RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407319.6

TRIOBP-205, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIOBP, Length 2,125 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-205ENST00000407319 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.72■■■■■ 7.31
TRIOBP-205ENST00000407319 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.25■■■■■ 6.12
TRIOBP-205ENST00000407319 ABCC9O60706 1549 aa50.99■■■■■ 5.75
TRIOBP-205ENST00000407319 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.89■■■■■ 5.74
TRIOBP-205ENST00000407319 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.41■■■■■ 5.66
TRIOBP-205ENST00000407319 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.11■■■■■ 5.61
TRIOBP-205ENST00000407319 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.72■■■■■ 5.55
TRIOBP-205ENST00000407319 NACADO15069 1562 aa49.69■■■■■ 5.54
TRIOBP-205ENST00000407319 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.45■■■■■ 5.51
TRIOBP-205ENST00000407319 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.22■■■■■ 5.47
TRIOBP-205ENST00000407319 SCRIBQ14160 1630 aa48.99■■■■■ 5.43
TRIOBP-205ENST00000407319 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.65■■■■■ 5.38
TRIOBP-205ENST00000407319 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.06■■■■■ 5.28
TRIOBP-205ENST00000407319 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.96■■■■■ 5.27
TRIOBP-205ENST00000407319 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.32■■■■■ 5.17
TRIOBP-205ENST00000407319 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.17■■■■■ 5.14
TRIOBP-205ENST00000407319 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.95■■■■■ 5.11
TRIOBP-205ENST00000407319 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.91■■■■■ 5.1
TRIOBP-205ENST00000407319 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.87■■■■■ 5.09
TRIOBP-205ENST00000407319 SMARCA4P51532 1647 aa46.86■■■■■ 5.09
TRIOBP-205ENST00000407319 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.06
TRIOBP-205ENST00000407319 WIZO95785 1651 aa46.6■■■■■ 5.05
TRIOBP-205ENST00000407319 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.24■■■■■ 4.99
TRIOBP-205ENST00000407319 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.2■■■■■ 4.99
TRIOBP-205ENST00000407319 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.14■■■■■ 4.98
TRIOBP-205ENST00000407319 SMARCA2P51531 1590 aa46.11■■■■■ 4.97
TRIOBP-205ENST00000407319 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.99■■■■■ 4.95
TRIOBP-205ENST00000407319 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.97■■■■■ 4.95
TRIOBP-205ENST00000407319 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
TRIOBP-205ENST00000407319 NCAPD3P42695 1498 aa45.85■■■■■ 4.93
TRIOBP-205ENST00000407319 HMGXB3Q12766 1538 aa45.76■■■■■ 4.92
TRIOBP-205ENST00000407319 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.57■■■■■ 4.89
TRIOBP-205ENST00000407319 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.52■■■■■ 4.88
TRIOBP-205ENST00000407319 CFTRP13569 1480 aa44.69■■■■■ 4.74
TRIOBP-205ENST00000407319 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.64■■■■■ 4.74
TRIOBP-205ENST00000407319 NESP48681 1621 aa44.61■■■■■ 4.73
TRIOBP-205ENST00000407319 PRDM2Q13029 1718 aa44.56■■■■■ 4.72
TRIOBP-205ENST00000407319 ABCC8Q09428 1581 aa44.47■■■■■ 4.71
TRIOBP-205ENST00000407319 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.43■■■■■ 4.7
TRIOBP-205ENST00000407319 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.3■■■■■ 4.68
TRIOBP-205ENST00000407319 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.2■■■■■ 4.67
TRIOBP-205ENST00000407319 TRIM41Q8WV44 630 aa44.2■■■■■ 4.67
TRIOBP-205ENST00000407319 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.12■■■■■ 4.65
TRIOBP-205ENST00000407319 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.12■■■■■ 4.65
TRIOBP-205ENST00000407319 SYNJ1O43426 1573 aa44.07■■■■■ 4.65
TRIOBP-205ENST00000407319 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.05■■■■■ 4.64
TRIOBP-205ENST00000407319 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.97■■■■■ 4.63
TRIOBP-205ENST00000407319 CUX1P39880 1505 aa43.94■■■■■ 4.62
TRIOBP-205ENST00000407319 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.88■■■■■ 4.62
TRIOBP-205ENST00000407319 HRCP23327 699 aa43.88■■■■■ 4.61
TRIOBP-205ENST00000407319 TOP2BQ02880 1626 aa43.87■■■■■ 4.61
TRIOBP-205ENST00000407319 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.86■■■■■ 4.61
TRIOBP-205ENST00000407319 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
TRIOBP-205ENST00000407319 ERCC6Q03468 1493 aa43.72■■■■■ 4.59
TRIOBP-205ENST00000407319 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.69■■■■■ 4.59
TRIOBP-205ENST00000407319 TOPBP1Q92547 1522 aa43.67■■■■■ 4.58
TRIOBP-205ENST00000407319 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.58■■■■■ 4.57
TRIOBP-205ENST00000407319 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.54■■■■■ 4.56
TRIOBP-205ENST00000407319 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
TRIOBP-205ENST00000407319 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
TRIOBP-205ENST00000407319 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
TRIOBP-205ENST00000407319 SOGA1O94964 1423 aa43.44■■■■■ 4.54
TRIOBP-205ENST00000407319 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
TRIOBP-205ENST00000407319 WDR62O43379 1518 aa43.4■■■■■ 4.54
TRIOBP-205ENST00000407319 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.37■■■■■ 4.53
TRIOBP-205ENST00000407319 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.31■■■■■ 4.52
TRIOBP-205ENST00000407319 CUX2O14529 1486 aa43.15■■■■■ 4.5
TRIOBP-205ENST00000407319 WDR97A6NE52 1622 aa43.12■■■■■ 4.49
TRIOBP-205ENST00000407319 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
TRIOBP-205ENST00000407319 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.08■■■■■ 4.49
TRIOBP-205ENST00000407319 EEA1Q15075 1411 aa43.03■■■■■ 4.48
TRIOBP-205ENST00000407319 KIF27Q86VH2 1401 aa43.02■■■■■ 4.48
TRIOBP-205ENST00000407319 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.94■■■■■ 4.46
TRIOBP-205ENST00000407319 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.94■■■■■ 4.46
TRIOBP-205ENST00000407319 IFT140Q96RY7 1462 aa42.92■■■■■ 4.46
TRIOBP-205ENST00000407319 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
TRIOBP-205ENST00000407319 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.85■■■■■ 4.45
TRIOBP-205ENST00000407319 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
TRIOBP-205ENST00000407319 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.76■■■■■ 4.44
TRIOBP-205ENST00000407319 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.75■■■■■ 4.43
TRIOBP-205ENST00000407319 IGF1RP08069 1367 aa42.73■■■■■ 4.43
TRIOBP-205ENST00000407319 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
TRIOBP-205ENST00000407319 PBRM1Q86U86 1689 aa42.68■■■■■ 4.42
TRIOBP-205ENST00000407319 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
TRIOBP-205ENST00000407319 KIF21BO75037 1637 aa42.64■■■■■ 4.42
TRIOBP-205ENST00000407319 PRXQ9BXM0 1461 aa42.6■■■■■ 4.41
TRIOBP-205ENST00000407319 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.58■■■■■ 4.41
TRIOBP-205ENST00000407319 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.56■■■■■ 4.4
TRIOBP-205ENST00000407319 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.52■■■■■ 4.4
TRIOBP-205ENST00000407319 GOLGA3Q08378 1498 aa42.51■■■■■ 4.4
TRIOBP-205ENST00000407319 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.5■■■■■ 4.39
TRIOBP-205ENST00000407319 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
TRIOBP-205ENST00000407319 CUL7Q14999 1698 aa42.48■■■■■ 4.39
TRIOBP-205ENST00000407319 GRIN2BQ13224 1484 aa42.48■■■■■ 4.39
TRIOBP-205ENST00000407319 CEP162Q5TB80 1403 aa42.42■■■■■ 4.38
TRIOBP-205ENST00000407319 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
TRIOBP-205ENST00000407319 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.35■■■■■ 4.37
TRIOBP-205ENST00000407319 ADAMTS12P58397 1594 aa42.34■■■■■ 4.37
TRIOBP-205ENST00000407319 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.23■■■■■ 4.35
TRIOBP-205ENST00000407319 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
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