RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516663.1

RNU6-521P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 521, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-521P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-521P-201ENST00000516663 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RNU6-521P-201ENST00000516663 POTEDQ86YR6 584 aa13.99□□□□□ -0.17
RNU6-521P-201ENST00000516663 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.86□□□□□ -0.19
RNU6-521P-201ENST00000516663 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 FOXD1Q16676 465 aa12.17□□□□□ -0.46
RNU6-521P-201ENST00000516663 MSH5O43196 834 aa11.94□□□□□ -0.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RNU6-521P-201ENST00000516663 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RNU6-521P-201ENST00000516663 POTEHQ6S545 545 aa10.72□□□□□ -0.69
RNU6-521P-201ENST00000516663 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.32□□□□□ -0.76
RNU6-521P-201ENST00000516663 ADRA2BP18089 450 aa10.23□□□□□ -0.77
RNU6-521P-201ENST00000516663 RNF39Q9H2S5 420 aa10.03□□□□□ -0.8
RNU6-521P-201ENST00000516663 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.98□□□□□ -0.81
RNU6-521P-201ENST00000516663 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RNU6-521P-201ENST00000516663 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RNU6-521P-201ENST00000516663 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.76□□□□□ -0.85
RNU6-521P-201ENST00000516663 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU6-521P-201ENST00000516663 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.49□□□□□ -0.89
RNU6-521P-201ENST00000516663 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RNU6-521P-201ENST00000516663 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RNU6-521P-201ENST00000516663 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
RNU6-521P-201ENST00000516663 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-521P-201ENST00000516663 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-521P-201ENST00000516663 DSG3P32926 999 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU6-521P-201ENST00000516663 LHX8Q68G74 356 aa8.8□□□□□ -1
RNU6-521P-201ENST00000516663 CAPN15O75808 1086 aa8.73□□□□□ -1.01
RNU6-521P-201ENST00000516663 HAX1O00165 279 aa8.71□□□□□ -1.02
RNU6-521P-201ENST00000516663 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
RNU6-521P-201ENST00000516663 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RNU6-521P-201ENST00000516663 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU6-521P-201ENST00000516663 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RNU6-521P-201ENST00000516663 EVX2Q03828 476 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-521P-201ENST00000516663 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-521P-201ENST00000516663 ABCB7O75027 752 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-521P-201ENST00000516663 POTEMA6NI47 508 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-521P-201ENST00000516663 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-521P-201ENST00000516663 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-521P-201ENST00000516663 POTEGQ6S5H5 508 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-521P-201ENST00000516663 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-521P-201ENST00000516663 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RNU6-521P-201ENST00000516663 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-521P-201ENST00000516663 GABBR2O75899 941 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RNU6-521P-201ENST00000516663 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
RNU6-521P-201ENST00000516663 AKT1S1Q96B36 256 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU6-521P-201ENST00000516663 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU6-521P-201ENST00000516663 POTEIP0CG38 1075 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-521P-201ENST00000516663 APLP2Q06481 763 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-521P-201ENST00000516663 OTUD5Q96G74 571 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-521P-201ENST00000516663 PITPNM1O00562 1244 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-521P-201ENST00000516663 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.93□□□□□ -1.14
RNU6-521P-201ENST00000516663 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RNU6-521P-201ENST00000516663 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-521P-201ENST00000516663 POLA2Q14181 598 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-521P-201ENST00000516663 POTEB2H3BUK9 544 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-521P-201ENST00000516663 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-521P-201ENST00000516663 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-521P-201ENST00000516663 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-521P-201ENST00000516663 MMRN1Q13201 1228 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-521P-201ENST00000516663 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-521P-201ENST00000516663 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-521P-201ENST00000516663 CLCN6P51797 869 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-521P-201ENST00000516663 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-521P-201ENST00000516663 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-521P-201ENST00000516663 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-521P-201ENST00000516663 OSCARQ8IYS5 282 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-521P-201ENST00000516663 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-521P-201ENST00000516663 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RNU6-521P-201ENST00000516663 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-521P-201ENST00000516663 CHADLQ6NUI6 762 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-521P-201ENST00000516663 SLC4A2P04920 1241 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-521P-201ENST00000516663 NPM3O75607 178 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-521P-201ENST00000516663 POTEJP0CG39 1038 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-521P-201ENST00000516663 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-521P-201ENST00000516663 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-521P-201ENST00000516663 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-521P-201ENST00000516663 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-521P-201ENST00000516663 METRNQ9UJH8 293 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-521P-201ENST00000516663 C7P10643 843 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-521P-201ENST00000516663 ST18O60284 1047 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-521P-201ENST00000516663 SLC39A7Q92504 469 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-521P-201ENST00000516663 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-521P-201ENST00000516663 PRR29P0C7W0 189 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-521P-201ENST00000516663 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-521P-201ENST00000516663 SPDYE6P0CI01 402 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-521P-201ENST00000516663 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-521P-201ENST00000516663 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-521P-201ENST00000516663 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-521P-201ENST00000516663 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-521P-201ENST00000516663 PHF12Q96QT6 1004 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-521P-201ENST00000516663 MARVELD3Q96A59 401 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-521P-201ENST00000516663 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-521P-201ENST00000516663 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-521P-201ENST00000516663 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-521P-201ENST00000516663 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-521P-201ENST00000516663 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms