RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463031.1

IRAK1-211, Transcript of interleukin 1 receptor associated kinase 1, humanhuman

TSL 3

Gene IRAK1, Length 357 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK1-211ENST00000463031 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.95■■■■□ 3.99
IRAK1-211ENST00000463031 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.72■■■■□ 3.31
IRAK1-211ENST00000463031 ABCC9O60706 1549 aa35.18■■■■□ 3.22
IRAK1-211ENST00000463031 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.81■■■■□ 3
IRAK1-211ENST00000463031 NACADO15069 1562 aa33.7■■■□□ 2.99
IRAK1-211ENST00000463031 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.47■■■□□ 2.95
IRAK1-211ENST00000463031 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.44■■■□□ 2.94
IRAK1-211ENST00000463031 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
IRAK1-211ENST00000463031 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.12■■■□□ 2.89
IRAK1-211ENST00000463031 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.94■■■□□ 2.86
IRAK1-211ENST00000463031 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.8■■■□□ 2.84
IRAK1-211ENST00000463031 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.7■■■□□ 2.83
IRAK1-211ENST00000463031 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.62■■■□□ 2.81
IRAK1-211ENST00000463031 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.52■■■□□ 2.8
IRAK1-211ENST00000463031 SCRIBQ14160 1630 aa32.42■■■□□ 2.78
IRAK1-211ENST00000463031 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
IRAK1-211ENST00000463031 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.86■■■□□ 2.69
IRAK1-211ENST00000463031 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.72■■■□□ 2.67
IRAK1-211ENST00000463031 NCAPD3P42695 1498 aa31.09■■■□□ 2.57
IRAK1-211ENST00000463031 SMARCA4P51532 1647 aa31.05■■■□□ 2.56
IRAK1-211ENST00000463031 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
IRAK1-211ENST00000463031 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31■■■□□ 2.55
IRAK1-211ENST00000463031 SMARCA2P51531 1590 aa31■■■□□ 2.55
IRAK1-211ENST00000463031 HMGXB3Q12766 1538 aa30.89■■■□□ 2.54
IRAK1-211ENST00000463031 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.83■■■□□ 2.53
IRAK1-211ENST00000463031 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
IRAK1-211ENST00000463031 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.71■■■□□ 2.51
IRAK1-211ENST00000463031 ERCC6Q03468 1493 aa30.42■■■□□ 2.46
IRAK1-211ENST00000463031 WIZO95785 1651 aa30.35■■■□□ 2.45
IRAK1-211ENST00000463031 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.32■■■□□ 2.45
IRAK1-211ENST00000463031 CUX2O14529 1486 aa30.31■■■□□ 2.44
IRAK1-211ENST00000463031 NESP48681 1621 aa30.31■■■□□ 2.44
IRAK1-211ENST00000463031 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
IRAK1-211ENST00000463031 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.16■■■□□ 2.42
IRAK1-211ENST00000463031 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.15■■■□□ 2.42
IRAK1-211ENST00000463031 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
IRAK1-211ENST00000463031 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
IRAK1-211ENST00000463031 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.98■■■□□ 2.39
IRAK1-211ENST00000463031 CFTRP13569 1480 aa29.88■■■□□ 2.37
IRAK1-211ENST00000463031 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.81■■■□□ 2.36
IRAK1-211ENST00000463031 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.8■■■□□ 2.36
IRAK1-211ENST00000463031 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.77■■■□□ 2.36
IRAK1-211ENST00000463031 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.76■■■□□ 2.35
IRAK1-211ENST00000463031 WDR62O43379 1518 aa29.72■■■□□ 2.35
IRAK1-211ENST00000463031 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.7■■■□□ 2.35
IRAK1-211ENST00000463031 PRDM2Q13029 1718 aa29.62■■■□□ 2.33
IRAK1-211ENST00000463031 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
IRAK1-211ENST00000463031 ABCC8Q09428 1581 aa29.35■■■□□ 2.29
IRAK1-211ENST00000463031 TOPBP1Q92547 1522 aa29.24■■■□□ 2.27
IRAK1-211ENST00000463031 IFT140Q96RY7 1462 aa29.2■■■□□ 2.26
IRAK1-211ENST00000463031 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.19■■■□□ 2.26
IRAK1-211ENST00000463031 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
IRAK1-211ENST00000463031 OSCARQ8IYS5 282 aa29■■■□□ 2.23
IRAK1-211ENST00000463031 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
IRAK1-211ENST00000463031 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
IRAK1-211ENST00000463031 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
IRAK1-211ENST00000463031 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
IRAK1-211ENST00000463031 SOGA1O94964 1423 aa28.86■■■□□ 2.21
IRAK1-211ENST00000463031 CUX1P39880 1505 aa28.84■■■□□ 2.21
IRAK1-211ENST00000463031 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.82■■■□□ 2.2
IRAK1-211ENST00000463031 WDR97A6NE52 1622 aa28.82■■■□□ 2.2
IRAK1-211ENST00000463031 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.28e-8■■□□□ 12.7
IRAK1-211ENST00000463031 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.78■■■□□ 2.2
IRAK1-211ENST00000463031 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
IRAK1-211ENST00000463031 GRIN2BQ13224 1484 aa28.59■■■□□ 2.17
IRAK1-211ENST00000463031 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.59■■■□□ 2.17
IRAK1-211ENST00000463031 CHD1O14646 1710 aa28.58■■■□□ 2.17
IRAK1-211ENST00000463031 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.57■■■□□ 2.16
IRAK1-211ENST00000463031 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
IRAK1-211ENST00000463031 FBLN2P98095 1184 aa28.55■■■□□ 2.16
IRAK1-211ENST00000463031 TOP2BQ02880 1626 aa28.54■■■□□ 2.16
IRAK1-211ENST00000463031 TRIM41Q8WV44 630 aa28.54■■■□□ 2.16
IRAK1-211ENST00000463031 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.54■■■□□ 2.16
IRAK1-211ENST00000463031 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.53■■■□□ 2.16
IRAK1-211ENST00000463031 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.53■■■□□ 2.16
IRAK1-211ENST00000463031 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
IRAK1-211ENST00000463031 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.46■■■□□ 2.15
IRAK1-211ENST00000463031 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.46■■■□□ 2.15
IRAK1-211ENST00000463031 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.46■■■□□ 2.15
IRAK1-211ENST00000463031 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.45■■■□□ 2.14
IRAK1-211ENST00000463031 SYNJ2O15056 1496 aa28.44■■■□□ 2.14
IRAK1-211ENST00000463031 SYNJ1O43426 1573 aa28.44■■■□□ 2.14
IRAK1-211ENST00000463031 PBRM1Q86U86 1689 aa28.44■■■□□ 2.14
IRAK1-211ENST00000463031 ARHGEF11O15085 1522 aa28.43■■■□□ 2.14
IRAK1-211ENST00000463031 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.3■■■□□ 2.12
IRAK1-211ENST00000463031 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.25■■■□□ 2.11
IRAK1-211ENST00000463031 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.21■■■□□ 2.11
IRAK1-211ENST00000463031 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.2■■■□□ 2.11
IRAK1-211ENST00000463031 GRIN2AQ12879 1464 aa28.19■■■□□ 2.1
IRAK1-211ENST00000463031 ADAMTS12P58397 1594 aa28.19■■■□□ 2.1
IRAK1-211ENST00000463031 ARAP1Q96P48 1450 aa28.15■■■□□ 2.1
IRAK1-211ENST00000463031 NUP160Q12769 1436 aa28.1■■■□□ 2.09
IRAK1-211ENST00000463031 KIF27Q86VH2 1401 aa28.04■■■□□ 2.08
IRAK1-211ENST00000463031 CEP170Q5SW79 1584 aa28.01■■■□□ 2.07
IRAK1-211ENST00000463031 IGF1RP08069 1367 aa27.95■■■□□ 2.06
IRAK1-211ENST00000463031 SHROOM2Q13796 1616 aa27.92■■■□□ 2.06
IRAK1-211ENST00000463031 CUL7Q14999 1698 aa27.91■■■□□ 2.06
IRAK1-211ENST00000463031 JPH4Q96JJ6 628 aa27.84■■■□□ 2.05
IRAK1-211ENST00000463031 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.79■■■□□ 2.04
IRAK1-211ENST00000463031 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms