RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433375.1

GLIS2-202, Transcript of GLIS family zinc finger 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GLIS2, Length 3,705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS2-202ENST00000433375 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.81■■□□□ 1.88
GLIS2-202ENST00000433375 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
GLIS2-202ENST00000433375 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.48■■□□□ 1.51
GLIS2-202ENST00000433375 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.02■■□□□ 1.44
GLIS2-202ENST00000433375 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.8■■□□□ 1.4
GLIS2-202ENST00000433375 HRCP23327 699 aa23.68■■□□□ 1.38
GLIS2-202ENST00000433375 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.38■■□□□ 1.33
GLIS2-202ENST00000433375 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GLIS2-202ENST00000433375 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.06■■□□□ 1.28
GLIS2-202ENST00000433375 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.96■■□□□ 1.27
GLIS2-202ENST00000433375 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
GLIS2-202ENST00000433375 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.88■■□□□ 1.25
GLIS2-202ENST00000433375 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
GLIS2-202ENST00000433375 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
GLIS2-202ENST00000433375 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
GLIS2-202ENST00000433375 TRIM41Q8WV44 630 aa22.62■■□□□ 1.21
GLIS2-202ENST00000433375 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
GLIS2-202ENST00000433375 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.49■■□□□ 1.19
GLIS2-202ENST00000433375 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
GLIS2-202ENST00000433375 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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GLIS2-202ENST00000433375 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GLIS2-202ENST00000433375 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GLIS2-202ENST00000433375 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.02■■□□□ 1.12
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GLIS2-202ENST00000433375 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
GLIS2-202ENST00000433375 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
GLIS2-202ENST00000433375 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.92■■□□□ 1.1
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GLIS2-202ENST00000433375 NEUROD1Q13562 356 aa21.82■■□□□ 1.08
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GLIS2-202ENST00000433375 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
GLIS2-202ENST00000433375 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
GLIS2-202ENST00000433375 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
GLIS2-202ENST00000433375 SCRIBQ14160 1630 aa21.52■■□□□ 1.04
GLIS2-202ENST00000433375 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GLIS2-202ENST00000433375 ABCC9O60706 1549 aa21.34■■□□□ 1.01
GLIS2-202ENST00000433375 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.32■■□□□ 1
GLIS2-202ENST00000433375 MIER1Q8N108 512 aa21.23■□□□□ 0.99
GLIS2-202ENST00000433375 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.2■□□□□ 0.98
GLIS2-202ENST00000433375 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.1■□□□□ 0.97
GLIS2-202ENST00000433375 CEP162Q5TB80 1403 aa21.09■□□□□ 0.97
GLIS2-202ENST00000433375 ITGAEP38570 1179 aa21.02■□□□□ 0.95
GLIS2-202ENST00000433375 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.95■□□□□ 0.94
GLIS2-202ENST00000433375 NEFLP07196 543 aa20.92■□□□□ 0.94
GLIS2-202ENST00000433375 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.91■□□□□ 0.94
GLIS2-202ENST00000433375 BCANQ96GW7 911 aa20.9■□□□□ 0.94
GLIS2-202ENST00000433375 SOGA1O94964 1423 aa20.86■□□□□ 0.93
GLIS2-202ENST00000433375 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.82■□□□□ 0.92
GLIS2-202ENST00000433375 WIZO95785 1651 aa20.79■□□□□ 0.92
GLIS2-202ENST00000433375 ABCC8Q09428 1581 aa20.79■□□□□ 0.92
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GLIS2-202ENST00000433375 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.92
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GLIS2-202ENST00000433375 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.91
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GLIS2-202ENST00000433375 CLIP1P30622 1438 aa20.74■□□□□ 0.91
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GLIS2-202ENST00000433375 FKBP8Q14318 412 aa20.63■□□□□ 0.89
GLIS2-202ENST00000433375 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.59■□□□□ 0.89
GLIS2-202ENST00000433375 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
GLIS2-202ENST00000433375 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS2-202ENST00000433375 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS2-202ENST00000433375 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
GLIS2-202ENST00000433375 ANP32CO43423 234 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS2-202ENST00000433375 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS2-202ENST00000433375 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.46■□□□□ 0.87
GLIS2-202ENST00000433375 TRIM52Q96A61 297 aa20.44■□□□□ 0.86
GLIS2-202ENST00000433375 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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GLIS2-202ENST00000433375 KCNH8Q96L42 1107 aa20.33■□□□□ 0.85
GLIS2-202ENST00000433375 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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GLIS2-202ENST00000433375 P3H3Q8IVL6 736 aa20.27■□□□□ 0.83
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GLIS2-202ENST00000433375 BCL11AQ9H165 835 aa20.24■□□□□ 0.83
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GLIS2-202ENST00000433375 SMARCA4P51532 1647 aa20.2■□□□□ 0.82
GLIS2-202ENST00000433375 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
GLIS2-202ENST00000433375 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
GLIS2-202ENST00000433375 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
GLIS2-202ENST00000433375 TONSLQ96HA7 1378 aa20.12■□□□□ 0.81
GLIS2-202ENST00000433375 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GLIS2-202ENST00000433375 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.08■□□□□ 0.81
GLIS2-202ENST00000433375 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.08■□□□□ 0.81
GLIS2-202ENST00000433375 KIF21BO75037 1637 aa20.05■□□□□ 0.8
GLIS2-202ENST00000433375 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
GLIS2-202ENST00000433375 KIF27Q86VH2 1401 aa20■□□□□ 0.79
GLIS2-202ENST00000433375 CCER2I3L3R5 266 aa19.98■□□□□ 0.79
GLIS2-202ENST00000433375 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.98■□□□□ 0.79
GLIS2-202ENST00000433375 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.97■□□□□ 0.79
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