RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534385.1

ATP5L-208, Transcript of ATP synthase subunit g, mitochondrial, human

TSL 2

Gene ATP5L, Length 623 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP5L-208	ENST00000534385	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	20.68	■□□□□ 0.9
ATP5L-208	ENST00000534385	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		20.46	■□□□□ 0.87
ATP5L-208	ENST00000534385	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		18.72	■□□□□ 0.59
ATP5L-208	ENST00000534385	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	17.88	■□□□□ 0.45
ATP5L-208	ENST00000534385	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	17.76	■□□□□ 0.43
ATP5L-208	ENST00000534385	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		16.76	■□□□□ 0.27
ATP5L-208	ENST00000534385	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		16.6	■□□□□ 0.25
ATP5L-208	ENST00000534385	FOXD1	Q16676	465 aa		16.31	■□□□□ 0.2
ATP5L-208	ENST00000534385	ABCC9	O60706	1549 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ATP5L-208	ENST00000534385	ADRA2B	P18089	450 aa		15.75	■□□□□ 0.11
ATP5L-208	ENST00000534385	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ATP5L-208	ENST00000534385	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
ATP5L-208	ENST00000534385	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		15.58	■□□□□ 0.08
ATP5L-208	ENST00000534385	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		15.54	■□□□□ 0.08
ATP5L-208	ENST00000534385	NACAD	O15069	1562 aa		15.51	■□□□□ 0.07
ATP5L-208	ENST00000534385	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
ATP5L-208	ENST00000534385	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		15.46	■□□□□ 0.07
ATP5L-208	ENST00000534385	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		15.45	■□□□□ 0.06
ATP5L-208	ENST00000534385	MSH5	O43196	834 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ATP5L-208	ENST00000534385	SCRIB	Q14160	1630 aa		15.06	■□□□□ 0
ATP5L-208	ENST00000534385	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		15.05	■□□□□ -0
ATP5L-208	ENST00000534385	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		14.9	□□□□□ -0.02
ATP5L-208	ENST00000534385	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		14.87	□□□□□ -0.03
ATP5L-208	ENST00000534385	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	14.77	□□□□□ -0.05
ATP5L-208	ENST00000534385	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ATP5L-208	ENST00000534385	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
ATP5L-208	ENST00000534385	POTED	Q86YR6	584 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ATP5L-208	ENST00000534385	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ATP5L-208	ENST00000534385	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
ATP5L-208	ENST00000534385	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
ATP5L-208	ENST00000534385	SMARCA4	P51532	1647 aa		14.47	□□□□□ -0.09
ATP5L-208	ENST00000534385	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		14.46	□□□□□ -0.09
ATP5L-208	ENST00000534385	KCNA4	P22459	653 aa		14.43	□□□□□ -0.1
ATP5L-208	ENST00000534385	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		14.38	□□□□□ -0.11
ATP5L-208	ENST00000534385	SMARCA2	P51531	1590 aa		14.36	□□□□□ -0.11
ATP5L-208	ENST00000534385	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		14.35	□□□□□ -0.11
ATP5L-208	ENST00000534385	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		14.35	□□□□□ -0.11
ATP5L-208	ENST00000534385	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		14.34	□□□□□ -0.11
ATP5L-208	ENST00000534385	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.11
ATP5L-208	ENST00000534385	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		14.29	□□□□□ -0.12
ATP5L-208	ENST00000534385	NCAPD3	P42695	1498 aa		14.27	□□□□□ -0.12
ATP5L-208	ENST00000534385	WIZ	O95785	1651 aa		14.26	□□□□□ -0.13
ATP5L-208	ENST00000534385	HMGXB3	Q12766	1538 aa		14.25	□□□□□ -0.13
ATP5L-208	ENST00000534385	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
ATP5L-208	ENST00000534385	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
ATP5L-208	ENST00000534385	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
ATP5L-208	ENST00000534385	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
ATP5L-208	ENST00000534385	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		14.13	□□□□□ -0.15
ATP5L-208	ENST00000534385	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		14.12	□□□□□ -0.15
ATP5L-208	ENST00000534385	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
ATP5L-208	ENST00000534385	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
ATP5L-208	ENST00000534385	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ATP5L-208	ENST00000534385	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ATP5L-208	ENST00000534385	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5L-208	ENST00000534385	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ATP5L-208	ENST00000534385	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP5L-208	ENST00000534385	PRDM2	Q13029	1718 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP5L-208	ENST00000534385	CFTR	P13569	1480 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP5L-208	ENST00000534385	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP5L-208	ENST00000534385	NES	P48681	1621 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5L-208	ENST00000534385	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATP5L-208	ENST00000534385	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP5L-208	ENST00000534385	ERCC6	Q03468	1493 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP5L-208	ENST00000534385	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP5L-208	ENST00000534385	ABCC8	Q09428	1581 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATP5L-208	ENST00000534385	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5L-208	ENST00000534385	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24	2e-6	■■■□□ 15
ATP5L-208	ENST00000534385	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP5L-208	ENST00000534385	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATP5L-208	ENST00000534385	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP5L-208	ENST00000534385	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP5L-208	ENST00000534385	WDR62	O43379	1518 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP5L-208	ENST00000534385	TOP2B	Q02880	1626 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATP5L-208	ENST00000534385	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATP5L-208	ENST00000534385	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ATP5L-208	ENST00000534385	TOPBP1	Q92547	1522 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATP5L-208	ENST00000534385	CUX1	P39880	1505 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ATP5L-208	ENST00000534385	SYNJ1	O43426	1573 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATP5L-208	ENST00000534385	CUX2	O14529	1486 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ATP5L-208	ENST00000534385	TRIM41	Q8WV44	630 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ATP5L-208	ENST00000534385	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ATP5L-208	ENST00000534385	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ATP5L-208	ENST00000534385	IFT140	Q96RY7	1462 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATP5L-208	ENST00000534385	WDR97	A6NE52	1622 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATP5L-208	ENST00000534385	SOGA1	O94964	1423 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATP5L-208	ENST00000534385	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ATP5L-208	ENST00000534385	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ATP5L-208	ENST00000534385	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATP5L-208	ENST00000534385	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ATP5L-208	ENST00000534385	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28
ATP5L-208	ENST00000534385	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATP5L-208	ENST00000534385	EEA1	Q15075	1411 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATP5L-208	ENST00000534385	KIF27	Q86VH2	1401 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATP5L-208	ENST00000534385	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATP5L-208	ENST00000534385	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATP5L-208	ENST00000534385	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATP5L-208	ENST00000534385	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ATP5L-208	ENST00000534385	PBRM1	Q86U86	1689 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATP5L-208	ENST00000534385	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATP5L-208	ENST00000534385	ZBTB22	O15209	634 aa		13.2	□□□□□ -0.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.2 ms