RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDSP1-215ENST00000498160 IQGAP2Q13576 1575 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDSP1-215ENST00000498160 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CTDSP1-215ENST00000498160 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDSP1-215ENST00000498160 SHROOM2Q13796 1616 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDSP1-215ENST00000498160 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.42■■■□□ 2.14
CTDSP1-215ENST00000498160 JPH4Q96JJ6 628 aa28.41■■■□□ 2.14
CTDSP1-215ENST00000498160 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDSP1-215ENST00000498160 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDSP1-215ENST00000498160 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.33■■■□□ 2.13
CTDSP1-215ENST00000498160 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.31■■■□□ 2.12
CTDSP1-215ENST00000498160 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CTDSP1-215ENST00000498160 SAMD9Q5K651 1589 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDSP1-215ENST00000498160 KIAA0556O60303 1618 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDSP1-215ENST00000498160 DISP1Q96F81 1524 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDSP1-215ENST00000498160 ARHGEF11O15085 1522 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDSP1-215ENST00000498160 CLIP1P30622 1438 aa28.2■■■□□ 2.11
CTDSP1-215ENST00000498160 CEP162Q5TB80 1403 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDSP1-215ENST00000498160 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDSP1-215ENST00000498160 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-215ENST00000498160 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-215ENST00000498160 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-215ENST00000498160 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.14■■■□□ 2.09
CTDSP1-215ENST00000498160 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDSP1-215ENST00000498160 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CTDSP1-215ENST00000498160 PTPRGP23470 1445 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDSP1-215ENST00000498160 FMN1Q68DA7 1419 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDSP1-215ENST00000498160 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDSP1-215ENST00000498160 ARAP1Q96P48 1450 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDSP1-215ENST00000498160 P3H3Q8IVL6 736 aa28■■■□□ 2.07
CTDSP1-215ENST00000498160 UACAQ9BZF9 1416 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDSP1-215ENST00000498160 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCA8O94911 1581 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDSP1-215ENST00000498160 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.89■■■□□ 2.05
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCC2Q92887 1545 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDSP1-215ENST00000498160 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDSP1-215ENST00000498160 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDSP1-215ENST00000498160 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDSP1-215ENST00000498160 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDSP1-215ENST00000498160 HECW1Q76N89 1606 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDSP1-215ENST00000498160 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDSP1-215ENST00000498160 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDSP1-215ENST00000498160 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDSP1-215ENST00000498160 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
CTDSP1-215ENST00000498160 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.03
CTDSP1-215ENST00000498160 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.74■■■□□ 2.03
CTDSP1-215ENST00000498160 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.73■■■□□ 2.03
CTDSP1-215ENST00000498160 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
CTDSP1-215ENST00000498160 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CTDSP1-215ENST00000498160 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CTDSP1-215ENST00000498160 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
CTDSP1-215ENST00000498160 ATP10BO94823 1461 aa27.63■■■□□ 2.01
CTDSP1-215ENST00000498160 MAP3K1Q13233 1512 aa27.62■■■□□ 2.01
CTDSP1-215ENST00000498160 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CTDSP1-215ENST00000498160 APLP2Q06481 763 aa27.61■■■□□ 2.01
CTDSP1-215ENST00000498160 MAPKBP1O60336 1514 aa27.6■■■□□ 2.01
CTDSP1-215ENST00000498160 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
CTDSP1-215ENST00000498160 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CTDSP1-215ENST00000498160 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.56■■■□□ 2
CTDSP1-215ENST00000498160 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CTDSP1-215ENST00000498160 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.55■■■□□ 2
CTDSP1-215ENST00000498160 TIAM1Q13009 1591 aa27.53■■■□□ 2
CTDSP1-215ENST00000498160 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.52■■■□□ 2
CTDSP1-215ENST00000498160 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDSP1-215ENST00000498160 ASXL2Q76L83 1435 aa27.49■■□□□ 1.99
CTDSP1-215ENST00000498160 ARID3CA6NKF2 412 aa27.48■■□□□ 1.99
CTDSP1-215ENST00000498160 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
CTDSP1-215ENST00000498160 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.45■■□□□ 1.98
CTDSP1-215ENST00000498160 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.44■■□□□ 1.98
CTDSP1-215ENST00000498160 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDSP1-215ENST00000498160 KIF14Q15058 1648 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDSP1-215ENST00000498160 GLI2P10070 1586 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDSP1-215ENST00000498160 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.33■■□□□ 1.97
CTDSP1-215ENST00000498160 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CTDSP1-215ENST00000498160 DIP2BQ9P265 1576 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDSP1-215ENST00000498160 KCNH8Q96L42 1107 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDSP1-215ENST00000498160 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CTDSP1-215ENST00000498160 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.953e-9■■■■■ 48.7
CTDSP1-215ENST00000498160 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDSP1-215ENST00000498160 NCOA2Q15596 1464 aa27.2■■□□□ 1.95
CTDSP1-215ENST00000498160 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.2■■□□□ 1.94
CTDSP1-215ENST00000498160 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDSP1-215ENST00000498160 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDSP1-215ENST00000498160 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDSP1-215ENST00000498160 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDSP1-215ENST00000498160 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDSP1-215ENST00000498160 CD109Q6YHK3 1445 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDSP1-215ENST00000498160 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDSP1-215ENST00000498160 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CTDSP1-215ENST00000498160 PLCH2O75038 1416 aa27.12■■□□□ 1.93
CTDSP1-215ENST00000498160 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.12■■□□□ 1.93
CTDSP1-215ENST00000498160 PREX2Q70Z35 1606 aa27.12■■□□□ 1.93
CTDSP1-215ENST00000498160 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.1■■□□□ 1.93
CTDSP1-215ENST00000498160 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.08■■□□□ 1.93
CTDSP1-215ENST00000498160 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.08■■□□□ 1.93
CTDSP1-215ENST00000498160 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CTDSP1-215ENST00000498160 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.07■■□□□ 1.92
CTDSP1-215ENST00000498160 MIA2Q96PC5 1412 aa27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms