RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.5■■■■■ 4.23
CTDSP1-215ENST00000498160 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.75■■■■□ 3.47
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCC9O60706 1549 aa35.18■■■■□ 3.22
CTDSP1-215ENST00000498160 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
CTDSP1-215ENST00000498160 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDSP1-215ENST00000498160 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDSP1-215ENST00000498160 NACADO15069 1562 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDSP1-215ENST00000498160 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDSP1-215ENST00000498160 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDSP1-215ENST00000498160 SCRIBQ14160 1630 aa33.41■■■□□ 2.94
CTDSP1-215ENST00000498160 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.37■■■□□ 2.93
CTDSP1-215ENST00000498160 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.08■■■□□ 2.89
CTDSP1-215ENST00000498160 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.06■■■□□ 2.88
CTDSP1-215ENST00000498160 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.9■■■□□ 2.86
CTDSP1-215ENST00000498160 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
CTDSP1-215ENST00000498160 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
CTDSP1-215ENST00000498160 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDSP1-215ENST00000498160 SMARCA4P51532 1647 aa32.08■■■□□ 2.73
CTDSP1-215ENST00000498160 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDSP1-215ENST00000498160 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDSP1-215ENST00000498160 SMARCA2P51531 1590 aa31.84■■■□□ 2.69
CTDSP1-215ENST00000498160 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.83■■■□□ 2.69
CTDSP1-215ENST00000498160 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
CTDSP1-215ENST00000498160 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDSP1-215ENST00000498160 NCAPD3P42695 1498 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDSP1-215ENST00000498160 HMGXB3Q12766 1538 aa31.64■■■□□ 2.66
CTDSP1-215ENST00000498160 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.62■■■□□ 2.65
CTDSP1-215ENST00000498160 WIZO95785 1651 aa31.6■■■□□ 2.65
CTDSP1-215ENST00000498160 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
CTDSP1-215ENST00000498160 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
CTDSP1-215ENST00000498160 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CTDSP1-215ENST00000498160 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.96■■■□□ 2.55
CTDSP1-215ENST00000498160 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.8■■■□□ 2.52
CTDSP1-215ENST00000498160 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.78■■■□□ 2.52
CTDSP1-215ENST00000498160 CFTRP13569 1480 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDSP1-215ENST00000498160 PRDM2Q13029 1718 aa30.61■■■□□ 2.49
CTDSP1-215ENST00000498160 NESP48681 1621 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDSP1-215ENST00000498160 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDSP1-215ENST00000498160 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.4■■■□□ 2.46
CTDSP1-215ENST00000498160 ERCC6Q03468 1493 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDSP1-215ENST00000498160 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDSP1-215ENST00000498160 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.31■■■□□ 2.44
CTDSP1-215ENST00000498160 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCC8Q09428 1581 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDSP1-215ENST00000498160 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CTDSP1-215ENST00000498160 WDR62O43379 1518 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDSP1-215ENST00000498160 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDSP1-215ENST00000498160 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
CTDSP1-215ENST00000498160 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTDSP1-215ENST00000498160 TOPBP1Q92547 1522 aa29.98■■■□□ 2.39
CTDSP1-215ENST00000498160 CUX2O14529 1486 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDSP1-215ENST00000498160 CUX1P39880 1505 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDSP1-215ENST00000498160 TOP2BQ02880 1626 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDSP1-215ENST00000498160 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDSP1-215ENST00000498160 SYNJ1O43426 1573 aa29.84■■■□□ 2.37
CTDSP1-215ENST00000498160 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDSP1-215ENST00000498160 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CTDSP1-215ENST00000498160 IFT140Q96RY7 1462 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDSP1-215ENST00000498160 TRIM41Q8WV44 630 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDSP1-215ENST00000498160 SOGA1O94964 1423 aa29.65■■■□□ 2.34
CTDSP1-215ENST00000498160 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.64■■■□□ 2.34
CTDSP1-215ENST00000498160 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CTDSP1-215ENST00000498160 WDR97A6NE52 1622 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.57■■■□□ 2.32
CTDSP1-215ENST00000498160 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDSP1-215ENST00000498160 KIF27Q86VH2 1401 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDSP1-215ENST00000498160 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CTDSP1-215ENST00000498160 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDSP1-215ENST00000498160 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CTDSP1-215ENST00000498160 EEA1Q15075 1411 aa29.32■■■□□ 2.28
CTDSP1-215ENST00000498160 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.286e-12■■■■■ 82.1
CTDSP1-215ENST00000498160 GRIN2BQ13224 1484 aa29.29■■■□□ 2.28
CTDSP1-215ENST00000498160 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.26■■■□□ 2.27
CTDSP1-215ENST00000498160 PBRM1Q86U86 1689 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDSP1-215ENST00000498160 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CTDSP1-215ENST00000498160 CUL7Q14999 1698 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDSP1-215ENST00000498160 IGF1RP08069 1367 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDSP1-215ENST00000498160 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDSP1-215ENST00000498160 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDSP1-215ENST00000498160 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDSP1-215ENST00000498160 ADAMTS12P58397 1594 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDSP1-215ENST00000498160 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDSP1-215ENST00000498160 SYNJ2O15056 1496 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDSP1-215ENST00000498160 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDSP1-215ENST00000498160 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CTDSP1-215ENST00000498160 PRXQ9BXM0 1461 aa28.92■■■□□ 2.22
CTDSP1-215ENST00000498160 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDSP1-215ENST00000498160 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CTDSP1-215ENST00000498160 GRIN2AQ12879 1464 aa28.88■■■□□ 2.21
CTDSP1-215ENST00000498160 KIF21BO75037 1637 aa28.87■■■□□ 2.21
CTDSP1-215ENST00000498160 CHD1O14646 1710 aa28.86■■■□□ 2.21
CTDSP1-215ENST00000498160 FBLN2P98095 1184 aa28.84■■■□□ 2.21
CTDSP1-215ENST00000498160 GOLGA3Q08378 1498 aa28.75■■■□□ 2.19
CTDSP1-215ENST00000498160 NUP160Q12769 1436 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDSP1-215ENST00000498160 OSCARQ8IYS5 282 aa28.71■■■□□ 2.19
CTDSP1-215ENST00000498160 CEP170Q5SW79 1584 aa28.66■■■□□ 2.18
CTDSP1-215ENST00000498160 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDSP1-215ENST00000498160 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.62■■■□□ 2.17
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