RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486100.1

PRPF40A-209, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 4

Gene PRPF40A, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-209ENST00000486100 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.3■■■■■ 4.84
PRPF40A-209ENST00000486100 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.33■■■■■ 4.05
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PRPF40A-209ENST00000486100 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.25■■■■□ 3.71
PRPF40A-209ENST00000486100 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.16■■■■□ 3.7
PRPF40A-209ENST00000486100 NACADO15069 1562 aa38.12■■■■□ 3.69
PRPF40A-209ENST00000486100 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.78■■■■□ 3.64
PRPF40A-209ENST00000486100 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
PRPF40A-209ENST00000486100 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.45■■■■□ 3.59
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PRPF40A-209ENST00000486100 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.23■■■■□ 3.55
PRPF40A-209ENST00000486100 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.22■■■■□ 3.55
PRPF40A-209ENST00000486100 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.1■■■■□ 3.53
PRPF40A-209ENST00000486100 SCRIBQ14160 1630 aa36.81■■■■□ 3.48
PRPF40A-209ENST00000486100 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.69■■■■□ 3.46
PRPF40A-209ENST00000486100 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
PRPF40A-209ENST00000486100 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.12■■■■□ 3.37
PRPF40A-209ENST00000486100 CECR2Q9BXF3 1484 aa36■■■■□ 3.35
PRPF40A-209ENST00000486100 NCAPD3P42695 1498 aa35.25■■■■□ 3.23
PRPF40A-209ENST00000486100 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.18■■■■□ 3.22
PRPF40A-209ENST00000486100 SMARCA4P51532 1647 aa35.17■■■■□ 3.22
PRPF40A-209ENST00000486100 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
PRPF40A-209ENST00000486100 SMARCA2P51531 1590 aa35.06■■■■□ 3.2
PRPF40A-209ENST00000486100 HMGXB3Q12766 1538 aa34.94■■■■□ 3.18
PRPF40A-209ENST00000486100 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.9■■■■□ 3.18
PRPF40A-209ENST00000486100 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.86■■■■□ 3.17
PRPF40A-209ENST00000486100 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
PRPF40A-209ENST00000486100 ERCC6Q03468 1493 aa34.52■■■■□ 3.12
PRPF40A-209ENST00000486100 NESP48681 1621 aa34.48■■■■□ 3.11
PRPF40A-209ENST00000486100 WIZO95785 1651 aa34.44■■■■□ 3.1
PRPF40A-209ENST00000486100 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
PRPF40A-209ENST00000486100 CUX2O14529 1486 aa34.3■■■■□ 3.08
PRPF40A-209ENST00000486100 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.3■■■■□ 3.08
PRPF40A-209ENST00000486100 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.23■■■■□ 3.07
PRPF40A-209ENST00000486100 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.17■■■■□ 3.06
PRPF40A-209ENST00000486100 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
PRPF40A-209ENST00000486100 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
PRPF40A-209ENST00000486100 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.93■■■■□ 3.02
PRPF40A-209ENST00000486100 CFTRP13569 1480 aa33.88■■■■□ 3.01
PRPF40A-209ENST00000486100 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.86■■■■□ 3.01
PRPF40A-209ENST00000486100 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.79■■■■□ 3
PRPF40A-209ENST00000486100 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.77■■■■□ 3
PRPF40A-209ENST00000486100 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.75■■■□□ 2.99
PRPF40A-209ENST00000486100 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.75■■■□□ 2.99
PRPF40A-209ENST00000486100 WDR62O43379 1518 aa33.66■■■□□ 2.98
PRPF40A-209ENST00000486100 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
PRPF40A-209ENST00000486100 PRDM2Q13029 1718 aa33.36■■■□□ 2.93
PRPF40A-209ENST00000486100 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.91
PRPF40A-209ENST00000486100 ABCC8Q09428 1581 aa33.17■■■□□ 2.9
PRPF40A-209ENST00000486100 TOPBP1Q92547 1522 aa33.17■■■□□ 2.9
PRPF40A-209ENST00000486100 IFT140Q96RY7 1462 aa33.09■■■□□ 2.89
PRPF40A-209ENST00000486100 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.05■■■□□ 2.88
PRPF40A-209ENST00000486100 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
PRPF40A-209ENST00000486100 OSCARQ8IYS5 282 aa32.93■■■□□ 2.86
PRPF40A-209ENST00000486100 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
PRPF40A-209ENST00000486100 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
PRPF40A-209ENST00000486100 SOGA1O94964 1423 aa32.78■■■□□ 2.84
PRPF40A-209ENST00000486100 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.77■■■□□ 2.84
PRPF40A-209ENST00000486100 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.75■■■□□ 2.83
PRPF40A-209ENST00000486100 CUX1P39880 1505 aa32.75■■■□□ 2.83
PRPF40A-209ENST00000486100 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
PRPF40A-209ENST00000486100 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.72■■■□□ 2.83
PRPF40A-209ENST00000486100 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
PRPF40A-209ENST00000486100 TRIM41Q8WV44 630 aa32.53■■■□□ 2.8
PRPF40A-209ENST00000486100 FBLN2P98095 1184 aa32.51■■■□□ 2.79
PRPF40A-209ENST00000486100 WDR97A6NE52 1622 aa32.5■■■□□ 2.79
PRPF40A-209ENST00000486100 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.43■■■□□ 2.78
PRPF40A-209ENST00000486100 GRIN2BQ13224 1484 aa32.42■■■□□ 2.78
PRPF40A-209ENST00000486100 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.4■■■□□ 2.78
PRPF40A-209ENST00000486100 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.39■■■□□ 2.78
PRPF40A-209ENST00000486100 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
PRPF40A-209ENST00000486100 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.35■■■□□ 2.77
PRPF40A-209ENST00000486100 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
PRPF40A-209ENST00000486100 CHD1O14646 1710 aa32.34■■■□□ 2.77
PRPF40A-209ENST00000486100 TOP2BQ02880 1626 aa32.33■■■□□ 2.77
PRPF40A-209ENST00000486100 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.29■■■□□ 2.76
PRPF40A-209ENST00000486100 SYNJ1O43426 1573 aa32.28■■■□□ 2.76
PRPF40A-209ENST00000486100 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.26■■■□□ 2.76
PRPF40A-209ENST00000486100 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.26■■■□□ 2.76
PRPF40A-209ENST00000486100 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.26■■■□□ 2.76
PRPF40A-209ENST00000486100 ARHGEF11O15085 1522 aa32.26■■■□□ 2.75
PRPF40A-209ENST00000486100 SYNJ2O15056 1496 aa32.23■■■□□ 2.75
PRPF40A-209ENST00000486100 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.22■■■□□ 2.75
PRPF40A-209ENST00000486100 PBRM1Q86U86 1689 aa32.15■■■□□ 2.74
PRPF40A-209ENST00000486100 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.11■■■□□ 2.73
PRPF40A-209ENST00000486100 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.07■■■□□ 2.72
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PRPF40A-209ENST00000486100 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.98■■■□□ 2.71
PRPF40A-209ENST00000486100 ARAP1Q96P48 1450 aa31.97■■■□□ 2.71
PRPF40A-209ENST00000486100 GRIN2AQ12879 1464 aa31.97■■■□□ 2.71
PRPF40A-209ENST00000486100 ADAMTS12P58397 1594 aa31.94■■■□□ 2.7
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PRPF40A-209ENST00000486100 KIF27Q86VH2 1401 aa31.79■■■□□ 2.68
PRPF40A-209ENST00000486100 CEP170Q5SW79 1584 aa31.78■■■□□ 2.68
PRPF40A-209ENST00000486100 IGF1RP08069 1367 aa31.77■■■□□ 2.68
PRPF40A-209ENST00000486100 JPH4Q96JJ6 628 aa31.64■■■□□ 2.66
PRPF40A-209ENST00000486100 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.61■■■□□ 2.65
PRPF40A-209ENST00000486100 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
PRPF40A-209ENST00000486100 SHROOM2Q13796 1616 aa31.59■■■□□ 2.65
PRPF40A-209ENST00000486100 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.56■■■□□ 2.64
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