RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE4D-208ENST00000502484 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.07■□□□□ 0
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PDE4D-208ENST00000502484 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.06□□□□□ -0.16
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PDE4D-208ENST00000502484 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.97□□□□□ -0.17
PDE4D-208ENST00000502484 SMARCA4P51532 1647 aa13.95□□□□□ -0.18
PDE4D-208ENST00000502484 WIZO95785 1651 aa13.94□□□□□ -0.18
PDE4D-208ENST00000502484 SMARCA2P51531 1590 aa13.82□□□□□ -0.2
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PDE4D-208ENST00000502484 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.79□□□□□ -0.2
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PDE4D-208ENST00000502484 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PDE4D-208ENST00000502484 HMGXB3Q12766 1538 aa13.72□□□□□ -0.21
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PDE4D-208ENST00000502484 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.42□□□□□ -0.26
PDE4D-208ENST00000502484 NESP48681 1621 aa13.42□□□□□ -0.26
PDE4D-208ENST00000502484 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.4□□□□□ -0.26
PDE4D-208ENST00000502484 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4D-208ENST00000502484 CFTRP13569 1480 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4D-208ENST00000502484 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PDE4D-208ENST00000502484 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.31□□□□□ -0.28
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PDE4D-208ENST00000502484 PRDM2Q13029 1718 aa13.29□□□□□ -0.28
PDE4D-208ENST00000502484 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
PDE4D-208ENST00000502484 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.27□□□□□ -0.28
PDE4D-208ENST00000502484 SYNJ1O43426 1573 aa13.26□□□□□ -0.29
PDE4D-208ENST00000502484 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.26□□□□□ -0.29
PDE4D-208ENST00000502484 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.22□□□□□ -0.29
PDE4D-208ENST00000502484 EEA1Q15075 1411 aa13.21□□□□□ -0.29
PDE4D-208ENST00000502484 SOGA1O94964 1423 aa13.2□□□□□ -0.3
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PDE4D-208ENST00000502484 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.19□□□□□ -0.3
PDE4D-208ENST00000502484 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.15□□□□□ -0.3
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PDE4D-208ENST00000502484 WDR62O43379 1518 aa13.09□□□□□ -0.31
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PDE4D-208ENST00000502484 KIF21BO75037 1637 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4D-208ENST00000502484 TOPBP1Q92547 1522 aa13.05□□□□□ -0.32
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PDE4D-208ENST00000502484 CEP162Q5TB80 1403 aa12.99□□□□□ -0.33
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PDE4D-208ENST00000502484 IFT140Q96RY7 1462 aa12.92□□□□□ -0.34
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PDE4D-208ENST00000502484 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.91□□□□□ -0.34
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PDE4D-208ENST00000502484 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
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PDE4D-208ENST00000502484 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
PDE4D-208ENST00000502484 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.76□□□□□ -0.37
PDE4D-208ENST00000502484 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.76□□□□□ -0.37
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PDE4D-208ENST00000502484 CUL7Q14999 1698 aa12.72□□□□□ -0.37
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