RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516548.1

Y_RNA.686-201, humanhuman

BASIC

Gene Y_RNA, Length 134 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Y_RNA.686-201ENST00000516548 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
Y_RNA.686-201ENST00000516548 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.61■□□□□ 0.09
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
Y_RNA.686-201ENST00000516548 POTEDQ86YR6 584 aa13.46□□□□□ -0.25
Y_RNA.686-201ENST00000516548 FOXD1Q16676 465 aa13.41□□□□□ -0.26
Y_RNA.686-201ENST00000516548 MSH5O43196 834 aa12.83□□□□□ -0.36
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.07□□□□□ -0.48
Y_RNA.686-201ENST00000516548 ADRA2BP18089 450 aa12□□□□□ -0.49
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.97□□□□□ -0.49
Y_RNA.686-201ENST00000516548 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
Y_RNA.686-201ENST00000516548 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.28□□□□□ -0.6
Y_RNA.686-201ENST00000516548 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Y_RNA.686-201ENST00000516548 RNF39Q9H2S5 420 aa10.87□□□□□ -0.67
Y_RNA.686-201ENST00000516548 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.82□□□□□ -0.68
Y_RNA.686-201ENST00000516548 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Y_RNA.686-201ENST00000516548 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
Y_RNA.686-201ENST00000516548 POTEHQ6S545 545 aa10.45□□□□□ -0.74
Y_RNA.686-201ENST00000516548 DNAJC5BQ9UF47 199 aa10.45□□□□□ -0.74
Y_RNA.686-201ENST00000516548 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.39□□□□□ -0.75
Y_RNA.686-201ENST00000516548 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.36□□□□□ -0.75
Y_RNA.686-201ENST00000516548 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
Y_RNA.686-201ENST00000516548 DSG3P32926 999 aa9.97□□□□□ -0.81
Y_RNA.686-201ENST00000516548 CAPN15O75808 1086 aa9.89□□□□□ -0.83
Y_RNA.686-201ENST00000516548 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
Y_RNA.686-201ENST00000516548 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
Y_RNA.686-201ENST00000516548 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Y_RNA.686-201ENST00000516548 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
Y_RNA.686-201ENST00000516548 APLP2Q06481 763 aa9.58□□□□□ -0.88
Y_RNA.686-201ENST00000516548 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
Y_RNA.686-201ENST00000516548 ABCB7O75027 752 aa9.57□□□□□ -0.88
Y_RNA.686-201ENST00000516548 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Y_RNA.686-201ENST00000516548 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.56□□□□□ -0.88
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
Y_RNA.686-201ENST00000516548 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
Y_RNA.686-201ENST00000516548 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SLC4A2P04920 1241 aa9.37□□□□□ -0.91
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
Y_RNA.686-201ENST00000516548 AKT1S1Q96B36 256 aa9.22□□□□□ -0.93
Y_RNA.686-201ENST00000516548 HAX1O00165 279 aa9.2□□□□□ -0.94
Y_RNA.686-201ENST00000516548 POLA2Q14181 598 aa9.2□□□□□ -0.94
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.2□□□□□ -0.94
Y_RNA.686-201ENST00000516548 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
Y_RNA.686-201ENST00000516548 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
Y_RNA.686-201ENST00000516548 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PITPNM1O00562 1244 aa9□□□□□ -0.97
Y_RNA.686-201ENST00000516548 EVX2Q03828 476 aa9□□□□□ -0.97
Y_RNA.686-201ENST00000516548 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
Y_RNA.686-201ENST00000516548 KCNA4P22459 653 aa8.94□□□□□ -0.98
Y_RNA.686-201ENST00000516548 LHX8Q68G74 356 aa8.93□□□□□ -0.98
Y_RNA.686-201ENST00000516548 OSCARQ8IYS5 282 aa8.9□□□□□ -0.98
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.82□□□□□ -1
Y_RNA.686-201ENST00000516548 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.8□□□□□ -1
Y_RNA.686-201ENST00000516548 GABBR2O75899 941 aa8.8□□□□□ -1
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
Y_RNA.686-201ENST00000516548 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.67□□□□□ -1.02
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SPDYE6P0CI01 402 aa8.67□□□□□ -1.02
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.67□□□□□ -1.02
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
Y_RNA.686-201ENST00000516548 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.64□□□□□ -1.03
Y_RNA.686-201ENST00000516548 POTEIP0CG38 1075 aa8.58□□□□□ -1.04
Y_RNA.686-201ENST00000516548 CLCN6P51797 869 aa8.56□□□□□ -1.04
Y_RNA.686-201ENST00000516548 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.55□□□□□ -1.04
Y_RNA.686-201ENST00000516548 FBLN2P98095 1184 aa8.52□□□□□ -1.05
Y_RNA.686-201ENST00000516548 CHADLQ6NUI6 762 aa8.51□□□□□ -1.05
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.47□□□□□ -1.05
Y_RNA.686-201ENST00000516548 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
Y_RNA.686-201ENST00000516548 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.46□□□□□ -1.06
Y_RNA.686-201ENST00000516548 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PRR29P0C7W0 189 aa8.45□□□□□ -1.06
Y_RNA.686-201ENST00000516548 POTEMA6NI47 508 aa8.43□□□□□ -1.06
Y_RNA.686-201ENST00000516548 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.4□□□□□ -1.06
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.4□□□□□ -1.06
Y_RNA.686-201ENST00000516548 OTUD5Q96G74 571 aa8.39□□□□□ -1.07
Y_RNA.686-201ENST00000516548 POTEGQ6S5H5 508 aa8.38□□□□□ -1.07
Y_RNA.686-201ENST00000516548 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
Y_RNA.686-201ENST00000516548 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Y_RNA.686-201ENST00000516548 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
Y_RNA.686-201ENST00000516548 POTEB2H3BUK9 544 aa8.28□□□□□ -1.08
Y_RNA.686-201ENST00000516548 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.24□□□□□ -1.09
Y_RNA.686-201ENST00000516548 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
Y_RNA.686-201ENST00000516548 ZBTB22O15209 634 aa8.18□□□□□ -1.1
Y_RNA.686-201ENST00000516548 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.13□□□□□ -1.11
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
Y_RNA.686-201ENST00000516548 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
Y_RNA.686-201ENST00000516548 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
Y_RNA.686-201ENST00000516548 C7P10643 843 aa8.08□□□□□ -1.12
Y_RNA.686-201ENST00000516548 POTEJP0CG39 1038 aa8.07□□□□□ -1.12
Y_RNA.686-201ENST00000516548 CREBZFQ9NS37 354 aa8.07□□□□□ -1.12
Y_RNA.686-201ENST00000516548 METRNQ9UJH8 293 aa8.07□□□□□ -1.12
Y_RNA.686-201ENST00000516548 SLC39A7Q92504 469 aa8.06□□□□□ -1.12
Y_RNA.686-201ENST00000516548 PHF12Q96QT6 1004 aa8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms