RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513404.5

MTTP-210, Transcript of microsomal triglyceride transfer protein, humanhuman

TSL 4

Gene MTTP, Length 564 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTP-210ENST00000513404 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.73■■■□□ 2.19
MTTP-210ENST00000513404 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.6■■□□□ 1.69
MTTP-210ENST00000513404 ABCC9O60706 1549 aa25.25■■□□□ 1.63
MTTP-210ENST00000513404 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.21■■□□□ 1.47
MTTP-210ENST00000513404 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.15■■□□□ 1.46
MTTP-210ENST00000513404 NACADO15069 1562 aa24.13■■□□□ 1.45
MTTP-210ENST00000513404 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.93■■□□□ 1.42
MTTP-210ENST00000513404 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
MTTP-210ENST00000513404 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.75■■□□□ 1.39
MTTP-210ENST00000513404 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
MTTP-210ENST00000513404 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.59■■□□□ 1.37
MTTP-210ENST00000513404 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.44■■□□□ 1.34
MTTP-210ENST00000513404 SCRIBQ14160 1630 aa23.36■■□□□ 1.33
MTTP-210ENST00000513404 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.33■■□□□ 1.33
MTTP-210ENST00000513404 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.22■■□□□ 1.31
MTTP-210ENST00000513404 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
MTTP-210ENST00000513404 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.82■■□□□ 1.24
MTTP-210ENST00000513404 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.72■■□□□ 1.23
MTTP-210ENST00000513404 SMARCA4P51532 1647 aa22.31■■□□□ 1.16
MTTP-210ENST00000513404 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
MTTP-210ENST00000513404 NCAPD3P42695 1498 aa22.28■■□□□ 1.16
MTTP-210ENST00000513404 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.26■■□□□ 1.15
MTTP-210ENST00000513404 SMARCA2P51531 1590 aa22.23■■□□□ 1.15
MTTP-210ENST00000513404 HMGXB3Q12766 1538 aa22.14■■□□□ 1.13
MTTP-210ENST00000513404 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.12■■□□□ 1.13
MTTP-210ENST00000513404 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.09■■□□□ 1.13
MTTP-210ENST00000513404 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
MTTP-210ENST00000513404 WIZO95785 1651 aa21.87■■□□□ 1.09
MTTP-210ENST00000513404 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
MTTP-210ENST00000513404 ERCC6Q03468 1493 aa21.81■■□□□ 1.08
MTTP-210ENST00000513404 NESP48681 1621 aa21.78■■□□□ 1.08
MTTP-210ENST00000513404 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.71■■□□□ 1.07
MTTP-210ENST00000513404 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
MTTP-210ENST00000513404 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.63■■□□□ 1.05
MTTP-210ENST00000513404 CUX2O14529 1486 aa21.62■■□□□ 1.05
MTTP-210ENST00000513404 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.61■■□□□ 1.05
MTTP-210ENST00000513404 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.5■■□□□ 1.03
MTTP-210ENST00000513404 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
MTTP-210ENST00000513404 CFTRP13569 1480 aa21.45■■□□□ 1.02
MTTP-210ENST00000513404 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.4■■□□□ 1.02
MTTP-210ENST00000513404 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.38■■□□□ 1.01
MTTP-210ENST00000513404 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.38■■□□□ 1.01
MTTP-210ENST00000513404 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.37■■□□□ 1.01
MTTP-210ENST00000513404 WDR62O43379 1518 aa21.29■■□□□ 1
MTTP-210ENST00000513404 PRDM2Q13029 1718 aa21.22■□□□□ 0.99
MTTP-210ENST00000513404 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
MTTP-210ENST00000513404 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.18■□□□□ 0.98
MTTP-210ENST00000513404 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
MTTP-210ENST00000513404 ABCC8Q09428 1581 aa21.02■□□□□ 0.95
MTTP-210ENST00000513404 TOPBP1Q92547 1522 aa21■□□□□ 0.95
MTTP-210ENST00000513404 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.96■□□□□ 0.95
MTTP-210ENST00000513404 IFT140Q96RY7 1462 aa20.94■□□□□ 0.94
MTTP-210ENST00000513404 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
MTTP-210ENST00000513404 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
MTTP-210ENST00000513404 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
MTTP-210ENST00000513404 CUX1P39880 1505 aa20.77■□□□□ 0.92
MTTP-210ENST00000513404 SOGA1O94964 1423 aa20.76■□□□□ 0.91
MTTP-210ENST00000513404 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.75■□□□□ 0.91
MTTP-210ENST00000513404 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
MTTP-210ENST00000513404 OSCARQ8IYS5 282 aa20.73■□□□□ 0.91
MTTP-210ENST00000513404 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.73■□□□□ 0.91
MTTP-210ENST00000513404 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
MTTP-210ENST00000513404 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
MTTP-210ENST00000513404 WDR97A6NE52 1622 aa20.61■□□□□ 0.89
MTTP-210ENST00000513404 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
MTTP-210ENST00000513404 TOP2BQ02880 1626 aa20.55■□□□□ 0.88
MTTP-210ENST00000513404 FBLN2P98095 1184 aa20.54■□□□□ 0.88
MTTP-210ENST00000513404 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.53■□□□□ 0.88
MTTP-210ENST00000513404 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.53■□□□□ 0.88
MTTP-210ENST00000513404 SYNJ1O43426 1573 aa20.52■□□□□ 0.88
MTTP-210ENST00000513404 GRIN2BQ13224 1484 aa20.52■□□□□ 0.88
MTTP-210ENST00000513404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.51■□□□□ 0.87
MTTP-210ENST00000513404 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.5■□□□□ 0.87
MTTP-210ENST00000513404 CHD1O14646 1710 aa20.49■□□□□ 0.87
MTTP-210ENST00000513404 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
MTTP-210ENST00000513404 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
MTTP-210ENST00000513404 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.45■□□□□ 0.86
MTTP-210ENST00000513404 TRIM41Q8WV44 630 aa20.43■□□□□ 0.86
MTTP-210ENST00000513404 PBRM1Q86U86 1689 aa20.42■□□□□ 0.86
MTTP-210ENST00000513404 SYNJ2O15056 1496 aa20.41■□□□□ 0.86
MTTP-210ENST00000513404 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.36■□□□□ 0.85
MTTP-210ENST00000513404 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.36■□□□□ 0.85
MTTP-210ENST00000513404 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.36■□□□□ 0.85
MTTP-210ENST00000513404 ARHGEF11O15085 1522 aa20.34■□□□□ 0.85
MTTP-210ENST00000513404 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.28■□□□□ 0.84
MTTP-210ENST00000513404 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.28■□□□□ 0.84
MTTP-210ENST00000513404 ADAMTS12P58397 1594 aa20.27■□□□□ 0.84
MTTP-210ENST00000513404 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.27■□□□□ 0.83
MTTP-210ENST00000513404 GRIN2AQ12879 1464 aa20.24■□□□□ 0.83
MTTP-210ENST00000513404 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.21■□□□□ 0.83
MTTP-210ENST00000513404 KIF27Q86VH2 1401 aa20.19■□□□□ 0.82
MTTP-210ENST00000513404 ARAP1Q96P48 1450 aa20.17■□□□□ 0.82
MTTP-210ENST00000513404 NUP160Q12769 1436 aa20.16■□□□□ 0.82
MTTP-210ENST00000513404 CEP170Q5SW79 1584 aa20.14■□□□□ 0.81
MTTP-210ENST00000513404 IGF1RP08069 1367 aa20.12■□□□□ 0.81
MTTP-210ENST00000513404 CUL7Q14999 1698 aa20.07■□□□□ 0.8
MTTP-210ENST00000513404 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.01■□□□□ 0.79
MTTP-210ENST00000513404 SHROOM2Q13796 1616 aa20.01■□□□□ 0.79
MTTP-210ENST00000513404 JPH4Q96JJ6 628 aa19.99■□□□□ 0.79
MTTP-210ENST00000513404 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.99■□□□□ 0.79
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