RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555647.5

RPS6KL1-210, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 3,309 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-210ENST00000555647 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.55■■■□□ 2.16
RPS6KL1-210ENST00000555647 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.52■■□□□ 1.68
RPS6KL1-210ENST00000555647 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
RPS6KL1-210ENST00000555647 HRCP23327 699 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS6KL1-210ENST00000555647 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.93■■□□□ 1.58
RPS6KL1-210ENST00000555647 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.91■■□□□ 1.58
RPS6KL1-210ENST00000555647 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
RPS6KL1-210ENST00000555647 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.88■■□□□ 1.57
RPS6KL1-210ENST00000555647 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.7■■□□□ 1.54
RPS6KL1-210ENST00000555647 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.28■■□□□ 1.48
RPS6KL1-210ENST00000555647 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1-210ENST00000555647 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.04■■□□□ 1.44
RPS6KL1-210ENST00000555647 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
RPS6KL1-210ENST00000555647 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
RPS6KL1-210ENST00000555647 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1-210ENST00000555647 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RPS6KL1-210ENST00000555647 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.53■■□□□ 1.36
RPS6KL1-210ENST00000555647 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RPS6KL1-210ENST00000555647 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RPS6KL1-210ENST00000555647 TRIM41Q8WV44 630 aa23.28■■□□□ 1.32
RPS6KL1-210ENST00000555647 NEUROD1Q13562 356 aa23.22■■□□□ 1.31
RPS6KL1-210ENST00000555647 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1-210ENST00000555647 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1-210ENST00000555647 ABCC9O60706 1549 aa23.08■■□□□ 1.28
RPS6KL1-210ENST00000555647 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.05■■□□□ 1.28
RPS6KL1-210ENST00000555647 SCRIBQ14160 1630 aa23.02■■□□□ 1.28
RPS6KL1-210ENST00000555647 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
RPS6KL1-210ENST00000555647 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1-210ENST00000555647 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1-210ENST00000555647 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
RPS6KL1-210ENST00000555647 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
RPS6KL1-210ENST00000555647 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RPS6KL1-210ENST00000555647 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1-210ENST00000555647 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.59■■□□□ 1.21
RPS6KL1-210ENST00000555647 MYT1Q01538 1121 aa22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1-210ENST00000555647 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
RPS6KL1-210ENST00000555647 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
RPS6KL1-210ENST00000555647 MIER1Q8N108 512 aa22.41■■□□□ 1.18
RPS6KL1-210ENST00000555647 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.41■■□□□ 1.18
RPS6KL1-210ENST00000555647 WIZO95785 1651 aa22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1-210ENST00000555647 CEP162Q5TB80 1403 aa22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1-210ENST00000555647 ABCC8Q09428 1581 aa22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1-210ENST00000555647 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1-210ENST00000555647 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1-210ENST00000555647 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1-210ENST00000555647 SOGA1O94964 1423 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS6KL1-210ENST00000555647 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RPS6KL1-210ENST00000555647 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS6KL1-210ENST00000555647 NACADO15069 1562 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KL1-210ENST00000555647 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.08■■□□□ 1.12
RPS6KL1-210ENST00000555647 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.04■■□□□ 1.12
RPS6KL1-210ENST00000555647 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1-210ENST00000555647 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
RPS6KL1-210ENST00000555647 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.99■■□□□ 1.11
RPS6KL1-210ENST00000555647 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RPS6KL1-210ENST00000555647 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.8■■□□□ 1.08
RPS6KL1-210ENST00000555647 GOLGA3Q08378 1498 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KL1-210ENST00000555647 SMARCA2P51531 1590 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KL1-210ENST00000555647 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RPS6KL1-210ENST00000555647 KCNH8Q96L42 1107 aa21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1-210ENST00000555647 CLIP1P30622 1438 aa21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1-210ENST00000555647 EEA1Q15075 1411 aa21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1-210ENST00000555647 BCANQ96GW7 911 aa21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1-210ENST00000555647 APLP2Q06481 763 aa21.66■■□□□ 1.06
RPS6KL1-210ENST00000555647 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.66■■□□□ 1.06
RPS6KL1-210ENST00000555647 SMARCA4P51532 1647 aa21.61■■□□□ 1.05
RPS6KL1-210ENST00000555647 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1-210ENST00000555647 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1-210ENST00000555647 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1-210ENST00000555647 BCL11AQ9H165 835 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1-210ENST00000555647 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1-210ENST00000555647 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1-210ENST00000555647 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1-210ENST00000555647 SYNJ1O43426 1573 aa21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1-210ENST00000555647 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1-210ENST00000555647 KIF21BO75037 1637 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KL1-210ENST00000555647 ITGAEP38570 1179 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KL1-210ENST00000555647 FKBP8Q14318 412 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KL1-210ENST00000555647 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KL1-210ENST00000555647 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
RPS6KL1-210ENST00000555647 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
RPS6KL1-210ENST00000555647 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
RPS6KL1-210ENST00000555647 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
RPS6KL1-210ENST00000555647 TRIM52Q96A61 297 aa21.26■□□□□ 0.99
RPS6KL1-210ENST00000555647 ARAP1Q96P48 1450 aa21.23■□□□□ 0.99
RPS6KL1-210ENST00000555647 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.22■□□□□ 0.99
RPS6KL1-210ENST00000555647 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS6KL1-210ENST00000555647 MSH5O43196 834 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS6KL1-210ENST00000555647 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
RPS6KL1-210ENST00000555647 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.14■□□□□ 0.98
RPS6KL1-210ENST00000555647 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS6KL1-210ENST00000555647 NEFLP07196 543 aa21.12■□□□□ 0.97
RPS6KL1-210ENST00000555647 MAPKBP1O60336 1514 aa21.11■□□□□ 0.97
RPS6KL1-210ENST00000555647 WDR97A6NE52 1622 aa21.09■□□□□ 0.97
RPS6KL1-210ENST00000555647 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
RPS6KL1-210ENST00000555647 CUX2O14529 1486 aa21.06■□□□□ 0.96
RPS6KL1-210ENST00000555647 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
RPS6KL1-210ENST00000555647 PRXQ9BXM0 1461 aa21.02■□□□□ 0.96
RPS6KL1-210ENST00000555647 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
RPS6KL1-210ENST00000555647 P3H3Q8IVL6 736 aa20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms