RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.12■□□□□ 0.49
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.93■□□□□ 0.14
PDE4D-208ENST00000502484 ABCC9O60706 1549 aa15.44■□□□□ 0.06
PDE4D-208ENST00000502484 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.07■□□□□ 0
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.99□□□□□ -0.01
PDE4D-208ENST00000502484 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PDE4D-208ENST00000502484 NACADO15069 1562 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4D-208ENST00000502484 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4D-208ENST00000502484 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-208ENST00000502484 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-208ENST00000502484 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4D-208ENST00000502484 SCRIBQ14160 1630 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4D-208ENST00000502484 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
PDE4D-208ENST00000502484 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.45□□□□□ -0.1
PDE4D-208ENST00000502484 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
PDE4D-208ENST00000502484 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.33□□□□□ -0.12
PDE4D-208ENST00000502484 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
PDE4D-208ENST00000502484 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
PDE4D-208ENST00000502484 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.06□□□□□ -0.16
PDE4D-208ENST00000502484 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.01□□□□□ -0.17
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.99□□□□□ -0.17
PDE4D-208ENST00000502484 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
PDE4D-208ENST00000502484 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.97□□□□□ -0.17
PDE4D-208ENST00000502484 SMARCA4P51532 1647 aa13.95□□□□□ -0.18
PDE4D-208ENST00000502484 WIZO95785 1651 aa13.94□□□□□ -0.18
PDE4D-208ENST00000502484 SMARCA2P51531 1590 aa13.82□□□□□ -0.2
PDE4D-208ENST00000502484 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.82□□□□□ -0.2
PDE4D-208ENST00000502484 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.79□□□□□ -0.2
PDE4D-208ENST00000502484 NCAPD3P42695 1498 aa13.77□□□□□ -0.2
PDE4D-208ENST00000502484 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
PDE4D-208ENST00000502484 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PDE4D-208ENST00000502484 HMGXB3Q12766 1538 aa13.72□□□□□ -0.21
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.63□□□□□ -0.23
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM41Q8WV44 630 aa13.56□□□□□ -0.24
PDE4D-208ENST00000502484 ABCC8Q09428 1581 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4D-208ENST00000502484 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.42□□□□□ -0.26
PDE4D-208ENST00000502484 NESP48681 1621 aa13.42□□□□□ -0.26
PDE4D-208ENST00000502484 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.4□□□□□ -0.26
PDE4D-208ENST00000502484 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4D-208ENST00000502484 CFTRP13569 1480 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4D-208ENST00000502484 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PDE4D-208ENST00000502484 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.31□□□□□ -0.28
PDE4D-208ENST00000502484 ERCC6Q03468 1493 aa13.31□□□□□ -0.28
PDE4D-208ENST00000502484 PRDM2Q13029 1718 aa13.29□□□□□ -0.28
PDE4D-208ENST00000502484 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
PDE4D-208ENST00000502484 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.27□□□□□ -0.28
PDE4D-208ENST00000502484 SYNJ1O43426 1573 aa13.26□□□□□ -0.29
PDE4D-208ENST00000502484 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.26□□□□□ -0.29
PDE4D-208ENST00000502484 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.22□□□□□ -0.29
PDE4D-208ENST00000502484 EEA1Q15075 1411 aa13.21□□□□□ -0.29
PDE4D-208ENST00000502484 SOGA1O94964 1423 aa13.2□□□□□ -0.3
PDE4D-208ENST00000502484 TOP2BQ02880 1626 aa13.19□□□□□ -0.3
PDE4D-208ENST00000502484 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.19□□□□□ -0.3
PDE4D-208ENST00000502484 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.15□□□□□ -0.3
PDE4D-208ENST00000502484 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.15□□□□□ -0.31
PDE4D-208ENST00000502484 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PDE4D-208ENST00000502484 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.11□□□□□ -0.31
PDE4D-208ENST00000502484 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PDE4D-208ENST00000502484 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.1□□□□□ -0.31
PDE4D-208ENST00000502484 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PDE4D-208ENST00000502484 WDR62O43379 1518 aa13.09□□□□□ -0.31
PDE4D-208ENST00000502484 CUX1P39880 1505 aa13.08□□□□□ -0.31
PDE4D-208ENST00000502484 KIF21BO75037 1637 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4D-208ENST00000502484 TOPBP1Q92547 1522 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4D-208ENST00000502484 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4D-208ENST00000502484 CUX2O14529 1486 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA3Q08378 1498 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4D-208ENST00000502484 TNIKQ9UKE5 1360 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4D-208ENST00000502484 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.04□□□□□ -0.32
PDE4D-208ENST00000502484 CEP162Q5TB80 1403 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PDE4D-208ENST00000502484 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
PDE4D-208ENST00000502484 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.96□□□□□ -0.34
PDE4D-208ENST00000502484 UBTFP17480 764 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PDE4D-208ENST00000502484 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.93□□□□□ -0.34
PDE4D-208ENST00000502484 KIF27Q86VH2 1401 aa12.92□□□□□ -0.34
PDE4D-208ENST00000502484 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.92□□□□□ -0.34
PDE4D-208ENST00000502484 IFT140Q96RY7 1462 aa12.92□□□□□ -0.34
PDE4D-208ENST00000502484 PRXQ9BXM0 1461 aa12.91□□□□□ -0.34
PDE4D-208ENST00000502484 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.91□□□□□ -0.34
PDE4D-208ENST00000502484 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PDE4D-208ENST00000502484 HRCP23327 699 aa12.85□□□□□ -0.35
PDE4D-208ENST00000502484 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PDE4D-208ENST00000502484 CLIP1P30622 1438 aa12.84□□□□□ -0.35
PDE4D-208ENST00000502484 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.83□□□□□ -0.36
PDE4D-208ENST00000502484 WDR97A6NE52 1622 aa12.83□□□□□ -0.36
PDE4D-208ENST00000502484 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.36
PDE4D-208ENST00000502484 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PDE4D-208ENST00000502484 IGF1RP08069 1367 aa12.79□□□□□ -0.36
PDE4D-208ENST00000502484 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.78□□□□□ -0.36
PDE4D-208ENST00000502484 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
PDE4D-208ENST00000502484 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.76□□□□□ -0.37
PDE4D-208ENST00000502484 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.76□□□□□ -0.37
PDE4D-208ENST00000502484 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PDE4D-208ENST00000502484 PBRM1Q86U86 1689 aa12.74□□□□□ -0.37
PDE4D-208ENST00000502484 GRIN2BQ13224 1484 aa12.74□□□□□ -0.37
PDE4D-208ENST00000502484 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.73□□□□□ -0.37
PDE4D-208ENST00000502484 CUL7Q14999 1698 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms