RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489719.1

ABCF3-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily F member 3, humanhuman

TSL 4

Gene ABCF3, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3-217ENST00000489719 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.48■■■■■ 4.55
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ABCF3-217ENST00000489719 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.66■■■■□ 3.46
ABCF3-217ENST00000489719 NACADO15069 1562 aa36.54■■■■□ 3.44
ABCF3-217ENST00000489719 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.18■■■■□ 3.38
ABCF3-217ENST00000489719 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
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ABCF3-217ENST00000489719 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.91■■■■□ 3.34
ABCF3-217ENST00000489719 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.59■■■■□ 3.29
ABCF3-217ENST00000489719 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.58■■■■□ 3.29
ABCF3-217ENST00000489719 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.48■■■■□ 3.27
ABCF3-217ENST00000489719 SCRIBQ14160 1630 aa35.32■■■■□ 3.25
ABCF3-217ENST00000489719 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.11■■■■□ 3.21
ABCF3-217ENST00000489719 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
ABCF3-217ENST00000489719 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.56■■■■□ 3.12
ABCF3-217ENST00000489719 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.5■■■■□ 3.11
ABCF3-217ENST00000489719 NCAPD3P42695 1498 aa33.79■■■■□ 3
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ABCF3-217ENST00000489719 SMARCA2P51531 1590 aa33.64■■■□□ 2.98
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ABCF3-217ENST00000489719 ERCC6Q03468 1493 aa33.12■■■□□ 2.89
ABCF3-217ENST00000489719 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
ABCF3-217ENST00000489719 WIZO95785 1651 aa33.05■■■□□ 2.88
ABCF3-217ENST00000489719 NESP48681 1621 aa33.04■■■□□ 2.88
ABCF3-217ENST00000489719 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.86■■■□□ 2.85
ABCF3-217ENST00000489719 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.84■■■□□ 2.85
ABCF3-217ENST00000489719 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.81■■■□□ 2.84
ABCF3-217ENST00000489719 CUX2O14529 1486 aa32.8■■■□□ 2.84
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ABCF3-217ENST00000489719 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.47■■■□□ 2.79
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ABCF3-217ENST00000489719 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.39■■■□□ 2.78
ABCF3-217ENST00000489719 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.38■■■□□ 2.77
ABCF3-217ENST00000489719 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.37■■■□□ 2.77
ABCF3-217ENST00000489719 WDR62O43379 1518 aa32.22■■■□□ 2.75
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ABCF3-217ENST00000489719 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
ABCF3-217ENST00000489719 PRDM2Q13029 1718 aa31.94■■■□□ 2.7
ABCF3-217ENST00000489719 ABCC8Q09428 1581 aa31.85■■■□□ 2.69
ABCF3-217ENST00000489719 TOPBP1Q92547 1522 aa31.81■■■□□ 2.68
ABCF3-217ENST00000489719 IFT140Q96RY7 1462 aa31.73■■■□□ 2.67
ABCF3-217ENST00000489719 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.7■■■□□ 2.67
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ABCF3-217ENST00000489719 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
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ABCF3-217ENST00000489719 FBLN2P98095 1184 aa31.3■■■□□ 2.6
ABCF3-217ENST00000489719 TRIM41Q8WV44 630 aa31.21■■■□□ 2.59
ABCF3-217ENST00000489719 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.19■■■□□ 2.58
ABCF3-217ENST00000489719 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
ABCF3-217ENST00000489719 WDR97A6NE52 1622 aa31.13■■■□□ 2.57
ABCF3-217ENST00000489719 GRIN2BQ13224 1484 aa31.11■■■□□ 2.57
ABCF3-217ENST00000489719 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.08■■■□□ 2.57
ABCF3-217ENST00000489719 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.08■■■□□ 2.57
ABCF3-217ENST00000489719 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.08■■■□□ 2.57
ABCF3-217ENST00000489719 TOP2BQ02880 1626 aa31.03■■■□□ 2.56
ABCF3-217ENST00000489719 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
ABCF3-217ENST00000489719 SYNJ1O43426 1573 aa30.99■■■□□ 2.55
ABCF3-217ENST00000489719 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.96■■■□□ 2.55
ABCF3-217ENST00000489719 CHD1O14646 1710 aa30.95■■■□□ 2.55
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ABCF3-217ENST00000489719 ARHGEF11O15085 1522 aa30.87■■■□□ 2.53
ABCF3-217ENST00000489719 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.86■■■□□ 2.53
ABCF3-217ENST00000489719 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.85■■■□□ 2.53
ABCF3-217ENST00000489719 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.85■■■□□ 2.53
ABCF3-217ENST00000489719 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.85■■■□□ 2.53
ABCF3-217ENST00000489719 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.83■■■□□ 2.53
ABCF3-217ENST00000489719 PBRM1Q86U86 1689 aa30.81■■■□□ 2.52
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ABCF3-217ENST00000489719 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.69■■■□□ 2.5
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ABCF3-217ENST00000489719 GRIN2AQ12879 1464 aa30.67■■■□□ 2.5
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ABCF3-217ENST00000489719 KIF27Q86VH2 1401 aa30.6■■■□□ 2.49
ABCF3-217ENST00000489719 ARAP1Q96P48 1450 aa30.59■■■□□ 2.49
ABCF3-217ENST00000489719 NUP160Q12769 1436 aa30.55■■■□□ 2.48
ABCF3-217ENST00000489719 IGF1RP08069 1367 aa30.54■■■□□ 2.48
ABCF3-217ENST00000489719 CEP170Q5SW79 1584 aa30.45■■■□□ 2.47
ABCF3-217ENST00000489719 JPH4Q96JJ6 628 aa30.43■■■□□ 2.46
ABCF3-217ENST00000489719 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
ABCF3-217ENST00000489719 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.37■■■□□ 2.45
ABCF3-217ENST00000489719 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
ABCF3-217ENST00000489719 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.27■■■□□ 2.44
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