RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535765.5

VPS37B-203, Transcript of VPS37B, ESCRT-I subunit, humanhuman

TSL 3

Gene VPS37B, Length 879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37B-203ENST00000535765 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.24■■■■■ 6.75
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VPS37B-203ENST00000535765 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.73■■■■■ 5.23
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VPS37B-203ENST00000535765 SMARCA2P51531 1590 aa44.2■■■■■ 4.67
VPS37B-203ENST00000535765 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.08■■■■■ 4.65
VPS37B-203ENST00000535765 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.05■■■■■ 4.64
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VPS37B-203ENST00000535765 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.94■■■■■ 4.46
VPS37B-203ENST00000535765 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.72■■■■■ 4.43
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VPS37B-203ENST00000535765 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.62■■■■■ 4.41
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VPS37B-203ENST00000535765 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.49■■■■■ 4.39
VPS37B-203ENST00000535765 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.48■■■■■ 4.39
VPS37B-203ENST00000535765 PRDM2Q13029 1718 aa42.43■■■■■ 4.38
VPS37B-203ENST00000535765 WDR62O43379 1518 aa42.32■■■■■ 4.37
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VPS37B-203ENST00000535765 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
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VPS37B-203ENST00000535765 IFT140Q96RY7 1462 aa41.6■■■■■ 4.25
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VPS37B-203ENST00000535765 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.23■■■■■ 4.19
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VPS37B-203ENST00000535765 WDR97A6NE52 1622 aa41.07■■■■■ 4.16
VPS37B-203ENST00000535765 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.04■■■■■ 4.16
VPS37B-203ENST00000535765 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.03■■■■■ 4.16
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VPS37B-203ENST00000535765 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.71■■■■■ 4.11
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VPS37B-203ENST00000535765 TRIM41Q8WV44 630 aa40.7■■■■■ 4.11
VPS37B-203ENST00000535765 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
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VPS37B-203ENST00000535765 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.48■■■■■ 4.07
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VPS37B-203ENST00000535765 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.23■■■■■ 4.03
VPS37B-203ENST00000535765 KIF27Q86VH2 1401 aa40.21■■■■■ 4.03
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VPS37B-203ENST00000535765 CEP170Q5SW79 1584 aa40.03■■■■■ 4
VPS37B-203ENST00000535765 CUL7Q14999 1698 aa40.02■■■■■ 4
VPS37B-203ENST00000535765 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.82■■■■□ 3.96
VPS37B-203ENST00000535765 SHROOM2Q13796 1616 aa39.8■■■■□ 3.96
VPS37B-203ENST00000535765 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.76■■■■□ 3.95
VPS37B-203ENST00000535765 JPH4Q96JJ6 628 aa39.74■■■■□ 3.95
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