RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583656.5

MTMR4-209, Transcript of myotubularin related protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene MTMR4, Length 810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4-209ENST00000583656 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.28■■■■■ 6.92
MTMR4-209ENST00000583656 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.75■■■■■ 5.87
MTMR4-209ENST00000583656 ABCC9O60706 1549 aa50.94■■■■■ 5.75
MTMR4-209ENST00000583656 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49■■■■■ 5.43
MTMR4-209ENST00000583656 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.84■■■■■ 5.41
MTMR4-209ENST00000583656 NACADO15069 1562 aa48.74■■■■■ 5.39
MTMR4-209ENST00000583656 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.49■■■■■ 5.35
MTMR4-209ENST00000583656 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.35■■■■■ 5.33
MTMR4-209ENST00000583656 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.12■■■■■ 5.29
MTMR4-209ENST00000583656 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.68■■■■■ 5.22
MTMR4-209ENST00000583656 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.67■■■■■ 5.22
MTMR4-209ENST00000583656 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.36■■■■■ 5.17
MTMR4-209ENST00000583656 SCRIBQ14160 1630 aa47.35■■■■■ 5.17
MTMR4-209ENST00000583656 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.91■■■■■ 5.1
MTMR4-209ENST00000583656 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.76■■■■■ 5.08
MTMR4-209ENST00000583656 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
MTMR4-209ENST00000583656 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.99■■■■■ 4.95
MTMR4-209ENST00000583656 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.75■■■■■ 4.91
MTMR4-209ENST00000583656 SMARCA4P51532 1647 aa45.22■■■■■ 4.83
MTMR4-209ENST00000583656 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.16■■■■■ 4.82
MTMR4-209ENST00000583656 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.04■■■■■ 4.8
MTMR4-209ENST00000583656 NCAPD3P42695 1498 aa45.02■■■■■ 4.8
MTMR4-209ENST00000583656 SMARCA2P51531 1590 aa44.94■■■■■ 4.79
MTMR4-209ENST00000583656 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.94■■■■■ 4.79
MTMR4-209ENST00000583656 HMGXB3Q12766 1538 aa44.73■■■■■ 4.75
MTMR4-209ENST00000583656 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.72■■■■■ 4.75
MTMR4-209ENST00000583656 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
MTMR4-209ENST00000583656 WIZO95785 1651 aa44.45■■■■■ 4.71
MTMR4-209ENST00000583656 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
MTMR4-209ENST00000583656 NESP48681 1621 aa44.04■■■■■ 4.64
MTMR4-209ENST00000583656 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
MTMR4-209ENST00000583656 ERCC6Q03468 1493 aa43.91■■■■■ 4.62
MTMR4-209ENST00000583656 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.8■■■■■ 4.6
MTMR4-209ENST00000583656 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.75■■■■■ 4.59
MTMR4-209ENST00000583656 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.59■■■■■ 4.57
MTMR4-209ENST00000583656 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.49■■■■■ 4.55
MTMR4-209ENST00000583656 CFTRP13569 1480 aa43.42■■■■■ 4.54
MTMR4-209ENST00000583656 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.42■■■■■ 4.54
MTMR4-209ENST00000583656 CUX2O14529 1486 aa43.38■■■■■ 4.54
MTMR4-209ENST00000583656 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
MTMR4-209ENST00000583656 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
MTMR4-209ENST00000583656 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.24■■■■■ 4.51
MTMR4-209ENST00000583656 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.18■■■■■ 4.5
MTMR4-209ENST00000583656 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.13■■■■■ 4.5
MTMR4-209ENST00000583656 PRDM2Q13029 1718 aa42.95■■■■■ 4.47
MTMR4-209ENST00000583656 WDR62O43379 1518 aa42.95■■■■■ 4.47
MTMR4-209ENST00000583656 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
MTMR4-209ENST00000583656 TOPBP1Q92547 1522 aa42.51■■■■■ 4.4
MTMR4-209ENST00000583656 ABCC8Q09428 1581 aa42.48■■■■■ 4.39
MTMR4-209ENST00000583656 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.43■■■■■ 4.38
MTMR4-209ENST00000583656 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.3■■■■■ 4.36
MTMR4-209ENST00000583656 IFT140Q96RY7 1462 aa42.28■■■■■ 4.36
MTMR4-209ENST00000583656 CUX1P39880 1505 aa42.15■■■■■ 4.34
MTMR4-209ENST00000583656 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
MTMR4-209ENST00000583656 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
MTMR4-209ENST00000583656 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.05■■■■■ 4.32
MTMR4-209ENST00000583656 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.04■■■■■ 4.32
MTMR4-209ENST00000583656 SOGA1O94964 1423 aa42.03■■■■■ 4.32
MTMR4-209ENST00000583656 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
MTMR4-209ENST00000583656 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.37e-7■■■■□ 20.1
MTMR4-209ENST00000583656 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.3
MTMR4-209ENST00000583656 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.88■■■■■ 4.3
MTMR4-209ENST00000583656 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
MTMR4-209ENST00000583656 SYNJ1O43426 1573 aa41.75■■■■■ 4.27
MTMR4-209ENST00000583656 TOP2BQ02880 1626 aa41.73■■■■■ 4.27
MTMR4-209ENST00000583656 OSCARQ8IYS5 282 aa41.71■■■■■ 4.27
MTMR4-209ENST00000583656 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.69■■■■■ 4.27
MTMR4-209ENST00000583656 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.6■■■■■ 4.25
MTMR4-209ENST00000583656 WDR97A6NE52 1622 aa41.6■■■■■ 4.25
MTMR4-209ENST00000583656 FBLN2P98095 1184 aa41.54■■■■■ 4.24
MTMR4-209ENST00000583656 GRIN2BQ13224 1484 aa41.51■■■■■ 4.24
MTMR4-209ENST00000583656 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.51■■■■■ 4.24
MTMR4-209ENST00000583656 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.48■■■■■ 4.23
MTMR4-209ENST00000583656 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.4■■■■■ 4.22
MTMR4-209ENST00000583656 CHD1O14646 1710 aa41.38■■■■■ 4.21
MTMR4-209ENST00000583656 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
MTMR4-209ENST00000583656 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
MTMR4-209ENST00000583656 PBRM1Q86U86 1689 aa41.34■■■■■ 4.21
MTMR4-209ENST00000583656 SYNJ2O15056 1496 aa41.24■■■■■ 4.19
MTMR4-209ENST00000583656 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.08■■■■■ 4.17
MTMR4-209ENST00000583656 ADAMTS12P58397 1594 aa41.03■■■■■ 4.16
MTMR4-209ENST00000583656 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.02■■■■■ 4.16
MTMR4-209ENST00000583656 KIF27Q86VH2 1401 aa41.02■■■■■ 4.16
MTMR4-209ENST00000583656 TRIM41Q8WV44 630 aa40.98■■■■■ 4.15
MTMR4-209ENST00000583656 GRIN2AQ12879 1464 aa40.96■■■■■ 4.15
MTMR4-209ENST00000583656 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.94■■■■■ 4.14
MTMR4-209ENST00000583656 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.94■■■■■ 4.14
MTMR4-209ENST00000583656 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.94■■■■■ 4.14
MTMR4-209ENST00000583656 ARHGEF11O15085 1522 aa40.93■■■■■ 4.14
MTMR4-209ENST00000583656 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.92■■■■■ 4.14
MTMR4-209ENST00000583656 IGF1RP08069 1367 aa40.88■■■■■ 4.14
MTMR4-209ENST00000583656 NUP160Q12769 1436 aa40.77■■■■■ 4.12
MTMR4-209ENST00000583656 CEP170Q5SW79 1584 aa40.76■■■■■ 4.12
MTMR4-209ENST00000583656 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.71■■■■■ 4.11
MTMR4-209ENST00000583656 CUL7Q14999 1698 aa40.66■■■■■ 4.1
MTMR4-209ENST00000583656 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.66■■■■■ 4.1
MTMR4-209ENST00000583656 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.65■■■■■ 4.1
MTMR4-209ENST00000583656 ARAP1Q96P48 1450 aa40.62■■■■■ 4.09
MTMR4-209ENST00000583656 JPH4Q96JJ6 628 aa40.46■■■■■ 4.07
MTMR4-209ENST00000583656 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.43■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 284.7 ms