RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420095.1

LMCD1-AS1-201, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene LMCD1-AS1, Length 2,144 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.63■■□□□ 1.85
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.12■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.05■■□□□ 1.12
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.86■■□□□ 1.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.79■■□□□ 1.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.72■■□□□ 1.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ABCC9O60706 1549 aa21.66■■□□□ 1.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NACADO15069 1562 aa21.5■■□□□ 1.03
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SCRIBQ14160 1630 aa21.26■□□□□ 0.99
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.25■□□□□ 0.99
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.81■□□□□ 0.92
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.67■□□□□ 0.9
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.63■□□□□ 0.89
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.57■□□□□ 0.88
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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LMCD1-AS1-201ENST00000420095 WIZO95785 1651 aa20.4■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.33■□□□□ 0.84
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.19■□□□□ 0.82
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.05■□□□□ 0.8
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SMARCA2P51531 1590 aa20.03■□□□□ 0.8
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.01■□□□□ 0.79
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NCAPD3P42695 1498 aa19.86■□□□□ 0.77
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HMGXB3Q12766 1538 aa19.83■□□□□ 0.76
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TRIM41Q8WV44 630 aa19.82■□□□□ 0.76
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.62■□□□□ 0.73
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ABCC8Q09428 1581 aa19.61■□□□□ 0.73
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.53■□□□□ 0.72
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CFTRP13569 1480 aa19.46■□□□□ 0.71
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SYNJ1O43426 1573 aa19.4■□□□□ 0.7
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.35■□□□□ 0.69
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 EEA1Q15075 1411 aa19.34■□□□□ 0.69
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PRDM2Q13029 1718 aa19.34■□□□□ 0.69
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TOP2BQ02880 1626 aa19.32■□□□□ 0.68
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SOGA1O94964 1423 aa19.31■□□□□ 0.68
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.3■□□□□ 0.68
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.23■□□□□ 0.67
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CUX1P39880 1505 aa19.22■□□□□ 0.67
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LMCD1-AS1-201ENST00000420095 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.12■□□□□ 0.65
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.12■□□□□ 0.65
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LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.97■□□□□ 0.63
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LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CEP162Q5TB80 1403 aa18.93■□□□□ 0.62
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PRXQ9BXM0 1461 aa18.93■□□□□ 0.62
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.9■□□□□ 0.62
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.9■□□□□ 0.62
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CUX2O14529 1486 aa18.88■□□□□ 0.61
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LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.84■□□□□ 0.61
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.83■□□□□ 0.61
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LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
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LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.8■□□□□ 0.6
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LMCD1-AS1-201ENST00000420095 WDR97A6NE52 1622 aa18.74■□□□□ 0.59
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.72■□□□□ 0.59
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.72■□□□□ 0.59
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LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.65■□□□□ 0.58
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LMCD1-AS1-201ENST00000420095 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.62■□□□□ 0.57
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 WDR62O43379 1518 aa18.62■□□□□ 0.57
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.6■□□□□ 0.57
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ARAP1Q96P48 1450 aa18.56■□□□□ 0.56
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ERCC6Q03468 1493 aa18.54■□□□□ 0.56
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 IFT140Q96RY7 1462 aa18.53■□□□□ 0.56
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.52■□□□□ 0.56
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HRCP23327 699 aa18.48■□□□□ 0.55
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PBRM1Q86U86 1689 aa18.46■□□□□ 0.55
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GRIN2BQ13224 1484 aa18.43■□□□□ 0.54
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