RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455235.5

ZDHHC3-208, Transcript of zinc finger DHHC-type containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene ZDHHC3, Length 537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3-208ENST00000455235 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.29■■■■■ 7.08
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ZDHHC3-208ENST00000455235 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.67■■■■■ 5.54
ZDHHC3-208ENST00000455235 NACADO15069 1562 aa49.63■■■■■ 5.54
ZDHHC3-208ENST00000455235 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.43■■■■■ 5.5
ZDHHC3-208ENST00000455235 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.39■■■■■ 5.5
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ZDHHC3-208ENST00000455235 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.14■■■■■ 5.46
ZDHHC3-208ENST00000455235 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.63■■■■■ 5.37
ZDHHC3-208ENST00000455235 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.24■■■■■ 5.31
ZDHHC3-208ENST00000455235 SCRIBQ14160 1630 aa48.07■■■■■ 5.29
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ZDHHC3-208ENST00000455235 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.72■■■■■ 5.07
ZDHHC3-208ENST00000455235 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.38■■■■■ 5.01
ZDHHC3-208ENST00000455235 SMARCA4P51532 1647 aa46.05■■■■■ 4.96
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ZDHHC3-208ENST00000455235 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.77■■■■■ 4.92
ZDHHC3-208ENST00000455235 SMARCA2P51531 1590 aa45.74■■■■■ 4.91
ZDHHC3-208ENST00000455235 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.67■■■■■ 4.9
ZDHHC3-208ENST00000455235 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.67■■■■■ 4.9
ZDHHC3-208ENST00000455235 HMGXB3Q12766 1538 aa45.61■■■■■ 4.89
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ZDHHC3-208ENST00000455235 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.6■■■■■ 4.73
ZDHHC3-208ENST00000455235 ERCC6Q03468 1493 aa44.43■■■■■ 4.7
ZDHHC3-208ENST00000455235 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.38■■■■■ 4.69
ZDHHC3-208ENST00000455235 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.21■■■■■ 4.67
ZDHHC3-208ENST00000455235 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.19■■■■■ 4.66
ZDHHC3-208ENST00000455235 CFTRP13569 1480 aa44.16■■■■■ 4.66
ZDHHC3-208ENST00000455235 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.14■■■■■ 4.66
ZDHHC3-208ENST00000455235 CUX2O14529 1486 aa44.11■■■■■ 4.65
ZDHHC3-208ENST00000455235 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
ZDHHC3-208ENST00000455235 PRDM2Q13029 1718 aa43.92■■■■■ 4.62
ZDHHC3-208ENST00000455235 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.88■■■■■ 4.61
ZDHHC3-208ENST00000455235 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.84■■■■■ 4.61
ZDHHC3-208ENST00000455235 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.82■■■■■ 4.6
ZDHHC3-208ENST00000455235 WDR62O43379 1518 aa43.73■■■■■ 4.59
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ZDHHC3-208ENST00000455235 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
ZDHHC3-208ENST00000455235 TOPBP1Q92547 1522 aa43.2■■■■■ 4.51
ZDHHC3-208ENST00000455235 ABCC8Q09428 1581 aa43.18■■■■■ 4.5
ZDHHC3-208ENST00000455235 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.18■■■■■ 4.5
ZDHHC3-208ENST00000455235 IFT140Q96RY7 1462 aa42.94■■■■■ 4.46
ZDHHC3-208ENST00000455235 CUX1P39880 1505 aa42.87■■■■■ 4.45
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ZDHHC3-208ENST00000455235 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
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ZDHHC3-208ENST00000455235 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.7■■■■■ 4.43
ZDHHC3-208ENST00000455235 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
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ZDHHC3-208ENST00000455235 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.53■■■■■ 4.4
ZDHHC3-208ENST00000455235 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.51■■■■■ 4.4
ZDHHC3-208ENST00000455235 TOP2BQ02880 1626 aa42.5■■■■■ 4.39
ZDHHC3-208ENST00000455235 WDR97A6NE52 1622 aa42.49■■■■■ 4.39
ZDHHC3-208ENST00000455235 SYNJ1O43426 1573 aa42.47■■■■■ 4.39
ZDHHC3-208ENST00000455235 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.43■■■■■ 4.38
ZDHHC3-208ENST00000455235 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.33■■■■■ 4.37
ZDHHC3-208ENST00000455235 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
ZDHHC3-208ENST00000455235 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.21■■■■■ 4.35
ZDHHC3-208ENST00000455235 GRIN2BQ13224 1484 aa42.14■■■■■ 4.34
ZDHHC3-208ENST00000455235 PBRM1Q86U86 1689 aa42.12■■■■■ 4.33
ZDHHC3-208ENST00000455235 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.12■■■■■ 4.33
ZDHHC3-208ENST00000455235 OSCARQ8IYS5 282 aa42.1■■■■■ 4.33
ZDHHC3-208ENST00000455235 CHD1O14646 1710 aa42.09■■■■■ 4.33
ZDHHC3-208ENST00000455235 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.09■■■■■ 4.33
ZDHHC3-208ENST00000455235 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
ZDHHC3-208ENST00000455235 SYNJ2O15056 1496 aa41.9■■■■■ 4.3
ZDHHC3-208ENST00000455235 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.83■■■■■ 4.29
ZDHHC3-208ENST00000455235 ADAMTS12P58397 1594 aa41.8■■■■■ 4.28
ZDHHC3-208ENST00000455235 FBLN2P98095 1184 aa41.77■■■■■ 4.28
ZDHHC3-208ENST00000455235 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
ZDHHC3-208ENST00000455235 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.68■■■■■ 4.26
ZDHHC3-208ENST00000455235 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.64■■■■■ 4.26
ZDHHC3-208ENST00000455235 GRIN2AQ12879 1464 aa41.62■■■■■ 4.25
ZDHHC3-208ENST00000455235 KIF27Q86VH2 1401 aa41.61■■■■■ 4.25
ZDHHC3-208ENST00000455235 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.58■■■■■ 4.25
ZDHHC3-208ENST00000455235 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.58■■■■■ 4.25
ZDHHC3-208ENST00000455235 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.58■■■■■ 4.25
ZDHHC3-208ENST00000455235 ARHGEF11O15085 1522 aa41.57■■■■■ 4.25
ZDHHC3-208ENST00000455235 NUP160Q12769 1436 aa41.48■■■■■ 4.23
ZDHHC3-208ENST00000455235 CEP170Q5SW79 1584 aa41.45■■■■■ 4.23
ZDHHC3-208ENST00000455235 CUL7Q14999 1698 aa41.45■■■■■ 4.23
ZDHHC3-208ENST00000455235 IGF1RP08069 1367 aa41.44■■■■■ 4.22
ZDHHC3-208ENST00000455235 TRIM41Q8WV44 630 aa41.28■■■■■ 4.2
ZDHHC3-208ENST00000455235 ARAP1Q96P48 1450 aa41.24■■■■■ 4.19
ZDHHC3-208ENST00000455235 SHROOM2Q13796 1616 aa41.22■■■■■ 4.19
ZDHHC3-208ENST00000455235 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.21■■■■■ 4.19
ZDHHC3-208ENST00000455235 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.17■■■■■ 4.18
ZDHHC3-208ENST00000455235 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.03■■■■■ 4.16
ZDHHC3-208ENST00000455235 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.02■■■■■ 4.16
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