RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.26■□□□□ 0.83
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POTEDQ86YR6 584 aa17.53■□□□□ 0.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXD1Q16676 465 aa17.35■□□□□ 0.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MSH5O43196 834 aa16.67■□□□□ 0.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.56■□□□□ 0.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADRA2BP18089 450 aa15.49■□□□□ 0.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.47■□□□□ 0.07
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.61□□□□□ -0.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF39Q9H2S5 420 aa14.08□□□□□ -0.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.06□□□□□ -0.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POTEHQ6S545 545 aa13.61□□□□□ -0.23
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.41□□□□□ -0.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.39□□□□□ -0.27
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DSG3P32926 999 aa12.91□□□□□ -0.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAPN15O75808 1086 aa12.83□□□□□ -0.36
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NISCHQ9Y2I1 1504 aa12.69□□□□□ -0.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNA4P22459 653 aa12.66□□□□□ -0.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APLP2Q06481 763 aa12.46□□□□□ -0.41
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCB7O75027 752 aa12.41□□□□□ -0.42
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHRDL2Q6WN34 429 aa12.41□□□□□ -0.42
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC4A2P04920 1241 aa12.06□□□□□ -0.48
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HAX1O00165 279 aa11.96□□□□□ -0.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AKT1S1Q96B36 256 aa11.95□□□□□ -0.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.92□□□□□ -0.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLA2Q14181 598 aa11.89□□□□□ -0.51
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZBTB22O15209 634 aa11.64□□□□□ -0.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EVX2Q03828 476 aa11.63□□□□□ -0.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.55□□□□□ -0.56
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OSCARQ8IYS5 282 aa11.53□□□□□ -0.56
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.5□□□□□ -0.57
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.4□□□□□ -0.58
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.23□□□□□ -0.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPDYE6P0CI01 402 aa11.23□□□□□ -0.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.23□□□□□ -0.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.21□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa11.2□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POTEIP0CG38 1075 aa11.1□□□□□ -0.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLCN6P51797 869 aa11.1□□□□□ -0.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBLN2P98095 1184 aa11.06□□□□□ -0.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHADLQ6NUI6 762 aa11.01□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.01□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POTEMA6NI47 508 aa10.97□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.95□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR29P0C7W0 189 aa10.94□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.94□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POTEGQ6S5H5 508 aa10.91□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OTUD5Q96G74 571 aa10.87□□□□□ -0.67
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POTEB2H3BUK9 544 aa10.7□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.7□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCC9O60706 1549 aa10.63□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCAF8L2P0C7V8 631 aa10.6□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAMSTRQ6ZN01 415 aa10.59□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa10.51□□□□□ -0.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
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