RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533105.1

NDUFS3-210, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 4

Gene NDUFS3, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-210ENST00000533105 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.81■■■■■ 6.2
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NDUFS3-210ENST00000533105 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.4■■■■■ 4.86
NDUFS3-210ENST00000533105 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.34■■■■■ 4.85
NDUFS3-210ENST00000533105 NACADO15069 1562 aa45.22■■■■■ 4.83
NDUFS3-210ENST00000533105 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.75■■■■■ 4.76
NDUFS3-210ENST00000533105 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
NDUFS3-210ENST00000533105 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.43■■■■■ 4.7
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NDUFS3-210ENST00000533105 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.3■■■■■ 4.68
NDUFS3-210ENST00000533105 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.02■■■■■ 4.64
NDUFS3-210ENST00000533105 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.98■■■■■ 4.63
NDUFS3-210ENST00000533105 SCRIBQ14160 1630 aa43.84■■■■■ 4.61
NDUFS3-210ENST00000533105 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.46■■■■■ 4.55
NDUFS3-210ENST00000533105 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
NDUFS3-210ENST00000533105 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.86■■■■■ 4.45
NDUFS3-210ENST00000533105 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.68■■■■■ 4.42
NDUFS3-210ENST00000533105 SMARCA4P51532 1647 aa41.83■■■■■ 4.29
NDUFS3-210ENST00000533105 NCAPD3P42695 1498 aa41.75■■■■■ 4.27
NDUFS3-210ENST00000533105 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.73■■■■■ 4.27
NDUFS3-210ENST00000533105 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
NDUFS3-210ENST00000533105 SMARCA2P51531 1590 aa41.63■■■■■ 4.26
NDUFS3-210ENST00000533105 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.49■■■■■ 4.23
NDUFS3-210ENST00000533105 HMGXB3Q12766 1538 aa41.48■■■■■ 4.23
NDUFS3-210ENST00000533105 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
NDUFS3-210ENST00000533105 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.37■■■■■ 4.21
NDUFS3-210ENST00000533105 WIZO95785 1651 aa41.01■■■■■ 4.16
NDUFS3-210ENST00000533105 ERCC6Q03468 1493 aa40.96■■■■■ 4.15
NDUFS3-210ENST00000533105 NESP48681 1621 aa40.95■■■■■ 4.15
NDUFS3-210ENST00000533105 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
NDUFS3-210ENST00000533105 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.7■■■■■ 4.11
NDUFS3-210ENST00000533105 CUX2O14529 1486 aa40.59■■■■■ 4.09
NDUFS3-210ENST00000533105 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.56■■■■■ 4.08
NDUFS3-210ENST00000533105 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
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NDUFS3-210ENST00000533105 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.38■■■■■ 4.05
NDUFS3-210ENST00000533105 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
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NDUFS3-210ENST00000533105 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.1■■■■■ 4.01
NDUFS3-210ENST00000533105 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.1■■■■■ 4.01
NDUFS3-210ENST00000533105 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.09■■■■■ 4.01
NDUFS3-210ENST00000533105 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.07■■■■■ 4.01
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NDUFS3-210ENST00000533105 PRDM2Q13029 1718 aa39.76■■■■□ 3.96
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NDUFS3-210ENST00000533105 ABCC8Q09428 1581 aa39.33■■■■□ 3.89
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NDUFS3-210ENST00000533105 IFT140Q96RY7 1462 aa39.24■■■■□ 3.87
NDUFS3-210ENST00000533105 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
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NDUFS3-210ENST00000533105 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.92■■■■□ 3.82
NDUFS3-210ENST00000533105 SOGA1O94964 1423 aa38.9■■■■□ 3.82
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NDUFS3-210ENST00000533105 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.89■■■■□ 3.82
NDUFS3-210ENST00000533105 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
NDUFS3-210ENST00000533105 FBLN2P98095 1184 aa38.6■■■■□ 3.77
NDUFS3-210ENST00000533105 WDR97A6NE52 1622 aa38.57■■■■□ 3.77
NDUFS3-210ENST00000533105 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.56■■■■□ 3.76
NDUFS3-210ENST00000533105 TRIM41Q8WV44 630 aa38.53■■■■□ 3.76
NDUFS3-210ENST00000533105 CHD1O14646 1710 aa38.49■■■■□ 3.75
NDUFS3-210ENST00000533105 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.49■■■■□ 3.75
NDUFS3-210ENST00000533105 GRIN2BQ13224 1484 aa38.47■■■■□ 3.75
NDUFS3-210ENST00000533105 TOP2BQ02880 1626 aa38.46■■■■□ 3.75
NDUFS3-210ENST00000533105 SYNJ1O43426 1573 aa38.46■■■■□ 3.75
NDUFS3-210ENST00000533105 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.46■■■■□ 3.75
NDUFS3-210ENST00000533105 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.44■■■■□ 3.74
NDUFS3-210ENST00000533105 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.42■■■■□ 3.74
NDUFS3-210ENST00000533105 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
NDUFS3-210ENST00000533105 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
NDUFS3-210ENST00000533105 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.31■■■■□ 3.72
NDUFS3-210ENST00000533105 PBRM1Q86U86 1689 aa38.31■■■■□ 3.72
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NDUFS3-210ENST00000533105 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.98■■■■□ 3.67
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NDUFS3-210ENST00000533105 NUP160Q12769 1436 aa37.79■■■■□ 3.64
NDUFS3-210ENST00000533105 CEP170Q5SW79 1584 aa37.79■■■■□ 3.64
NDUFS3-210ENST00000533105 KIF27Q86VH2 1401 aa37.78■■■■□ 3.64
NDUFS3-210ENST00000533105 IGF1RP08069 1367 aa37.69■■■■□ 3.62
NDUFS3-210ENST00000533105 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.56■■■■□ 3.6
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NDUFS3-210ENST00000533105 SHROOM2Q13796 1616 aa37.51■■■■□ 3.6
NDUFS3-210ENST00000533105 JPH4Q96JJ6 628 aa37.48■■■■□ 3.59
NDUFS3-210ENST00000533105 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.47■■■■□ 3.59
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