RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POTEDQ86YR6 584 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHIC1Q5VXU3 224 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MSH5O43196 834 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXD1Q16676 465 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POTEHQ6S545 545 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF39Q9H2S5 420 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DMRT2Q9Y5R5 561 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP6R1Q9UPN7 881 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADRA2BP18089 450 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DCAF8L1A6NGE4 600 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LHX8Q68G74 356 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHRDL2Q6WN34 429 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNAJC5BQ9UF47 199 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLPPR3Q6T4P5 718 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DSG3P32926 999 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HAX1O00165 279 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POTEMA6NI47 508 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POTEGQ6S5H5 508 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CAPN15O75808 1086 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EVX2Q03828 476 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PIP4P2Q8N4L2 257 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GABBR2O75899 941 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABCB7O75027 752 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OTUD5Q96G74 571 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POTEIP0CG38 1075 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AKT1S1Q96B36 256 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1079P-201ENST00000362861 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C19orf67A6NJJ6 358 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRHP20396 242 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MMRN1Q13201 1228 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1079P-201ENST00000362861 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDAN1Q8IWY9 1227 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PITPNM1O00562 1244 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1079P-201ENST00000362861 APLP2Q06481 763 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DCBLD2Q96PD2 775 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POTEB2H3BUK9 544 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPNS2Q8IVW8 549 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLCN6P51797 869 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAMSTRQ6ZN01 415 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCUBE2Q9NQ36 999 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POLA2Q14181 598 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD44P16070 742 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POTEJP0CG39 1038 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OSCARQ8IYS5 282 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 METRNQ9UJH8 293 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ST18O60284 1047 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLEC11AQ9Y240 323 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C7P10643 843 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHADLQ6NUI6 762 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC39A7Q92504 469 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZRANB1Q9UGI0 708 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MARVELD3Q96A59 401 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC4A2P04920 1241 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRR29P0C7W0 189 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPDYE2BA6NHP3 402 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPDYE6P0CI01 402 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPDYE2Q495Y8 402 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLAIN1Q8ND83 568 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
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