RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576380.5

P4HB-222, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene P4HB, Length 943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HB-222ENST00000576380 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.52■■■■■ 5.52
P4HB-222ENST00000576380 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.07■■■■■ 4.65
P4HB-222ENST00000576380 ABCC9O60706 1549 aa43.5■■■■■ 4.55
P4HB-222ENST00000576380 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.67■■■■■ 4.26
P4HB-222ENST00000576380 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.63■■■■■ 4.25
P4HB-222ENST00000576380 NACADO15069 1562 aa41.57■■■■■ 4.25
P4HB-222ENST00000576380 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
P4HB-222ENST00000576380 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
P4HB-222ENST00000576380 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.93■■■■■ 4.14
P4HB-222ENST00000576380 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.74■■■■■ 4.11
P4HB-222ENST00000576380 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.69■■■■■ 4.1
P4HB-222ENST00000576380 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.46■■■■■ 4.07
P4HB-222ENST00000576380 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.36■■■■■ 4.05
P4HB-222ENST00000576380 SCRIBQ14160 1630 aa40.2■■■■■ 4.03
P4HB-222ENST00000576380 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.92■■■■□ 3.98
P4HB-222ENST00000576380 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.9
P4HB-222ENST00000576380 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.32■■■■□ 3.88
P4HB-222ENST00000576380 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.11■■■■□ 3.85
P4HB-222ENST00000576380 SMARCA4P51532 1647 aa38.44■■■■□ 3.74
P4HB-222ENST00000576380 NCAPD3P42695 1498 aa38.41■■■■□ 3.74
P4HB-222ENST00000576380 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.36■■■■□ 3.73
P4HB-222ENST00000576380 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
P4HB-222ENST00000576380 SMARCA2P51531 1590 aa38.25■■■■□ 3.71
P4HB-222ENST00000576380 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.16■■■■□ 3.7
P4HB-222ENST00000576380 HMGXB3Q12766 1538 aa38.1■■■■□ 3.69
P4HB-222ENST00000576380 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.08■■■■□ 3.69
P4HB-222ENST00000576380 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
P4HB-222ENST00000576380 WIZO95785 1651 aa37.72■■■■□ 3.63
P4HB-222ENST00000576380 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
P4HB-222ENST00000576380 NESP48681 1621 aa37.57■■■■□ 3.6
P4HB-222ENST00000576380 ERCC6Q03468 1493 aa37.48■■■■□ 3.59
P4HB-222ENST00000576380 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.38■■■■□ 3.58
P4HB-222ENST00000576380 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.29■■■■□ 3.56
P4HB-222ENST00000576380 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.55
P4HB-222ENST00000576380 CUX2O14529 1486 aa37.2■■■■□ 3.55
P4HB-222ENST00000576380 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.19■■■■□ 3.54
P4HB-222ENST00000576380 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.05■■■■□ 3.52
P4HB-222ENST00000576380 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
P4HB-222ENST00000576380 CFTRP13569 1480 aa36.97■■■■□ 3.51
P4HB-222ENST00000576380 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.9■■■■□ 3.5
P4HB-222ENST00000576380 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.81■■■■□ 3.48
P4HB-222ENST00000576380 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.78■■■■□ 3.48
P4HB-222ENST00000576380 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.75■■■■□ 3.47
P4HB-222ENST00000576380 WDR62O43379 1518 aa36.64■■■■□ 3.46
P4HB-222ENST00000576380 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.59■■■■□ 3.45
P4HB-222ENST00000576380 PRDM2Q13029 1718 aa36.57■■■■□ 3.45
P4HB-222ENST00000576380 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
P4HB-222ENST00000576380 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
P4HB-222ENST00000576380 ABCC8Q09428 1581 aa36.19■■■■□ 3.38
P4HB-222ENST00000576380 TOPBP1Q92547 1522 aa36.18■■■■□ 3.38
P4HB-222ENST00000576380 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.08■■■■□ 3.37
P4HB-222ENST00000576380 IFT140Q96RY7 1462 aa36.03■■■■□ 3.36
P4HB-222ENST00000576380 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
P4HB-222ENST00000576380 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
P4HB-222ENST00000576380 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
P4HB-222ENST00000576380 CUX1P39880 1505 aa35.79■■■■□ 3.32
P4HB-222ENST00000576380 SOGA1O94964 1423 aa35.77■■■■□ 3.32
P4HB-222ENST00000576380 OSCARQ8IYS5 282 aa35.76■■■■□ 3.32
P4HB-222ENST00000576380 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.73■■■■□ 3.31
P4HB-222ENST00000576380 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.72■■■■□ 3.31
P4HB-222ENST00000576380 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.71■■■■□ 3.315e-9■■■■□ 23.7
P4HB-222ENST00000576380 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
P4HB-222ENST00000576380 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
P4HB-222ENST00000576380 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.47■■■■□ 3.27
P4HB-222ENST00000576380 WDR97A6NE52 1622 aa35.45■■■■□ 3.27
P4HB-222ENST00000576380 TOP2BQ02880 1626 aa35.39■■■■□ 3.26
P4HB-222ENST00000576380 FBLN2P98095 1184 aa35.38■■■■□ 3.25
P4HB-222ENST00000576380 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.37■■■■□ 3.25
P4HB-222ENST00000576380 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.37■■■■□ 3.25
P4HB-222ENST00000576380 SYNJ1O43426 1573 aa35.35■■■■□ 3.25
P4HB-222ENST00000576380 GRIN2BQ13224 1484 aa35.33■■■■□ 3.25
P4HB-222ENST00000576380 CHD1O14646 1710 aa35.32■■■■□ 3.24
P4HB-222ENST00000576380 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.3■■■■□ 3.24
P4HB-222ENST00000576380 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.29■■■■□ 3.24
P4HB-222ENST00000576380 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
P4HB-222ENST00000576380 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
P4HB-222ENST00000576380 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.2■■■■□ 3.23
P4HB-222ENST00000576380 TRIM41Q8WV44 630 aa35.18■■■■□ 3.22
P4HB-222ENST00000576380 PBRM1Q86U86 1689 aa35.17■■■■□ 3.22
P4HB-222ENST00000576380 SYNJ2O15056 1496 aa35.13■■■■□ 3.21
P4HB-222ENST00000576380 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.07■■■■□ 3.21
P4HB-222ENST00000576380 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.07■■■■□ 3.21
P4HB-222ENST00000576380 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.07■■■■□ 3.21
P4HB-222ENST00000576380 ARHGEF11O15085 1522 aa35.03■■■■□ 3.2
P4HB-222ENST00000576380 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.93■■■■□ 3.18
P4HB-222ENST00000576380 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.92■■■■□ 3.18
P4HB-222ENST00000576380 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.89■■■■□ 3.18
P4HB-222ENST00000576380 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.86■■■■□ 3.17
P4HB-222ENST00000576380 ADAMTS12P58397 1594 aa34.86■■■■□ 3.17
P4HB-222ENST00000576380 GRIN2AQ12879 1464 aa34.85■■■■□ 3.17
P4HB-222ENST00000576380 KIF27Q86VH2 1401 aa34.75■■■■□ 3.15
P4HB-222ENST00000576380 IGF1RP08069 1367 aa34.74■■■■□ 3.15
P4HB-222ENST00000576380 NUP160Q12769 1436 aa34.73■■■■□ 3.15
P4HB-222ENST00000576380 ARAP1Q96P48 1450 aa34.73■■■■□ 3.15
P4HB-222ENST00000576380 CEP170Q5SW79 1584 aa34.69■■■■□ 3.14
P4HB-222ENST00000576380 CUL7Q14999 1698 aa34.5■■■■□ 3.11
P4HB-222ENST00000576380 JPH4Q96JJ6 628 aa34.5■■■■□ 3.11
P4HB-222ENST00000576380 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.49■■■■□ 3.11
P4HB-222ENST00000576380 SHROOM2Q13796 1616 aa34.48■■■■□ 3.11
P4HB-222ENST00000576380 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.46■■■■□ 3.11
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