RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288071.10

DDX19B-201, Transcript of DEAD-box helicase 19B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX19B, Length 3,386 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX19B-201ENST00000288071 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.07■□□□□ 0.8
DDX19B-201ENST00000288071 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.87■□□□□ 0.45
DDX19B-201ENST00000288071 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
DDX19B-201ENST00000288071 HRCP23327 699 aa17.72■□□□□ 0.43
DDX19B-201ENST00000288071 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.55■□□□□ 0.4
DDX19B-201ENST00000288071 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
DDX19B-201ENST00000288071 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.48■□□□□ 0.39
DDX19B-201ENST00000288071 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.36■□□□□ 0.37
DDX19B-201ENST00000288071 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.19■□□□□ 0.34
DDX19B-201ENST00000288071 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
DDX19B-201ENST00000288071 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.04■□□□□ 0.32
DDX19B-201ENST00000288071 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.96■□□□□ 0.31
DDX19B-201ENST00000288071 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.83■□□□□ 0.29
DDX19B-201ENST00000288071 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
DDX19B-201ENST00000288071 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
DDX19B-201ENST00000288071 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
DDX19B-201ENST00000288071 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
DDX19B-201ENST00000288071 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.44■□□□□ 0.22
DDX19B-201ENST00000288071 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
DDX19B-201ENST00000288071 NEUROD1Q13562 356 aa16.36■□□□□ 0.21
DDX19B-201ENST00000288071 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
DDX19B-201ENST00000288071 TRIM41Q8WV44 630 aa16.32■□□□□ 0.2
DDX19B-201ENST00000288071 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
DDX19B-201ENST00000288071 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.23■□□□□ 0.19
DDX19B-201ENST00000288071 ABCC9O60706 1549 aa16.21■□□□□ 0.19
DDX19B-201ENST00000288071 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
DDX19B-201ENST00000288071 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.15■□□□□ 0.18
DDX19B-201ENST00000288071 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
DDX19B-201ENST00000288071 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
DDX19B-201ENST00000288071 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
DDX19B-201ENST00000288071 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
DDX19B-201ENST00000288071 SCRIBQ14160 1630 aa16■□□□□ 0.15
DDX19B-201ENST00000288071 MYT1Q01538 1121 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX19B-201ENST00000288071 NACADO15069 1562 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX19B-201ENST00000288071 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
DDX19B-201ENST00000288071 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.8■□□□□ 0.12
DDX19B-201ENST00000288071 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
DDX19B-201ENST00000288071 MIER1Q8N108 512 aa15.76■□□□□ 0.11
DDX19B-201ENST00000288071 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.74■□□□□ 0.11
DDX19B-201ENST00000288071 WIZO95785 1651 aa15.72■□□□□ 0.11
DDX19B-201ENST00000288071 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
DDX19B-201ENST00000288071 CEP162Q5TB80 1403 aa15.66■□□□□ 0.1
DDX19B-201ENST00000288071 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
DDX19B-201ENST00000288071 ABCC8Q09428 1581 aa15.62■□□□□ 0.09
DDX19B-201ENST00000288071 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX19B-201ENST00000288071 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
DDX19B-201ENST00000288071 SOGA1O94964 1423 aa15.56■□□□□ 0.08
DDX19B-201ENST00000288071 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
DDX19B-201ENST00000288071 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.5■□□□□ 0.07
DDX19B-201ENST00000288071 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
DDX19B-201ENST00000288071 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.5■□□□□ 0.07
DDX19B-201ENST00000288071 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.46■□□□□ 0.07
DDX19B-201ENST00000288071 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
DDX19B-201ENST00000288071 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.42■□□□□ 0.06
DDX19B-201ENST00000288071 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.38■□□□□ 0.05
DDX19B-201ENST00000288071 GOLGA3Q08378 1498 aa15.32■□□□□ 0.04
DDX19B-201ENST00000288071 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.31■□□□□ 0.04
DDX19B-201ENST00000288071 SMARCA2P51531 1590 aa15.31■□□□□ 0.04
DDX19B-201ENST00000288071 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
DDX19B-201ENST00000288071 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.3■□□□□ 0.04
DDX19B-201ENST00000288071 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
DDX19B-201ENST00000288071 EEA1Q15075 1411 aa15.26■□□□□ 0.03
DDX19B-201ENST00000288071 KCNH8Q96L42 1107 aa15.25■□□□□ 0.03
DDX19B-201ENST00000288071 BCL11AQ9H165 835 aa15.25■□□□□ 0.03
DDX19B-201ENST00000288071 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
DDX19B-201ENST00000288071 CLIP1P30622 1438 aa15.23■□□□□ 0.03
DDX19B-201ENST00000288071 BCANQ96GW7 911 aa15.22■□□□□ 0.03
DDX19B-201ENST00000288071 SMARCA4P51532 1647 aa15.21■□□□□ 0.03
DDX19B-201ENST00000288071 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.21■□□□□ 0.02
DDX19B-201ENST00000288071 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
DDX19B-201ENST00000288071 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.19■□□□□ 0.02
DDX19B-201ENST00000288071 APLP2Q06481 763 aa15.17■□□□□ 0.02
DDX19B-201ENST00000288071 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.15■□□□□ 0.02
DDX19B-201ENST00000288071 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.12■□□□□ 0.01
DDX19B-201ENST00000288071 KIF21BO75037 1637 aa15.11■□□□□ 0.01
DDX19B-201ENST00000288071 SYNJ1O43426 1573 aa15.11■□□□□ 0.01
DDX19B-201ENST00000288071 FKBP8Q14318 412 aa15.08■□□□□ 0
DDX19B-201ENST00000288071 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
DDX19B-201ENST00000288071 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.01□□□□□ -0.01
DDX19B-201ENST00000288071 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
DDX19B-201ENST00000288071 ITGAEP38570 1179 aa15□□□□□ -0.01
DDX19B-201ENST00000288071 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
DDX19B-201ENST00000288071 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
DDX19B-201ENST00000288071 ARAP1Q96P48 1450 aa14.95□□□□□ -0.02
DDX19B-201ENST00000288071 MSH5O43196 834 aa14.93□□□□□ -0.02
DDX19B-201ENST00000288071 TRIM52Q96A61 297 aa14.92□□□□□ -0.02
DDX19B-201ENST00000288071 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.92□□□□□ -0.02
DDX19B-201ENST00000288071 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
DDX19B-201ENST00000288071 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
DDX19B-201ENST00000288071 MAPKBP1O60336 1514 aa14.88□□□□□ -0.03
DDX19B-201ENST00000288071 CUX2O14529 1486 aa14.86□□□□□ -0.03
DDX19B-201ENST00000288071 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.86□□□□□ -0.03
DDX19B-201ENST00000288071 WDR97A6NE52 1622 aa14.86□□□□□ -0.03
DDX19B-201ENST00000288071 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.85□□□□□ -0.03
DDX19B-201ENST00000288071 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.85□□□□□ -0.03
DDX19B-201ENST00000288071 NEFLP07196 543 aa14.84□□□□□ -0.03
DDX19B-201ENST00000288071 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
DDX19B-201ENST00000288071 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
DDX19B-201ENST00000288071 PRXQ9BXM0 1461 aa14.78□□□□□ -0.04
DDX19B-201ENST00000288071 TOP2BQ02880 1626 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms