMARCA2P51531 1590 aa37.49■■■■□ 3.59
CIRBP-208ENST00000586548 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.48■■■■□ 3.59
CIRBP-208ENST00000586548 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.4■■■■□ 3.58
CIRBP-208ENST00000586548 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
CIRBP-208ENST00000586548 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
CIRBP-208ENST00000586548 HMGXB3Q12766 1538 aa37.11■■■■□ 3.53
CIRBP-208ENST00000586548 NCAPD3P42695 1498 aa37.1■■■■□ 3.53
CIRBP-208ENST00000586548 TRIM41Q8WV44 630 aa37.05■■■■□ 3.52
CIRBP-208ENST00000586548 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.75■■■■□ 3.47
CIRBP-208ENST00000586548 ABCC8Q09428 1581 aa36.73■■■■□ 3.47
CIRBP-208ENST00000586548 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.46■■■■□ 3.431e-6■■■■■ 58.5
CIRBP-208ENST00000586548 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.45■■■■□ 3.43
CIRBP-208ENST00000586548 CFTRP13569 1480 aa36.38■■■■□ 3.41
CIRBP-208ENST00000586548 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
CIRBP-208ENST00000586548 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.32■■■■□ 3.4
CIRBP-208ENST00000586548 SYNJ1O43426 1573 aa36.31■■■■□ 3.4
CIRBP-208ENST00000586548 PRDM2Q13029 1718 aa36.29■■■■□ 3.4
CIRBP-208ENST00000586548 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.16■■■■□ 3.38
CIRBP-208ENST00000586548 TOP2BQ02880 1626 aa36.15■■■■□ 3.38
CIRBP-208ENST00000586548 EEA1Q15075 1411 aa36.15■■■■□ 3.38
CIRBP-208ENST00000586548 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.12■■■■□ 3.37
CIRBP-208ENST00000586548 SOGA1O94964 1423 aa36.09■■■■□ 3.37
CIRBP-208ENST00000586548 CUX1P39880 1505 aa35.96■■■■□ 3.35
CIRBP-208ENST00000586548 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.93■■■■□ 3.34
CIRBP-208ENST00000586548 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.86■■■■□ 3.33
CIRBP-208ENST00000586548 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.8■■■■□ 3.32
CIRBP-208ENST00000586548 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.8■■■■□ 3.32
CIRBP-208ENST00000586548 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.78■■■■□ 3.32
CIRBP-208ENST00000586548 NESP48681 1621 aa35.72■■■■□ 3.31
CIRBP-208ENST00000586548 KIF21BO75037 1637 aa35.67■■■■□ 3.3
CIRBP-208ENST00000586548 GOLGA3Q08378 1498 aa35.66■■■■□ 3.3
CIRBP-208ENST00000586548 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.63■■■■□ 3.29
CIRBP-208ENST00000586548 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.59■■■■□ 3.29
CIRBP-208ENST00000586548 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.55■■■■□ 3.28
CIRBP-208ENST00000586548 KIF27Q86VH2 1401 aa35.51■■■■□ 3.27
CIRBP-208ENST00000586548 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.5■■■■□ 3.27
CIRBP-208ENST00000586548 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.49■■■■□ 3.27
CIRBP-208ENST00000586548 TOPBP1Q92547 1522 aa35.44■■■■□ 3.26
CIRBP-208ENST00000586548 CEP162Q5TB80 1403 aa35.43■■■■□ 3.26
CIRBP-208ENST00000586548 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
CIRBP-208ENST00000586548 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.37■■■■□ 3.25
CIRBP-208ENST00000586548 PRXQ9BXM0 1461 aa35.36■■■■□ 3.25
CIRBP-208ENST00000586548 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.36■■■■□ 3.25
CIRBP-208ENST00000586548 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.35■■■■□ 3.25
CIRBP-208ENST00000586548 CUX2O14529 1486 aa35.33■■■■□ 3.25
CIRBP-208ENST00000586548 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
CIRBP-208ENST00000586548 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
CIRBP-208ENST00000586548 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.21■■■■□ 3.23
CIRBP-208ENST00000586548 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.15■■■■□ 3.22
CIRBP-208ENST00000586548 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.15■■■■□ 3.22
CIRBP-208ENST00000586548 IGF1RP08069 1367 aa35.14■■■■□ 3.22
CIRBP-208ENST00000586548 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
CIRBP-208ENST00000586548 WDR97A6NE52 1622 aa35.1■■■■□ 3.21
CIRBP-208ENST00000586548 CLIP1P30622 1438 aa35.08■■■■□ 3.21
CIRBP-208ENST00000586548 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.03■■■■□ 3.2
CIRBP-208ENST00000586548 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.97■■■■□ 3.19
CIRBP-208ENST00000586548 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.92■■■■□ 3.18
CIRBP-208ENST00000586548 CUL7Q14999 1698 aa34.91■■■■□ 3.18
CIRBP-208ENST00000586548 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
CIRBP-208ENST00000586548 WDR62O43379 1518 aa34.85■■■■□ 3.17
CIRBP-208ENST00000586548 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.83■■■■□ 3.17
CIRBP-208ENST00000586548 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.8■■■■□ 3.16
CIRBP-208ENST00000586548 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
CIRBP-208ENST00000586548 ERCC6Q03468 1493 aa34.76■■■■□ 3.15
CIRBP-208ENST00000586548 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
CIRBP-208ENST00000586548 ARAP1Q96P48 1450 aa34.7■■■■□ 3.15
CIRBP-208ENST00000586548 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
CIRBP-208ENST00000586548 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
CIRBP-208ENST00000586548 IFT140Q96RY7 1462 aa34.65■■■■□ 3.14
CIRBP-208ENST00000586548 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.63■■■■□ 3.13
CIRBP-208ENST00000586548 PBRM1Q86U86 1689 aa34.62■■■■□ 3.13
CIRBP-208ENST00000586548 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.57■■■■□ 3.13
CIRBP-208ENST00000586548 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.49■■■■□ 3.113e-10■■■■■ 35.8
CIRBP-208ENST00000586548 GRIN2BQ13224 1484 aa34.48■■■■□ 3.11
CIRBP-208ENST00000586548 HRCP23327 699 aa34.46■■■■□ 3.11
CIRBP-208ENST00000586548 APLP2Q06481 763 aa34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms