RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371871.8

CMPK1-202, Transcript of cytidine/uridine monophosphate kinase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CMPK1, Length 1,212 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1-202ENST00000371871 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.34■■■■■ 6.61
CMPK1-202ENST00000371871 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.47■■■■■ 5.67
CMPK1-202ENST00000371871 ABCC9O60706 1549 aa50.39■■■■■ 5.66
CMPK1-202ENST00000371871 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48■■■■■ 5.27
CMPK1-202ENST00000371871 NACADO15069 1562 aa47.69■■■■■ 5.22
CMPK1-202ENST00000371871 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.67■■■■■ 5.22
CMPK1-202ENST00000371871 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.1■■■■■ 5.13
CMPK1-202ENST00000371871 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.02■■■■■ 5.12
CMPK1-202ENST00000371871 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.97■■■■■ 5.11
CMPK1-202ENST00000371871 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.94■■■■■ 5.11
CMPK1-202ENST00000371871 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
CMPK1-202ENST00000371871 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.56■■■■■ 5.04
CMPK1-202ENST00000371871 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.49■■■■■ 5.03
CMPK1-202ENST00000371871 SCRIBQ14160 1630 aa46.06■■■■■ 4.96
CMPK1-202ENST00000371871 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.88■■■■■ 4.94
CMPK1-202ENST00000371871 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.51■■■■■ 4.88
CMPK1-202ENST00000371871 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
CMPK1-202ENST00000371871 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.35■■■■■ 4.85
CMPK1-202ENST00000371871 NCAPD3P42695 1498 aa44.01■■■■■ 4.64
CMPK1-202ENST00000371871 SMARCA4P51532 1647 aa43.93■■■■■ 4.62
CMPK1-202ENST00000371871 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.92■■■■■ 4.62
CMPK1-202ENST00000371871 SMARCA2P51531 1590 aa43.8■■■■■ 4.6
CMPK1-202ENST00000371871 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
CMPK1-202ENST00000371871 HMGXB3Q12766 1538 aa43.68■■■■■ 4.58
CMPK1-202ENST00000371871 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
CMPK1-202ENST00000371871 ERCC6Q03468 1493 aa43.5■■■■■ 4.55
CMPK1-202ENST00000371871 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.45■■■■■ 4.55
CMPK1-202ENST00000371871 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.43■■■■■ 4.54
CMPK1-202ENST00000371871 NESP48681 1621 aa43.32■■■■■ 4.53
CMPK1-202ENST00000371871 CUX2O14529 1486 aa43.29■■■■■ 4.52
CMPK1-202ENST00000371871 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.12■■■■■ 4.49
CMPK1-202ENST00000371871 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.01■■■■■ 4.48
CMPK1-202ENST00000371871 WIZO95785 1651 aa42.96■■■■■ 4.47
CMPK1-202ENST00000371871 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
CMPK1-202ENST00000371871 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.79■■■■■ 4.44
CMPK1-202ENST00000371871 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.78■■■■■ 4.44
CMPK1-202ENST00000371871 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.71■■■■■ 4.43
CMPK1-202ENST00000371871 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
CMPK1-202ENST00000371871 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.39■■■■■ 4.38
CMPK1-202ENST00000371871 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
CMPK1-202ENST00000371871 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.27■■■■■ 4.36
CMPK1-202ENST00000371871 WDR62O43379 1518 aa42.25■■■■■ 4.35
CMPK1-202ENST00000371871 CFTRP13569 1480 aa42.23■■■■■ 4.35
CMPK1-202ENST00000371871 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.23■■■■■ 4.35
CMPK1-202ENST00000371871 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.93■■■■■ 4.3
CMPK1-202ENST00000371871 PRDM2Q13029 1718 aa41.88■■■■■ 4.29
CMPK1-202ENST00000371871 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
CMPK1-202ENST00000371871 TOPBP1Q92547 1522 aa41.45■■■■■ 4.23
CMPK1-202ENST00000371871 OSCARQ8IYS5 282 aa41.43■■■■■ 4.22
CMPK1-202ENST00000371871 TRIM41Q8WV44 630 aa41.41■■■■■ 4.22
CMPK1-202ENST00000371871 IFT140Q96RY7 1462 aa41.4■■■■■ 4.22
CMPK1-202ENST00000371871 ABCC8Q09428 1581 aa41.37■■■■■ 4.21
CMPK1-202ENST00000371871 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
CMPK1-202ENST00000371871 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.31■■■■■ 4.2
CMPK1-202ENST00000371871 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
CMPK1-202ENST00000371871 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
CMPK1-202ENST00000371871 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
CMPK1-202ENST00000371871 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.16
CMPK1-202ENST00000371871 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
CMPK1-202ENST00000371871 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.91■■■■■ 4.14
CMPK1-202ENST00000371871 SOGA1O94964 1423 aa40.89■■■■■ 4.14
CMPK1-202ENST00000371871 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.83■■■■■ 4.13
CMPK1-202ENST00000371871 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.83■■■■■ 4.13
CMPK1-202ENST00000371871 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.83■■■■■ 4.13
CMPK1-202ENST00000371871 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.82■■■■■ 4.12
CMPK1-202ENST00000371871 CHD1O14646 1710 aa40.81■■■■■ 4.12
CMPK1-202ENST00000371871 CUX1P39880 1505 aa40.79■■■■■ 4.12
CMPK1-202ENST00000371871 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
CMPK1-202ENST00000371871 FBLN2P98095 1184 aa40.79■■■■■ 4.12
CMPK1-202ENST00000371871 ARHGEF11O15085 1522 aa40.7■■■■■ 4.11
CMPK1-202ENST00000371871 WDR97A6NE52 1622 aa40.62■■■■■ 4.09
CMPK1-202ENST00000371871 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.58■■■■■ 4.09
CMPK1-202ENST00000371871 GRIN2BQ13224 1484 aa40.48■■■■■ 4.07
CMPK1-202ENST00000371871 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.48■■■■■ 4.07
CMPK1-202ENST00000371871 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
CMPK1-202ENST00000371871 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
CMPK1-202ENST00000371871 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.38■■■■■ 4.05
CMPK1-202ENST00000371871 PBRM1Q86U86 1689 aa40.37■■■■■ 4.05
CMPK1-202ENST00000371871 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.33■■■■■ 4.05
CMPK1-202ENST00000371871 SYNJ2O15056 1496 aa40.32■■■■■ 4.05
CMPK1-202ENST00000371871 SYNJ1O43426 1573 aa40.31■■■■■ 4.04
CMPK1-202ENST00000371871 ARAP1Q96P48 1450 aa40.31■■■■■ 4.04
CMPK1-202ENST00000371871 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.27■■■■■ 4.04
CMPK1-202ENST00000371871 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.26■■■■■ 4.04
CMPK1-202ENST00000371871 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.24■■■■■ 4.03
CMPK1-202ENST00000371871 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.19■■■■■ 4.02
CMPK1-202ENST00000371871 TOP2BQ02880 1626 aa40.18■■■■■ 4.02
CMPK1-202ENST00000371871 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
CMPK1-202ENST00000371871 GRIN2AQ12879 1464 aa39.95■■■■□ 3.99
CMPK1-202ENST00000371871 ADAMTS12P58397 1594 aa39.94■■■■□ 3.98
CMPK1-202ENST00000371871 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.86■■■■□ 3.97
CMPK1-202ENST00000371871 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.84■■■■□ 3.97
CMPK1-202ENST00000371871 CEP170Q5SW79 1584 aa39.81■■■■□ 3.96
CMPK1-202ENST00000371871 NUP160Q12769 1436 aa39.79■■■■□ 3.96
CMPK1-202ENST00000371871 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.71■■■■□ 3.95
CMPK1-202ENST00000371871 SHROOM2Q13796 1616 aa39.6■■■■□ 3.93
CMPK1-202ENST00000371871 JPH4Q96JJ6 628 aa39.47■■■■□ 3.91
CMPK1-202ENST00000371871 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
CMPK1-202ENST00000371871 KIF27Q86VH2 1401 aa39.43■■■■□ 3.9
CMPK1-202ENST00000371871 IGF1RP08069 1367 aa39.39■■■■□ 3.9
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