RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484166.5

MFSD1-215, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene MFSD1, Length 2,121 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-215ENST00000484166 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.48■■■■□ 3.91
MFSD1-215ENST00000484166 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.14■■■■□ 3.06
MFSD1-215ENST00000484166 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
MFSD1-215ENST00000484166 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.8■■■□□ 2.84
MFSD1-215ENST00000484166 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.77■■■□□ 2.84
MFSD1-215ENST00000484166 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.51■■■□□ 2.79
MFSD1-215ENST00000484166 ABCC9O60706 1549 aa32.16■■■□□ 2.74
MFSD1-215ENST00000484166 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.93■■■□□ 2.7
MFSD1-215ENST00000484166 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
MFSD1-215ENST00000484166 NACADO15069 1562 aa31.72■■■□□ 2.67
MFSD1-215ENST00000484166 SCRIBQ14160 1630 aa31.68■■■□□ 2.66
MFSD1-215ENST00000484166 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.4■■■□□ 2.62
MFSD1-215ENST00000484166 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.84■■■□□ 2.53
MFSD1-215ENST00000484166 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
MFSD1-215ENST00000484166 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.75■■■□□ 2.51
MFSD1-215ENST00000484166 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.59■■■□□ 2.49
MFSD1-215ENST00000484166 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.48■■■□□ 2.47
MFSD1-215ENST00000484166 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
MFSD1-215ENST00000484166 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.47■■■□□ 2.47
MFSD1-215ENST00000484166 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
MFSD1-215ENST00000484166 WIZO95785 1651 aa30.39■■■□□ 2.46
MFSD1-215ENST00000484166 SMARCA4P51532 1647 aa30.28■■■□□ 2.44
MFSD1-215ENST00000484166 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
MFSD1-215ENST00000484166 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.79■■■□□ 2.36
MFSD1-215ENST00000484166 SMARCA2P51531 1590 aa29.75■■■□□ 2.35
MFSD1-215ENST00000484166 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.75■■■□□ 2.35
MFSD1-215ENST00000484166 TRIM41Q8WV44 630 aa29.71■■■□□ 2.35
MFSD1-215ENST00000484166 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.68■■■□□ 2.34
MFSD1-215ENST00000484166 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
MFSD1-215ENST00000484166 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
MFSD1-215ENST00000484166 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.44■■■□□ 2.3
MFSD1-215ENST00000484166 ABCC8Q09428 1581 aa29.35■■■□□ 2.29
MFSD1-215ENST00000484166 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
MFSD1-215ENST00000484166 NCAPD3P42695 1498 aa29.29■■■□□ 2.28
MFSD1-215ENST00000484166 HMGXB3Q12766 1538 aa29.28■■■□□ 2.28
MFSD1-215ENST00000484166 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.03■■■□□ 2.24
MFSD1-215ENST00000484166 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.03■■■□□ 2.24
MFSD1-215ENST00000484166 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
MFSD1-215ENST00000484166 SYNJ1O43426 1573 aa28.91■■■□□ 2.22
MFSD1-215ENST00000484166 SOGA1O94964 1423 aa28.87■■■□□ 2.21
MFSD1-215ENST00000484166 CFTRP13569 1480 aa28.8■■■□□ 2.2
MFSD1-215ENST00000484166 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.75■■■□□ 2.19
MFSD1-215ENST00000484166 EEA1Q15075 1411 aa28.72■■■□□ 2.19
MFSD1-215ENST00000484166 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.69■■■□□ 2.18
MFSD1-215ENST00000484166 TOP2BQ02880 1626 aa28.69■■■□□ 2.18
MFSD1-215ENST00000484166 HRCP23327 699 aa28.66■■■□□ 2.18
MFSD1-215ENST00000484166 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.64■■■□□ 2.18
MFSD1-215ENST00000484166 PRDM2Q13029 1718 aa28.63■■■□□ 2.17
MFSD1-215ENST00000484166 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.63■■■□□ 2.17
MFSD1-215ENST00000484166 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.63■■■□□ 2.17
MFSD1-215ENST00000484166 CUX1P39880 1505 aa28.57■■■□□ 2.16
MFSD1-215ENST00000484166 GOLGA3Q08378 1498 aa28.43■■■□□ 2.14
MFSD1-215ENST00000484166 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
MFSD1-215ENST00000484166 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.4■■■□□ 2.14
MFSD1-215ENST00000484166 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.38■■■□□ 2.13
MFSD1-215ENST00000484166 KIF21BO75037 1637 aa28.37■■■□□ 2.13
MFSD1-215ENST00000484166 NESP48681 1621 aa28.36■■■□□ 2.13
MFSD1-215ENST00000484166 CEP162Q5TB80 1403 aa28.36■■■□□ 2.13
MFSD1-215ENST00000484166 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.36■■■□□ 2.13
MFSD1-215ENST00000484166 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
MFSD1-215ENST00000484166 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.33■■■□□ 2.13
MFSD1-215ENST00000484166 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.24■■■□□ 2.11
MFSD1-215ENST00000484166 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.23■■■□□ 2.11
MFSD1-215ENST00000484166 KIF27Q86VH2 1401 aa28.23■■■□□ 2.11
MFSD1-215ENST00000484166 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.2■■■□□ 2.11
MFSD1-215ENST00000484166 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
MFSD1-215ENST00000484166 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.13■■■□□ 2.09
MFSD1-215ENST00000484166 CUX2O14529 1486 aa28.12■■■□□ 2.09
MFSD1-215ENST00000484166 PRXQ9BXM0 1461 aa28.12■■■□□ 2.09
MFSD1-215ENST00000484166 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.09■■■□□ 2.09
MFSD1-215ENST00000484166 TOPBP1Q92547 1522 aa28.08■■■□□ 2.09
MFSD1-215ENST00000484166 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.04■■■□□ 2.08
MFSD1-215ENST00000484166 CLIP1P30622 1438 aa28.04■■■□□ 2.08
MFSD1-215ENST00000484166 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
MFSD1-215ENST00000484166 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
MFSD1-215ENST00000484166 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
MFSD1-215ENST00000484166 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.97■■■□□ 2.07
MFSD1-215ENST00000484166 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.97■■■□□ 2.07
MFSD1-215ENST00000484166 IGF1RP08069 1367 aa27.95■■■□□ 2.06
MFSD1-215ENST00000484166 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.89■■■□□ 2.06
MFSD1-215ENST00000484166 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
MFSD1-215ENST00000484166 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.83■■■□□ 2.05
MFSD1-215ENST00000484166 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.81■■■□□ 2.04
MFSD1-215ENST00000484166 WDR97A6NE52 1622 aa27.76■■■□□ 2.03
MFSD1-215ENST00000484166 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
MFSD1-215ENST00000484166 ARAP1Q96P48 1450 aa27.7■■■□□ 2.02
MFSD1-215ENST00000484166 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
MFSD1-215ENST00000484166 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.67■■■□□ 2.02
MFSD1-215ENST00000484166 CUL7Q14999 1698 aa27.64■■■□□ 2.02
MFSD1-215ENST00000484166 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.64■■■□□ 2.02
MFSD1-215ENST00000484166 APLP2Q06481 763 aa27.63■■■□□ 2.01
MFSD1-215ENST00000484166 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.61■■■□□ 2.01
MFSD1-215ENST00000484166 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.6■■■□□ 2.01
MFSD1-215ENST00000484166 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
MFSD1-215ENST00000484166 ERCC6Q03468 1493 aa27.51■■□□□ 1.99
MFSD1-215ENST00000484166 WDR62O43379 1518 aa27.48■■□□□ 1.99
MFSD1-215ENST00000484166 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.43■■□□□ 1.98
MFSD1-215ENST00000484166 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
MFSD1-215ENST00000484166 PBRM1Q86U86 1689 aa27.41■■□□□ 1.98
MFSD1-215ENST00000484166 IFT140Q96RY7 1462 aa27.37■■□□□ 1.97
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